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(0) root (0) 56706 2023-02-19 00:50:57.000000 ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/user-guide/combining.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 125736 2023-02-19 00:50:57.000000 ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/user-guide/computation.html │ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 74544 2023-02-19 00:50:57.000000 ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/user-guide/dask.html │ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 74545 2023-02-19 00:50:57.000000 ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/user-guide/dask.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 98802 2023-02-19 00:50:57.000000 ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/user-guide/data-structures.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 15231 2023-02-19 00:50:57.000000 ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/user-guide/duckarrays.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 37489 2023-02-19 00:50:57.000000 ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/user-guide/groupby.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 7597 2023-02-19 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│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ -Error in callback <function _draw_all_if_interactive at 0xffff59c779c0> (for post_execute):
│ │ │ │ +Error in callback <function _draw_all_if_interactive at 0xffff618eb9c0> (for post_execute):
│ │ │ │  
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ ├── html2text {}
│ │ │ │ │ @@ -98,15 +98,15 @@
│ │ │ │ │  ----> 7 plot = ds.t2m[0].plot(
│ │ │ │ │        8     cmap=plt.cm.coolwarm, transform=ccrs.PlateCarree(), cbar_kwargs=
│ │ │ │ │  {"shrink": 0.6}
│ │ │ │ │        9 )
│ │ │ │ │       10 plt.title("ERA5 - 2m temperature British Isles March 2019")
│ │ │ │ │  
│ │ │ │ │  NameError: name 'ds' is not defined
│ │ │ │ │ -Error in callback  (for
│ │ │ │ │ +Error in callback  (for
│ │ │ │ │  post_execute):
│ │ │ │ │  ---------------------------------------------------------------------------
│ │ │ │ │  PermissionError                           Traceback (most recent call last)
│ │ │ │ │  File /usr/lib/python3/dist-packages/matplotlib/pyplot.py:119, in
│ │ │ │ │  _draw_all_if_interactive()
│ │ │ │ │      117 def _draw_all_if_interactive():
│ │ │ │ │      118     if matplotlib.is_interactive():
│ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/examples/ERA5-GRIB-example.ipynb.gz
│ │ │ │ ├── ERA5-GRIB-example.ipynb
│ │ │ │ │ ├── Pretty-printed
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│ │ │ │ │ │                  {
│ │ │ │ │ │                      "ename": "ImportError",
│ │ │ │ │ │                      "evalue": "tutorial.open_dataset depends on pooch to download and manage datasets. To proceed please install pooch.",
│ │ │ │ │ │                      "output_type": "error",
│ │ │ │ │ │ @@ -88,18 +88,18 @@
│ │ │ │ │ │              ]
│ │ │ │ │ │          },
│ │ │ │ │ │          {
│ │ │ │ │ │              "cell_type": "code",
│ │ │ │ │ │              "execution_count": 3,
│ │ │ │ │ │              "metadata": {
│ │ │ │ │ │                  "execution": {
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:14:08.256241Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:14:08.255931Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:14:08.292471Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:14:08.291661Z"
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:26:05.939423Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:26:05.939157Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:26:05.995128Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:26:05.994433Z"
│ │ │ │ │ │                  }
│ │ │ │ │ │              },
│ │ │ │ │ │              "outputs": [
│ │ │ │ │ │                  {
│ │ │ │ │ │                      "ename": "NameError",
│ │ │ │ │ │                      "evalue": "name 'ds' is not defined",
│ │ │ │ │ │                      "output_type": "error",
│ │ │ │ │ │ @@ -124,18 +124,18 @@
│ │ │ │ │ │              ]
│ │ │ │ │ │          },
│ │ │ │ │ │          {
│ │ │ │ │ │              "cell_type": "code",
│ │ │ │ │ │              "execution_count": 4,
│ │ │ │ │ │              "metadata": {
│ │ │ │ │ │                  "execution": {
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:14:08.296332Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:14:08.296059Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:14:11.393951Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:14:11.393003Z"
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:26:06.003507Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:26:06.003228Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:26:12.718499Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:26:12.710458Z"
│ │ │ │ │ │                  }
│ │ │ │ │ │              },
│ │ │ │ │ │              "outputs": [
│ │ │ │ │ │                  {
│ │ │ │ │ │                      "ename": "NameError",
│ │ │ │ │ │                      "evalue": "name 'ds' is not defined",
│ │ │ │ │ │                      "output_type": "error",
│ │ │ │ │ │ @@ -146,15 +146,15 @@
│ │ │ │ │ │                          "\u001b[0;31mNameError\u001b[0m: name 'ds' is not defined"
│ │ │ │ │ │                      ]
│ │ │ │ │ │                  },
│ │ │ │ │ │                  {
│ │ │ │ │ │                      "name": "stdout",
│ │ │ │ │ │                      "output_type": "stream",
│ │ │ │ │ │                      "text": [
│ │ │ │ │ │ -                        "Error in callback  (for post_execute):\n"
│ │ │ │ │ │ +                        "Error in callback  (for post_execute):\n"
│ │ │ │ │ │                      ]
│ │ │ │ │ │                  },
│ │ │ │ │ │                  {
│ │ │ │ │ │                      "ename": "PermissionError",
│ │ │ │ │ │                      "evalue": "[Errno 13] Permission denied: '/nonexistent'",
│ │ │ │ │ │                      "output_type": "error",
│ │ │ │ │ │                      "traceback": [
│ │ │ │ │ │ @@ -255,18 +255,18 @@
│ │ │ │ │ │              ]
│ │ │ │ │ │          },
│ │ │ │ │ │          {
│ │ │ │ │ │              "cell_type": "code",
│ │ │ │ │ │              "execution_count": 5,
│ │ │ │ │ │              "metadata": {
│ │ │ │ │ │                  "execution": {
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:14:11.398058Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:14:11.397775Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:14:11.425781Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:14:11.424998Z"
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:26:12.727529Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:26:12.727233Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:26:12.799220Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:26:12.798431Z"
│ │ │ │ │ │                  }
│ │ │ │ │ │              },
│ │ │ │ │ │              "outputs": [
│ │ │ │ │ │                  {
│ │ │ │ │ │                      "ename": "NameError",
│ │ │ │ │ │                      "evalue": "name 'ds' is not defined",
│ │ │ │ │ │                      "output_type": "error",
│ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/examples/ROMS_ocean_model.ipynb.gz
│ │ │ │ ├── ROMS_ocean_model.ipynb
│ │ │ │ │ ├── Pretty-printed
│ │ │ │ │ │┄ Similarity: 0.9988051470588235%
│ │ │ │ │ │┄ Differences: {"'cells'": "{2: {'metadata': {'execution': {'iopub.execute_input': '2024-01-08T11:26:20.594000Z', "
│ │ │ │ │ │┄             "'iopub.status.busy': '2024-01-08T11:26:20.593670Z', 'iopub.status.idle': "
│ │ │ │ │ │┄             "'2024-01-08T11:26:24.502509Z', 'shell.execute_reply': "
│ │ │ │ │ │┄             "'2024-01-08T11:26:24.494464Z'}}}, 5: {'metadata': {'execution': "
│ │ │ │ │ │┄             "{'iopub.execute_input': '2024-01-08T11:26:24.511712Z', 'iopub.status.busy': "
│ │ │ │ │ │┄             "'2024-01-08T11:26:24.511251Z', 'iopub.status.idle': '2024-01-08T11:26:2 […]
│ │ │ │ │ │ @@ -17,18 +17,18 @@
│ │ │ │ │ │              ]
│ │ │ │ │ │          },
│ │ │ │ │ │          {
│ │ │ │ │ │              "cell_type": "code",
│ │ │ │ │ │              "execution_count": 1,
│ │ │ │ │ │              "metadata": {
│ │ │ │ │ │                  "execution": {
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:14:19.808398Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:14:19.808080Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:14:22.377757Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:14:22.377007Z"
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:26:20.594000Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:26:20.593670Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:26:24.502509Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:26:24.494464Z"
│ │ │ │ │ │                  }
│ │ │ │ │ │              },
│ │ │ │ │ │              "outputs": [],
│ │ │ │ │ │              "source": [
│ │ │ │ │ │                  "import numpy as np\n",
│ │ │ │ │ │                  "import cartopy.crs as ccrs\n",
│ │ │ │ │ │                  "import cartopy.feature as cfeature\n",
│ │ │ │ │ │ @@ -75,18 +75,18 @@
│ │ │ │ │ │              ]
│ │ │ │ │ │          },
│ │ │ │ │ │          {
│ │ │ │ │ │              "cell_type": "code",
│ │ │ │ │ │              "execution_count": 2,
│ │ │ │ │ │              "metadata": {
│ │ │ │ │ │                  "execution": {
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:14:22.386237Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:14:22.385805Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:14:22.822902Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:14:22.820995Z"
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:26:24.511712Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:26:24.511251Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:26:25.111336Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:26:25.110469Z"
│ │ │ │ │ │                  }
│ │ │ │ │ │              },
│ │ │ │ │ │              "outputs": [
│ │ │ │ │ │                  {
│ │ │ │ │ │                      "ename": "ImportError",
│ │ │ │ │ │                      "evalue": "tutorial.open_dataset depends on pooch to download and manage datasets. To proceed please install pooch.",
│ │ │ │ │ │                      "output_type": "error",
│ │ │ │ │ │ @@ -130,18 +130,18 @@
│ │ │ │ │ │              ]
│ │ │ │ │ │          },
│ │ │ │ │ │          {
│ │ │ │ │ │              "cell_type": "code",
│ │ │ │ │ │              "execution_count": 3,
│ │ │ │ │ │              "metadata": {
│ │ │ │ │ │                  "execution": {
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:14:22.826358Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:14:22.826089Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:14:22.861746Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:14:22.860993Z"
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:26:25.119637Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:26:25.119352Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:26:25.179251Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:26:25.178465Z"
│ │ │ │ │ │                  }
│ │ │ │ │ │              },
│ │ │ │ │ │              "outputs": [
│ │ │ │ │ │                  {
│ │ │ │ │ │                      "ename": "NameError",
│ │ │ │ │ │                      "evalue": "name 'ds' is not defined",
│ │ │ │ │ │                      "output_type": "error",
│ │ │ │ │ │ @@ -175,18 +175,18 @@
│ │ │ │ │ │              ]
│ │ │ │ │ │          },
│ │ │ │ │ │          {
│ │ │ │ │ │              "cell_type": "code",
│ │ │ │ │ │              "execution_count": 4,
│ │ │ │ │ │              "metadata": {
│ │ │ │ │ │                  "execution": {
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:14:22.865355Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:14:22.865087Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:14:22.893754Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:14:22.893005Z"
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:26:25.187640Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:26:25.187359Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:26:25.231268Z",
│ │ │ │ │ │ +                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:26:25.230474Z"
│ │ │ │ │ │                  },
│ │ │ │ │ │                  "scrolled": false
│ │ │ │ │ │              },
│ │ │ │ │ │              "outputs": [
│ │ │ │ │ │                  {
│ │ │ │ │ │                      "ename": "NameError",
│ │ │ │ │ │                      "evalue": "name 'ds' is not defined",
│ │ │ │ │ │ @@ -211,18 +211,18 @@
│ │ │ │ │ │              ]
│ │ │ │ │ │          },
│ │ │ │ │ │          {
│ │ │ │ │ │              "cell_type": "code",
│ │ │ │ │ │              "execution_count": 5,
│ │ │ │ │ │              "metadata": {
│ │ │ │ │ │                  "execution": {
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:14:22.897434Z",
│ │ │ │ │ │ -                    "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:14:22.897163Z",
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│ │ │ │ │ │ -                    "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:14:22.932994Z"
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│ │ │ │ │ │ @@ -250,18 +250,18 @@
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│ │ │ │ │ │          {
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│ │ │ │ │ │          {
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│ │ │ │ ├── apply_ufunc_vectorize_1d.ipynb
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│ │ │ │ │ │┄ Similarity: 0.9994283536585367%
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│ │ │ │ │ │┄             "'iopub.status.busy': '2024-01-08T11:26:34.069253Z', 'iopub.status.idle': "
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│ │ │ │ │ │┄             "{'iopub.execute_input': '2024-01-08T11:26:36.899463Z', 'iopub.status.busy': "
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│ │ │ │ │ │ @@ -36,18 +36,18 @@
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│ │ │ │ │ │                      "output_type": "error",
│ │ │ │ │ │ @@ -91,18 +91,18 @@
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│ │ │ │ │ │ @@ -131,18 +131,18 @@
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│ │ │ │ │ │              "outputs": [
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│ │ │ │ │ │              },
│ │ │ │ │ │              "outputs": [
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│ │ │ │ │ │ @@ -492,18 +492,18 @@
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│ │ │ │ │ │ @@ -565,18 +565,18 @@
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│ │ │ │ │ │ @@ -622,18 +622,18 @@
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│ │ │ │ │ │              },
│ │ │ │ │ │              "outputs": [
│ │ │ │ │ │                  {
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│ │ │ │ │ │ @@ -710,18 +710,18 @@
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│ │ │ │ │ │              },
│ │ │ │ │ │              "outputs": [
│ │ │ │ │ │                  {
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│ │ │ │ │ │ @@ -796,18 +796,18 @@
│ │ │ │ │ │              "execution_count": 13,
│ │ │ │ │ │              "metadata": {
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│ │ │ │ │ │                  "execution": {
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│ │ │ │ │ │                  }
│ │ │ │ │ │              },
│ │ │ │ │ │              "outputs": [
│ │ │ │ │ │                  {
│ │ │ │ │ │                      "ename": "ModuleNotFoundError",
│ │ │ │ │ │                      "evalue": "No module named 'numba'",
│ │ │ │ │ │                      "output_type": "error",
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│ │ │ │ │ │┄             "{'iopub.execute_input': '2024-01-08T11:27:16.021155Z', 'iopub.status.busy': "
│ │ │ │ │ │┄             "'2024-01-08T11:27:16.020634Z', 'iopub.status.idle': '2024-01-08T11:27:1 […]
│ │ │ │ │ │ @@ -19,18 +19,18 @@
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│ │ │ │ │ │                  }
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│ │ │ │ │ │ @@ -202,18 +202,18 @@
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│ │ │ │ │ │              "source": [
│ │ │ │ │ │                  "# Wrap it into a simple function\n",
│ │ │ │ │ │                  "def season_mean(ds, calendar=\"standard\"):\n",
│ │ │ │ │ │                  "    # Make a DataArray with the number of days in each month, size = len(time)\n",
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│ │ │ │ ├── multidimensional-coords.ipynb
│ │ │ │ │ ├── Pretty-printed
│ │ │ │ │ │┄ Similarity: 0.99931640625%
│ │ │ │ │ │┄ Differences: {"'cells'": "{1: {'metadata': {'execution': {'iopub.execute_input': '2024-01-08T11:27:23.775596Z', "
│ │ │ │ │ │┄             "'iopub.status.busy': '2024-01-08T11:27:23.775280Z', 'iopub.status.idle': "
│ │ │ │ │ │┄             "'2024-01-08T11:27:26.387363Z', 'shell.execute_reply': "
│ │ │ │ │ │┄             "'2024-01-08T11:27:26.386644Z'}}}, 3: {'metadata': {'execution': "
│ │ │ │ │ │┄             "{'iopub.execute_input': '2024-01-08T11:27:26.395627Z', 'iopub.status.busy': "
│ │ │ │ │ │┄             "'2024-01-08T11:27:26.395207Z', 'iopub.status.idle': '2024-01-08T11:27:2 […]
│ │ │ │ │ │ @@ -16,18 +16,18 @@
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│ │ │ │ │ │              "source": [
│ │ │ │ │ │                  "%matplotlib inline\n",
│ │ │ │ │ │                  "import numpy as np\n",
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│ │ │ │ │ │ @@ -48,18 +48,18 @@
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│ │ │ │ │ │ @@ -93,18 +93,18 @@
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│ │ │ │ │ │              "outputs": [
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│ │ │ │ │ │              },
│ │ │ │ │ │              "outputs": [
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│ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/examples/visualization_gallery.html
│ │ │ │ @@ -574,15 +574,15 @@
│ │ │ │  
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│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ -/tmp/ipykernel_1525232/2946363816.py:1: DeprecationWarning: open_rasterio is Deprecated in favor of rioxarray. For information about transitioning, see: https://corteva.github.io/rioxarray/stable/getting_started/getting_started.html
│ │ │ │ +/tmp/ipykernel_3179774/2946363816.py:1: DeprecationWarning: open_rasterio is Deprecated in favor of rioxarray. For information about transitioning, see: https://corteva.github.io/rioxarray/stable/getting_started/getting_started.html
│ │ │ │    da = xr.tutorial.open_rasterio("RGB.byte")
│ │ │ │  
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ @@ -657,15 +657,15 @@ │ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ -/tmp/ipykernel_1525232/3653941964.py:4: DeprecationWarning: open_rasterio is Deprecated in favor of rioxarray. For information about transitioning, see: https://corteva.github.io/rioxarray/stable/getting_started/getting_started.html
│ │ │ │ +/tmp/ipykernel_3179774/3653941964.py:4: DeprecationWarning: open_rasterio is Deprecated in favor of rioxarray. For information about transitioning, see: https://corteva.github.io/rioxarray/stable/getting_started/getting_started.html
│ │ │ │    da = xr.tutorial.open_rasterio("RGB.byte")
│ │ │ │  
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -210,15 +210,15 @@ │ │ │ │ │ # https://github.com/SciTools/cartopy/issues/813 is implemented │ │ │ │ │ crs = ccrs.UTM("18") │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ # Plot on a map │ │ │ │ │ ax = plt.subplot(projection=crs) │ │ │ │ │ da.plot.imshow(ax=ax, rgb="band", transform=crs) │ │ │ │ │ ax.coastlines("10m", color="r") │ │ │ │ │ -/tmp/ipykernel_1525232/2946363816.py:1: DeprecationWarning: open_rasterio is │ │ │ │ │ +/tmp/ipykernel_3179774/2946363816.py:1: DeprecationWarning: open_rasterio is │ │ │ │ │ Deprecated in favor of rioxarray. For information about transitioning, see: │ │ │ │ │ https://corteva.github.io/rioxarray/stable/getting_started/getting_started.html │ │ │ │ │ da = xr.tutorial.open_rasterio("RGB.byte") │ │ │ │ │ --------------------------------------------------------------------------- │ │ │ │ │ ModuleNotFoundError Traceback (most recent call last) │ │ │ │ │ File /build/reproducible-path/python-xarray-2023.01.0/xarray/tutorial.py:222, │ │ │ │ │ in open_rasterio(name, engine, cache, cache_dir, **kws) │ │ │ │ │ @@ -282,15 +282,15 @@ │ │ │ │ │ y="lat", │ │ │ │ │ transform=ccrs.PlateCarree(), │ │ │ │ │ cmap="Greys_r", │ │ │ │ │ shading="auto", │ │ │ │ │ add_colorbar=False, │ │ │ │ │ ) │ │ │ │ │ ax.coastlines("10m", color="r") │ │ │ │ │ -/tmp/ipykernel_1525232/3653941964.py:4: DeprecationWarning: open_rasterio is │ │ │ │ │ +/tmp/ipykernel_3179774/3653941964.py:4: DeprecationWarning: open_rasterio is │ │ │ │ │ Deprecated in favor of rioxarray. For information about transitioning, see: │ │ │ │ │ https://corteva.github.io/rioxarray/stable/getting_started/getting_started.html │ │ │ │ │ da = xr.tutorial.open_rasterio("RGB.byte") │ │ │ │ │ --------------------------------------------------------------------------- │ │ │ │ │ ModuleNotFoundError Traceback (most recent call last) │ │ │ │ │ File /build/reproducible-path/python-xarray-2023.01.0/xarray/tutorial.py:222, │ │ │ │ │ in open_rasterio(name, engine, cache, cache_dir, **kws) │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/examples/visualization_gallery.ipynb.gz │ │ │ │ ├── visualization_gallery.ipynb │ │ │ │ │ ├── Pretty-printed │ │ │ │ │ │┄ Similarity: 0.9983506944444445% │ │ │ │ │ │┄ Differences: {"'cells'": "{1: {'metadata': {'execution': {'iopub.execute_input': '2024-01-08T11:27:34.583456Z', " │ │ │ │ │ │┄ "'iopub.status.busy': '2024-01-08T11:27:34.583160Z', 'iopub.status.idle': " │ │ │ │ │ │┄ "'2024-01-08T11:27:36.858459Z', 'shell.execute_reply': " │ │ │ │ │ │┄ "'2024-01-08T11:27:36.842469Z'}}}, 3: {'metadata': {'execution': " │ │ │ │ │ │┄ "{'iopub.execute_input': '2024-01-08T11:27:36.867599Z', 'iopub.status.busy': " │ │ │ │ │ │┄ "'2024-01-08T11:27:36.867180Z', 'iopub.status.idle': '2024-01-08T11:27:3 […] │ │ │ │ │ │ @@ -10,18 +10,18 @@ │ │ │ │ │ │ ] │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "cell_type": "code", │ │ │ │ │ │ "execution_count": 1, │ │ │ │ │ │ "metadata": { │ │ │ │ │ │ "execution": { │ │ │ │ │ │ - "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:15:14.266116Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:15:14.265799Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:15:16.185926Z", │ │ │ │ │ │ - "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:15:16.185124Z" │ │ │ │ │ │ + "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:27:34.583456Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:27:34.583160Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:27:36.858459Z", │ │ │ │ │ │ + "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:27:36.842469Z" │ │ │ │ │ │ } │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ "outputs": [], │ │ │ │ │ │ "source": [ │ │ │ │ │ │ "import cartopy.crs as ccrs\n", │ │ │ │ │ │ "import matplotlib.pyplot as plt\n", │ │ │ │ │ │ "import xarray as xr\n", │ │ │ │ │ │ @@ -37,18 +37,18 @@ │ │ │ │ │ │ ] │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "cell_type": "code", │ │ │ │ │ │ "execution_count": 2, │ │ │ │ │ │ "metadata": { │ │ │ │ │ │ "execution": { │ │ │ │ │ │ - "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:15:16.202280Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:15:16.201820Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:15:16.377894Z", │ │ │ │ │ │ - "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:15:16.377036Z" │ │ │ │ │ │ + "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:27:36.867599Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:27:36.867180Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:27:37.242478Z", │ │ │ │ │ │ + "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:27:37.226428Z" │ │ │ │ │ │ } │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ "outputs": [ │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "ename": "ImportError", │ │ │ │ │ │ "evalue": "tutorial.open_dataset depends on pooch to download and manage datasets. To proceed please install pooch.", │ │ │ │ │ │ "output_type": "error", │ │ │ │ │ │ @@ -85,18 +85,18 @@ │ │ │ │ │ │ ] │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "cell_type": "code", │ │ │ │ │ │ "execution_count": 3, │ │ │ │ │ │ "metadata": { │ │ │ │ │ │ "execution": { │ │ │ │ │ │ - "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:15:16.386112Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:15:16.385824Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:15:16.413810Z", │ │ │ │ │ │ - "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:15:16.413007Z" │ │ │ │ │ │ + "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:27:37.252985Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:27:37.252701Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:27:37.322472Z", │ │ │ │ │ │ + "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:27:37.306452Z" │ │ │ │ │ │ } │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ "outputs": [ │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "ename": "NameError", │ │ │ │ │ │ "evalue": "name 'ds' is not defined", │ │ │ │ │ │ "output_type": "error", │ │ │ │ │ │ @@ -138,18 +138,18 @@ │ │ │ │ │ │ ] │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "cell_type": "code", │ │ │ │ │ │ "execution_count": 4, │ │ │ │ │ │ "metadata": { │ │ │ │ │ │ "execution": { │ │ │ │ │ │ - "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:15:16.422083Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:15:16.421791Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:15:16.461792Z", │ │ │ │ │ │ - "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:15:16.461002Z" │ │ │ │ │ │ + "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:27:37.339444Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:27:37.339169Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:27:37.418465Z", │ │ │ │ │ │ + "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:27:37.402444Z" │ │ │ │ │ │ } │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ "outputs": [ │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "ename": "NameError", │ │ │ │ │ │ "evalue": "name 'ds' is not defined", │ │ │ │ │ │ "output_type": "error", │ │ │ │ │ │ @@ -202,18 +202,18 @@ │ │ │ │ │ │ ] │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "cell_type": "code", │ │ │ │ │ │ "execution_count": 5, │ │ │ │ │ │ "metadata": { │ │ │ │ │ │ "execution": { │ │ │ │ │ │ - "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:15:16.470108Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:15:16.469811Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:15:16.505685Z", │ │ │ │ │ │ - "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:15:16.504985Z" │ │ │ │ │ │ + "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:27:37.435499Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:27:37.435218Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:27:37.455135Z", │ │ │ │ │ │ + "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:27:37.454436Z" │ │ │ │ │ │ } │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ "outputs": [ │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "ename": "NameError", │ │ │ │ │ │ "evalue": "name 'ds' is not defined", │ │ │ │ │ │ "output_type": "error", │ │ │ │ │ │ @@ -258,18 +258,18 @@ │ │ │ │ │ │ ] │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "cell_type": "code", │ │ │ │ │ │ "execution_count": 6, │ │ │ │ │ │ "metadata": { │ │ │ │ │ │ "execution": { │ │ │ │ │ │ - "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:15:16.514021Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:15:16.513738Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:15:16.549784Z", │ │ │ │ │ │ - "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:15:16.549008Z" │ │ │ │ │ │ + "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:27:37.463376Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:27:37.463120Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:27:37.495106Z", │ │ │ │ │ │ + "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:27:37.494437Z" │ │ │ │ │ │ } │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ "outputs": [ │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "ename": "NameError", │ │ │ │ │ │ "evalue": "name 'ds' is not defined", │ │ │ │ │ │ "output_type": "error", │ │ │ │ │ │ @@ -320,26 +320,26 @@ │ │ │ │ │ │ ] │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "cell_type": "code", │ │ │ │ │ │ "execution_count": 7, │ │ │ │ │ │ "metadata": { │ │ │ │ │ │ "execution": { │ │ │ │ │ │ - "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:15:16.558023Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:15:16.557740Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:15:16.797817Z", │ │ │ │ │ │ - "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:15:16.797004Z" │ │ │ │ │ │ + "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:27:37.503371Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:27:37.503114Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:27:37.803129Z", │ │ │ │ │ │ + "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:27:37.802428Z" │ │ │ │ │ │ } │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ "outputs": [ │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "name": "stderr", │ │ │ │ │ │ "output_type": "stream", │ │ │ │ │ │ "text": [ │ │ │ │ │ │ - "/tmp/ipykernel_1525232/2946363816.py:1: DeprecationWarning: open_rasterio is Deprecated in favor of rioxarray. For information about transitioning, see: https://corteva.github.io/rioxarray/stable/getting_started/getting_started.html\n", │ │ │ │ │ │ + "/tmp/ipykernel_3179774/2946363816.py:1: DeprecationWarning: open_rasterio is Deprecated in favor of rioxarray. For information about transitioning, see: https://corteva.github.io/rioxarray/stable/getting_started/getting_started.html\n", │ │ │ │ │ │ " da = xr.tutorial.open_rasterio(\"RGB.byte\")\n" │ │ │ │ │ │ ] │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "ename": "ImportError", │ │ │ │ │ │ "evalue": "tutorial.open_rasterio depends on pooch to download and manage datasets. To proceed please install pooch.", │ │ │ │ │ │ "output_type": "error", │ │ │ │ │ │ @@ -385,26 +385,26 @@ │ │ │ │ │ │ ] │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "cell_type": "code", │ │ │ │ │ │ "execution_count": 8, │ │ │ │ │ │ "metadata": { │ │ │ │ │ │ "execution": { │ │ │ │ │ │ - "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:15:16.806035Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:15:16.805755Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:15:16.945020Z", │ │ │ │ │ │ - "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:15:16.929001Z" │ │ │ │ │ │ + "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:27:37.811402Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:27:37.811135Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:27:37.926466Z", │ │ │ │ │ │ + "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:27:37.910433Z" │ │ │ │ │ │ } │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ "outputs": [ │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "name": "stderr", │ │ │ │ │ │ "output_type": "stream", │ │ │ │ │ │ "text": [ │ │ │ │ │ │ - "/tmp/ipykernel_1525232/3653941964.py:4: DeprecationWarning: open_rasterio is Deprecated in favor of rioxarray. For information about transitioning, see: https://corteva.github.io/rioxarray/stable/getting_started/getting_started.html\n", │ │ │ │ │ │ + "/tmp/ipykernel_3179774/3653941964.py:4: DeprecationWarning: open_rasterio is Deprecated in favor of rioxarray. For information about transitioning, see: https://corteva.github.io/rioxarray/stable/getting_started/getting_started.html\n", │ │ │ │ │ │ " da = xr.tutorial.open_rasterio(\"RGB.byte\")\n" │ │ │ │ │ │ ] │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "ename": "ImportError", │ │ │ │ │ │ "evalue": "tutorial.open_rasterio depends on pooch to download and manage datasets. To proceed please install pooch.", │ │ │ │ │ │ "output_type": "error", │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/examples/weather-data.html │ │ │ │ @@ -705,37 +705,37 @@ │ │ │ │
<xarray.Dataset>
│ │ │ │  Dimensions:   (time: 731, location: 3)
│ │ │ │  Coordinates:
│ │ │ │    * time      (time) datetime64[ns] 2000-01-01 2000-01-02 ... 2001-12-31
│ │ │ │    * location  (location) <U2 'IA' 'IN' 'IL'
│ │ │ │  Data variables:
│ │ │ │      tmin      (time, location) float64 -8.037 -1.788 -3.932 ... -1.346 -4.544
│ │ │ │ -    tmax      (time, location) float64 12.98 3.31 6.779 ... 6.636 3.343 3.805
  • location
    PandasIndex
    PandasIndex(Index(['IA', 'IN', 'IL'], dtype='object', name='location'))
  • │ │ │ │ │ │ │ │
    │ │ │ │

    Examine a dataset with pandas and seaborn

    │ │ │ │
    │ │ │ │

    Convert to a pandas DataFrame

    │ │ │ │
    │ │ │ │
    [2]:
    │ │ │ │ @@ -932,15 +932,15 @@
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │
    [5]:
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │
    │ │ │ │
    │ │ │ │ -<seaborn.axisgrid.PairGrid at 0xffff6edf2850>
    │ │ │ │ +<seaborn.axisgrid.PairGrid at 0xffff5e61fad0>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │
    │ │ │ │
    │ │ │ │
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/examples_weather-data_9_1.png │ │ │ │ @@ -1338,26 +1338,26 @@ │ │ │ │ [0. , 0. , 0. ], │ │ │ │ [0. , 0. , 0. ], │ │ │ │ [0. , 0.01612903, 0. ], │ │ │ │ [0.33333333, 0.35 , 0.23333333], │ │ │ │ [0.93548387, 0.85483871, 0.82258065]]) │ │ │ │ Coordinates: │ │ │ │ * location (location) <U2 'IA' 'IN' 'IL' │ │ │ │ - * month (month) int64 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
    • location
      (location)
      <U2
      'IA' 'IN' 'IL'
      array(['IA', 'IN', 'IL'], dtype='<U2')
    • month
      (month)
      int64
      1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
      array([ 1,  2,  3,  4,  5,  6,  7,  8,  9, 10, 11, 12])
    • location
      PandasIndex
      PandasIndex(Index(['IA', 'IN', 'IL'], dtype='object', name='location'))
    • month
      PandasIndex
      PandasIndex(Int64Index([1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12], dtype='int64', name='month'))
  • │ │ │ │ │ │ │ │
    │ │ │ │
    [7]:
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │
    freeze.to_pandas().plot()
    │ │ │ │  
    │ │ │ │ @@ -1863,18 +1863,18 @@ │ │ │ │ Dimensions: (time: 731, location: 3) │ │ │ │ Coordinates: │ │ │ │ * time (time) datetime64[ns] 2000-01-01 2000-01-02 ... 2001-12-31 │ │ │ │ * location (location) <U2 'IA' 'IN' 'IL' │ │ │ │ month (time) int64 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 12 12 12 12 12 12 12 12 12 │ │ │ │ Data variables: │ │ │ │ some_missing (time, location) float64 nan nan nan ... 2.063 -1.346 -4.544 │ │ │ │ - filled (time, location) float64 -5.163 -4.216 ... -1.346 -4.544
  • location
    PandasIndex
    PandasIndex(Index(['IA', 'IN', 'IL'], dtype='object', name='location'))
  • │ │ │ │ │ │ │ │
    │ │ │ │
    [12]:
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │
    df = both.sel(time="2000").mean("location").reset_coords(drop=True).to_dataframe()
    │ │ │ │  df.head()
    │ │ │ │ ├── html2text {}
    │ │ │ │ │ @@ -157,15 +157,15 @@
    │ │ │ │ │  
    │ │ │ │ │  [../_images/examples_weather-data_7_1.png]
    │ │ │ │ │  
    │ │ │ │ │  **** Visualize using seaborn¶ ****
    │ │ │ │ │  [5]:
    │ │ │ │ │  sns.pairplot(df.reset_index(), vars=ds.data_vars)
    │ │ │ │ │  [5]:
    │ │ │ │ │ -
    │ │ │ │ │ +
    │ │ │ │ │  [../_images/examples_weather-data_9_1.png]
    │ │ │ │ │  
    │ │ │ │ │  ***** Probability of freeze by calendar month¶ *****
    │ │ │ │ │  [6]:
    │ │ │ │ │  freeze = (ds["tmin"] <= 0).groupby("time.month").mean("time")
    │ │ │ │ │  freeze
    │ │ │ │ │  [6]:
    │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/examples/weather-data.ipynb.gz
    │ │ │ │ ├── weather-data.ipynb
    │ │ │ │ │ ├── Pretty-printed
    │ │ │ │ │ │┄ Similarity: 0.9992323118860381%
    │ │ │ │ │ │┄ Differences: {"'cells'": "{1: {'metadata': {'execution': {'iopub.execute_input': '2024-01-08T11:27:42.590472Z', "
    │ │ │ │ │ │┄             "'iopub.status.busy': '2024-01-08T11:27:42.590156Z', 'iopub.status.idle': "
    │ │ │ │ │ │┄             "'2024-01-08T11:27:47.081164Z', 'shell.execute_reply': "
    │ │ │ │ │ │┄             "'2024-01-08T11:27:47.080493Z'}}, 'outputs': {0: {'data': {'text/html': {insert: "
    │ │ │ │ │ │┄             '[(370, "    tmax      (time, location) float64 12.98 3.31 6.779 ... 6.636 3.343 '
    │ │ │ │ │ │┄             "3.805
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    \n", │ │ │ │ │ │ @@ -1185,26 +1185,26 @@ │ │ │ │ │ │ " [0. , 0. , 0. ],\n", │ │ │ │ │ │ " [0. , 0. , 0. ],\n", │ │ │ │ │ │ " [0. , 0.01612903, 0. ],\n", │ │ │ │ │ │ " [0.33333333, 0.35 , 0.23333333],\n", │ │ │ │ │ │ " [0.93548387, 0.85483871, 0.82258065]])\n", │ │ │ │ │ │ "Coordinates:\n", │ │ │ │ │ │ " * location (location) <U2 'IA' 'IN' 'IL'\n", │ │ │ │ │ │ - " * month (month) int64 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
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      (location)
      <U2
      'IA' 'IN' 'IL'
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      int64
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    • location
      PandasIndex
      PandasIndex(Index(['IA', 'IN', 'IL'], dtype='object', name='location'))
    • month
      PandasIndex
      PandasIndex(Int64Index([1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12], dtype='int64', name='month'))
  • " │ │ │ │ │ │ ], │ │ │ │ │ │ "text/plain": [ │ │ │ │ │ │ "\n", │ │ │ │ │ │ "array([[0.9516129 , 0.88709677, 0.93548387],\n", │ │ │ │ │ │ " [0.84210526, 0.71929825, 0.77192982],\n", │ │ │ │ │ │ " [0.24193548, 0.12903226, 0.16129032],\n", │ │ │ │ │ │ " [0. , 0. , 0. ],\n", │ │ │ │ │ │ @@ -1236,18 +1236,18 @@ │ │ │ │ │ │ "execution_count": 7, │ │ │ │ │ │ "metadata": { │ │ │ │ │ │ "ExecuteTime": { │ │ │ │ │ │ "end_time": "2020-01-27T15:48:13.131247Z", │ │ │ │ │ │ "start_time": "2020-01-27T15:48:12.924985Z" │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ "execution": { │ │ │ │ │ │ - "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:15:29.221283Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:15:29.221019Z", │ │ │ │ │ │ - "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:15:29.393731Z", │ │ │ │ │ │ - "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:15:29.393000Z" │ │ │ │ │ │ + "iopub.execute_input": "2024-01-08T11:27:50.526915Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.busy": "2024-01-08T11:27:50.524963Z", │ │ │ │ │ │ + "iopub.status.idle": "2024-01-08T11:27:51.127790Z", │ │ │ │ │ │ + "shell.execute_reply": "2024-01-08T11:27:51.127221Z" │ │ │ │ │ │ } │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ "outputs": [ │ │ │ │ │ │ { │ │ │ │ │ │ "data": { │ │ │ │ │ │ "text/plain": [ │ │ │ │ │ │ "" │ │ │ │ │ │ @@ -1284,18 +1284,18 @@ │ │ │ │ │ │ "execution_count": 8, │ │ │ │ │ │ "metadata": { │ │ │ │ │ │ "ExecuteTime": { │ │ │ │ │ │ "end_time": "2020-01-27T15:48:08.498259Z", │ │ │ │ │ │ "start_time": "2020-01-27T15:48:08.210890Z" │ │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ │ "execution": { │ │ │ │ │ │ - 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    \n", │ │ │ │ │ │ @@ -1858,18 +1858,18 @@ │ │ │ │ │ │ "Dimensions: (time: 731, location: 3)\n", │ │ │ │ │ │ "Coordinates:\n", │ │ │ │ │ │ " * time (time) datetime64[ns] 2000-01-01 2000-01-02 ... 2001-12-31\n", │ │ │ │ │ │ " * location (location) <U2 'IA' 'IN' 'IL'\n", │ │ │ │ │ │ " month (time) int64 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ... 12 12 12 12 12 12 12 12 12\n", │ │ │ │ │ │ "Data variables:\n", │ │ │ │ │ │ " some_missing (time, location) float64 nan nan nan ... 2.063 -1.346 -4.544\n", │ │ │ │ │ │ - " filled (time, location) float64 -5.163 -4.216 ... -1.346 -4.544
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    │ │ │ │ │ │ │ │
    │ │ │ │
    │ │ │ │

    Plotting

    │ │ │ │

    Visualizing your datasets is quick and convenient:

    │ │ │ │
    In [37]: data.plot()
    │ │ │ │ -Out[37]: <matplotlib.collections.QuadMesh at 0xffff43f65c90>
    │ │ │ │ +Out[37]: <matplotlib.collections.QuadMesh at 0xffff67537a10>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/plotting_quick_overview.png │ │ │ │

    Note the automatic labeling with names and units. Our effort in adding metadata attributes has paid off! Many aspects of these figures are customizable: see Plotting.

    │ │ │ │
    │ │ │ │
    │ │ │ │

    pandas

    │ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -269,15 +269,15 @@ │ │ │ │ │ Coordinates: │ │ │ │ │ * x (x) int64 10 20 │ │ │ │ │ Dimensions without coordinates: y │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ***** Plotting¶ ***** │ │ │ │ │ Visualizing your datasets is quick and convenient: │ │ │ │ │ In [37]: data.plot() │ │ │ │ │ -Out[37]: │ │ │ │ │ +Out[37]: │ │ │ │ │ [../_images/plotting_quick_overview.png] │ │ │ │ │ Note the automatic labeling with names and units. Our effort in adding metadata │ │ │ │ │ attributes has paid off! Many aspects of these figures are customizable: see │ │ │ │ │ Plotting. │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ***** pandas¶ ***** │ │ │ │ │ Xarray objects can be easily converted to and from pandas objects using the │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ ├── js-beautify {} │ │ │ │ │ @@ -704,15 +704,15 @@ │ │ │ │ │ "track": [3, 16, 19, 20, 29, 32, 48], │ │ │ │ │ "again": [3, 8, 33, 40, 43, 48], │ │ │ │ │ "give": [3, 7, 8, 39, 43, 48], │ │ │ │ │ "rel": [3, 31, 42, 48], │ │ │ │ │ "messag": [3, 8, 48], │ │ │ │ │ "subject": 3, │ │ │ │ │ "line": [3, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 16, 18, 23, 28, 34, 36, 38, 39, 40, 44, 48], │ │ │ │ │ - "72": [3, 6, 32, 34, 38, 40, 43, 48], │ │ │ │ │ + "72": [3, 6, 32, 33, 34, 38, 40, 43, 48], │ │ │ │ │ "char": 3, │ │ │ │ │ "One": [3, 8, 24, 33, 40, 42, 44, 46, 48], │ │ │ │ │ "blank": 3, │ │ │ │ │ "bodi": 3, │ │ │ │ │ "refer": [3, 8, 14, 16, 19, 25, 29, 34, 40, 43, 44, 45, 48], │ │ │ │ │ "gh1234": 3, │ │ │ │ │ "fine": [3, 40], │ │ │ │ │ @@ -1122,15 +1122,15 @@ │ │ │ │ │ "british": 6, │ │ │ │ │ "isl": 6, │ │ │ │ │ "march": [6, 46], │ │ │ │ │ "7": [6, 7, 8, 9, 11, 12, 13, 14, 19, 23, 25, 28, 29, 31, 32, 33, 34, 36, 38, 39, 40, 42, 43, 44, 46, 47], │ │ │ │ │ "callback": 6, │ │ │ │ │ "lt": [6, 14], │ │ │ │ │ "_draw_all_if_interact": 6, │ │ │ │ │ - "0xffff59c779c0": 6, │ │ │ │ │ + "0xffff618eb9c0": 6, │ │ │ │ │ "post_execut": 6, │ │ │ │ │ "permissionerror": 6, │ │ │ │ │ "usr": 6, │ │ │ │ │ "lib": 6, │ │ │ │ │ "dist": 6, │ │ │ │ │ "119": [6, 32, 38, 39, 43, 46], │ │ │ │ │ "117": [6, 32, 38, 43, 46], │ │ │ │ │ @@ -1176,15 +1176,15 @@ │ │ │ │ │ "superclass": 6, │ │ │ │ │ "408": 6, │ │ │ │ │ "super": 6, │ │ │ │ │ "artist": 6, │ │ │ │ │ "74": [6, 32, 33, 34, 38, 40, 43, 48], │ │ │ │ │ "_finalize_raster": 6, │ │ │ │ │ "draw_wrapp": 6, │ │ │ │ │ - "73": [6, 32, 34, 38, 40, 43, 48], │ │ │ │ │ + "73": [6, 32, 33, 34, 38, 40, 43, 48], │ │ │ │ │ "75": [6, 8, 13, 14, 32, 34, 38, 40, 43, 48], │ │ │ │ │ "_raster": 6, │ │ │ │ │ "76": [6, 32, 34, 38, 40, 43, 48], │ │ │ │ │ "stop_raster": 6, │ │ │ │ │ "51": [6, 32, 34, 38, 39, 40, 43, 44, 48], │ │ │ │ │ "allow_raster": 6, │ │ │ │ │ "48": [6, 19, 32, 34, 38, 39, 40, 43, 44, 48], │ │ │ │ │ @@ -1283,15 +1283,15 @@ │ │ │ │ │ "106": [6, 32, 38, 43, 48], │ │ │ │ │ "extent_geom": 6, │ │ │ │ │ "sgeom": 6, │ │ │ │ │ "box": 6, │ │ │ │ │ "107": [6, 32, 38, 43], │ │ │ │ │ "109": [6, 32, 38, 43], │ │ │ │ │ "110": [6, 32, 38, 43], │ │ │ │ │ - "111": [6, 32, 38, 43], │ │ │ │ │ + "111": [6, 32, 33, 38, 43], │ │ │ │ │ "287": 6, │ │ │ │ │ "categori": [6, 29, 34], │ │ │ │ │ "286": 6, │ │ │ │ │ "_natural_earth_geom_cach": 6, │ │ │ │ │ "shaperead": 6, │ │ │ │ │ "natural_earth": 6, │ │ │ │ │ "288": 6, │ │ │ │ │ @@ -1812,15 +1812,15 @@ │ │ │ │ │ "until": [13, 33, 36, 40, 43], │ │ │ │ │ "scitool": [13, 18], │ │ │ │ │ "813": 13, │ │ │ │ │ "band": [13, 34, 40, 44], │ │ │ │ │ "color": [13, 16, 18, 43, 48], │ │ │ │ │ "r": [13, 28, 32, 33, 34, 38, 39, 40, 48], │ │ │ │ │ "tmp": 13, │ │ │ │ │ - "ipykernel_1525232": 13, │ │ │ │ │ + "ipykernel_3179774": 13, │ │ │ │ │ "2946363816": 13, │ │ │ │ │ "favor": [13, 16, 40, 42, 48], │ │ │ │ │ "transit": [13, 40, 43, 48], │ │ │ │ │ "corteva": [13, 40], │ │ │ │ │ "getting_start": [13, 40], │ │ │ │ │ "222": 13, │ │ │ │ │ "221": 13, │ │ │ │ │ @@ -1982,15 +1982,15 @@ │ │ │ │ │ "xlabel": [14, 43], │ │ │ │ │ "pairplot": 14, │ │ │ │ │ "reset_index": [14, 42, 44, 48], │ │ │ │ │ "var": [14, 25, 31, 32, 38, 43, 48], │ │ │ │ │ "data_var": [14, 32, 34, 38, 40, 44, 48], │ │ │ │ │ "axisgrid": 14, │ │ │ │ │ "pairgrid": 14, │ │ │ │ │ - "0xffff6edf2850": 14, │ │ │ │ │ + "0xffff5e61fad0": 14, │ │ │ │ │ "9516129": 14, │ │ │ │ │ "88709677": 14, │ │ │ │ │ "93548387": 14, │ │ │ │ │ "84210526": 14, │ │ │ │ │ "71929825": 14, │ │ │ │ │ "77192982": 14, │ │ │ │ │ "24193548": 14, │ │ │ │ │ @@ -2321,15 +2321,15 @@ │ │ │ │ │ "36": [19, 31, 32, 33, 34, 38, 39, 40, 43, 44, 46, 48], │ │ │ │ │ "9781708": 19, │ │ │ │ │ "37342613": 19, │ │ │ │ │ "49497537": 19, │ │ │ │ │ "33584385": 19, │ │ │ │ │ "37": [19, 31, 32, 33, 34, 36, 38, 39, 40, 43, 44, 48], │ │ │ │ │ "quadmesh": [19, 43, 48], │ │ │ │ │ - "0xffff43f65c90": 19, │ │ │ │ │ + "0xffff67537a10": 19, │ │ │ │ │ "paid": 19, │ │ │ │ │ "customiz": 19, │ │ │ │ │ "to_seri": [19, 42, 48], │ │ │ │ │ "to_xarrai": [19, 42], │ │ │ │ │ "38": [19, 31, 32, 33, 34, 38, 39, 40, 43, 44, 48], │ │ │ │ │ "469112": [19, 42], │ │ │ │ │ "282863": [19, 42], │ │ │ │ │ @@ -3184,15 +3184,15 @@ │ │ │ │ │ "gaussian_2d": 32, │ │ │ │ │ "xalpha": 32, │ │ │ │ │ "yalpha": 32, │ │ │ │ │ "94": [32, 38, 43, 48], │ │ │ │ │ "multi_peak": 32, │ │ │ │ │ "zero": [32, 38, 40, 43, 48], │ │ │ │ │ "96": [32, 38, 43, 48], │ │ │ │ │ - "97": [32, 33, 38, 43, 48], │ │ │ │ │ + "97": [32, 38, 43, 48], │ │ │ │ │ "n_peak": 32, │ │ │ │ │ "99": [32, 34, 38, 39, 43, 44, 48], │ │ │ │ │ "101": [32, 38, 43, 48], │ │ │ │ │ "102": [32, 38, 43, 48], │ │ │ │ │ "normal": [32, 38, 43, 44, 48], │ │ │ │ │ "103": [32, 38, 43, 48], │ │ │ │ │ "param_nam": 32, │ │ │ │ │ @@ -3207,22 +3207,22 @@ │ │ │ │ │ "curvefit_coeffici": 32, │ │ │ │ │ "994": 32, │ │ │ │ │ "9986": 32, │ │ │ │ │ "001": 32, │ │ │ │ │ "999": [32, 48], │ │ │ │ │ "curvefit_covari": 32, │ │ │ │ │ "556e": [32, 33, 43], │ │ │ │ │ - "466e": 32, │ │ │ │ │ + "467e": [32, 33], │ │ │ │ │ "parlanc": 32, │ │ │ │ │ "expand": [32, 40, 42, 48], │ │ │ │ │ "reorder": [32, 48], │ │ │ │ │ "112": [32, 38, 43], │ │ │ │ │ "subtract": [32, 33, 38, 39, 48], │ │ │ │ │ "113": [32, 38, 43], │ │ │ │ │ - "114": [32, 33, 38, 43], │ │ │ │ │ + "114": [32, 38, 43], │ │ │ │ │ "a2": [32, 48], │ │ │ │ │ "b2": [32, 48], │ │ │ │ │ "115": [32, 38, 43], │ │ │ │ │ "116": [32, 38, 43, 46], │ │ │ │ │ "inner": [32, 38, 48], │ │ │ │ │ "120": [32, 38, 40, 43, 46], │ │ │ │ │ "arithmetic_join": [32, 41, 48], │ │ │ │ │ @@ -3309,15 +3309,15 @@ │ │ │ │ │ "178": 33, │ │ │ │ │ "179": [33, 38], │ │ │ │ │ "concaten": [33, 36, 40, 44, 48], │ │ │ │ │ "disclaim": 33, │ │ │ │ │ "execut": [33, 48], │ │ │ │ │ "ineffect": 33, │ │ │ │ │ "reveal": 33, │ │ │ │ │ - "78c250975acbcfcf8c779b7811a8c27ctemperatur": 33, │ │ │ │ │ + "4dbe4737ce0678ff5049460d084186c6temperatur": 33, │ │ │ │ │ "progressbar": 33, │ │ │ │ │ "progress": [33, 48], │ │ │ │ │ "schedul": [33, 48], │ │ │ │ │ "delayed_obj": 33, │ │ │ │ │ "hdf5_use_file_lock": 33, │ │ │ │ │ "compet": 33, │ │ │ │ │ "hdf5": [33, 40, 48], │ │ │ │ │ @@ -3533,15 +3533,14 @@ │ │ │ │ │ "921e": 33, │ │ │ │ │ "091e": 33, │ │ │ │ │ "333e": 33, │ │ │ │ │ "472e": 33, │ │ │ │ │ "782e": 33, │ │ │ │ │ "407e": 33, │ │ │ │ │ "119e": 33, │ │ │ │ │ - "467e": 33, │ │ │ │ │ "beyond": 33, │ │ │ │ │ "isn": [33, 48], │ │ │ │ │ "embarrassingli": 33, │ │ │ │ │ "intermedi": [33, 48], │ │ │ │ │ "fortun": 33, │ │ │ │ │ "spearman": 33, │ │ │ │ │ "rank": [33, 34, 48], │ │ │ │ │ @@ -3666,16 +3665,16 @@ │ │ │ │ │ "__delitem__": [34, 48], │ │ │ │ │ "shallow": 34, │ │ │ │ │ "modif": [34, 40], │ │ │ │ │ "temperature2": 34, │ │ │ │ │ "chain": [34, 38, 48], │ │ │ │ │ "flow": 34, │ │ │ │ │ "line2d": [34, 39, 43], │ │ │ │ │ - "0xffff35426dd0": 34, │ │ │ │ │ - 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"0xffff32e61950": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff32e6be50": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff8655b350": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff32906b50": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff5a3f1250": 43, │ │ │ │ │ + "0xffffaa493350": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff5a28b350": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff59d96010": 43, │ │ │ │ │ "denot": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff32bab290": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff59db1cd0": 43, │ │ │ │ │ "streamlin": 43, │ │ │ │ │ "linecollect": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff32ae6e90": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff59ec8890": 43, │ │ │ │ │ "tangent": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff32d74dd0": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff59c03e50": 43, │ │ │ │ │ "script": [43, 48], │ │ │ │ │ "orthograph": 43, │ │ │ │ │ "grai": [43, 48], │ │ │ │ │ "transfer": 43, │ │ │ │ │ "gridlin": 43, │ │ │ │ │ "submodul": 43, │ │ │ │ │ "xplt": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff3172af90": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff320aa250": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff3223ad90": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff31532a50": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff58b532d0": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff58a67bd0": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff58c8e250": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff58c8d390": 43, │ │ │ │ │ "dispatch": [43, 48], │ │ │ │ │ "uniformli": 43, │ │ │ │ │ "pixel": [43, 48], │ │ │ │ │ "carefulli": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff31cc5ed0": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff58a58210": 43, │ │ │ │ │ "strang": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff31596b50": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff58a94290": 43, │ │ │ │ │ "polar": [43, 48], │ │ │ │ │ "gh781": [43, 48], │ │ │ │ │ "geocollect": 43, │ │ │ │ │ "geoquadmesh": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff31575190": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff31497810": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff315eadd0": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff59c1d850": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff59b80910": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff595f3490": 43, │ │ │ │ │ "draw_label": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff3145a950": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff59be4910": 43, │ │ │ │ │ "infer_interv": [43, 48], │ │ │ │ │ - "0xffff2f7dab50": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff2fe03690": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff31432950": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff2fe04890": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff2f7c6a50": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff2f6a3f90": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff2f6bd890": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff2f6bdad0": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff2f6d8f50": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff2f6d93d0": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff2f6d9650": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff2f6d9a10": 43, │ │ │ │ │ - "0xffff2f6d9cd0": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff58b98250": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff5a441290": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff56dc6350": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff59a13450": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff56c626d0": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff56c72e10": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff56c73190": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff56c73550": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff56c60ed0": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff56c929d0": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff56c92d10": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff56c92fd0": 43, │ │ │ │ │ + "0xffff56c93290": 43, │ │ │ │ │ "revers": 44, │ │ │ │ │ "nascent": [44, 48], │ │ │ │ │ "unlist": [44, 48], │ │ │ │ │ "stacked2": 44, │ │ │ │ │ "depart": 44, │ │ │ │ │ "complic": 44, │ │ │ │ │ "sample_dim": 44, │ │ │ │ │ @@ -6981,15 +6980,15 @@ │ │ │ │ │ "pete": 48, │ │ │ │ │ "cabl": 48, │ │ │ │ │ "sinclair": 48, │ │ │ │ │ "gh185": 48, │ │ │ │ │ "gh479": 48, │ │ │ │ │ "gh475": 48, │ │ │ │ │ "abcdefg": 48, │ │ │ │ │ - "0xffff2dfc6190": 48, │ │ │ │ │ + "0xffff56821ad0": 48, │ │ │ │ │ "ma": 48, │ │ │ │ │ "maskedarrai": 48, │ │ │ │ │ "random_sampl": 48, │ │ │ │ │ "352": 48, │ │ │ │ │ "masked_arrai": 48, │ │ │ │ │ "12696983303810094": 48, │ │ │ │ │ "26047600586578334": 48, │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/user-guide/computation.html │ │ │ │ @@ -837,15 +837,15 @@ │ │ │ │ Dimensions: (param: 10, cov_i: 10, cov_j: 10) │ │ │ │ Coordinates: │ │ │ │ * param (param) <U7 'a0' 'xc0' 'yc0' ... 'xalpha1' 'yalpha1' │ │ │ │ * cov_i (cov_i) <U7 'a0' 'xc0' 'yc0' ... 'xalpha1' 'yalpha1' │ │ │ │ * cov_j (cov_j) <U7 'a0' 'xc0' 'yc0' ... 'xalpha1' 'yalpha1' │ │ │ │ Data variables: │ │ │ │ curvefit_coefficients (param) float64 1.994 -0.9986 -2.001 ... 1.999 0.9986 │ │ │ │ - curvefit_covariance (cov_i, cov_j) float64 6.556e-05 ... 4.466e-06 │ │ │ │ + curvefit_covariance (cov_i, cov_j) float64 6.556e-05 ... 4.467e-06 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │
    │ │ │ │

    Note

    │ │ │ │

    This method replicates the behavior of scipy.optimize.curve_fit().

    │ │ │ │
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -705,15 +705,15 @@ │ │ │ │ │ Coordinates: │ │ │ │ │ * param (param) You’ll notice that printing a dataset still shows a preview of array values, │ │ │ │ even if they are actually Dask arrays. We can do this quickly with Dask because │ │ │ │ we only need to compute the first few values (typically from the first block). │ │ │ │ To reveal the true nature of an array, print a DataArray:

    │ │ │ │
    In [3]: ds.temperature
    │ │ │ │  Out[3]: 
    │ │ │ │  <xarray.DataArray 'temperature' (time: 30, latitude: 180, longitude: 180)>
    │ │ │ │ -dask.array<open_dataset-78c250975acbcfcf8c779b7811a8c27ctemperature, shape=(30, 180, 180), dtype=float64, chunksize=(10, 180, 180), chunktype=numpy.ndarray>
    │ │ │ │ +dask.array<open_dataset-4dbe4737ce0678ff5049460d084186c6temperature, shape=(30, 180, 180), dtype=float64, chunksize=(10, 180, 180), chunktype=numpy.ndarray>
    │ │ │ │  Coordinates:
    │ │ │ │    * time       (time) datetime64[ns] 2015-01-01 2015-01-02 ... 2015-01-30
    │ │ │ │    * longitude  (longitude) int64 0 1 2 3 4 5 6 7 ... 173 174 175 176 177 178 179
    │ │ │ │    * latitude   (latitude) float64 89.5 88.5 87.5 86.5 ... -87.5 -88.5 -89.5
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │

    Once you’ve manipulated a Dask array, you can still write a dataset too big to │ │ │ │ @@ -138,16 +138,16 @@ │ │ │ │ # or distributed.progress when using the distributed scheduler │ │ │ │ In [6]: delayed_obj = ds.to_netcdf("manipulated-example-data.nc", compute=False) │ │ │ │ │ │ │ │ In [7]: with ProgressBar(): │ │ │ │ ...: results = delayed_obj.compute() │ │ │ │ ...: │ │ │ │ │ │ │ │ -[ ] | 0% Completed | 9.97 ms │ │ │ │ -[########################################] | 100% Completed | 114.03 ms │ │ │ │ +[ ] | 0% Completed | 10.73 ms │ │ │ │ +[########################################] | 100% Completed | 111.72 ms │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │

    │ │ │ │

    Note

    │ │ │ │

    When using Dask’s distributed scheduler to write NETCDF4 files, │ │ │ │ it may be necessary to set the environment variable HDF5_USE_FILE_LOCKING=FALSE │ │ │ │ to avoid competing locks within the HDF5 SWMR file locking scheme. Note that │ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -76,15 +76,15 @@ │ │ │ │ │ You’ll notice that printing a dataset still shows a preview of array values, │ │ │ │ │ even if they are actually Dask arrays. We can do this quickly with Dask because │ │ │ │ │ we only need to compute the first few values (typically from the first block). │ │ │ │ │ To reveal the true nature of an array, print a DataArray: │ │ │ │ │ In [3]: ds.temperature │ │ │ │ │ Out[3]: │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ -dask.array │ │ │ │ │ Coordinates: │ │ │ │ │ * time (time) datetime64[ns] 2015-01-01 2015-01-02 ... 2015-01-30 │ │ │ │ │ * longitude (longitude) int64 0 1 2 3 4 5 6 7 ... 173 174 175 176 177 178 │ │ │ │ │ 179 │ │ │ │ │ * latitude (latitude) float64 89.5 88.5 87.5 86.5 ... -87.5 -88.5 -89.5 │ │ │ │ │ Once you’ve manipulated a Dask array, you can still write a dataset too big │ │ │ │ │ @@ -98,16 +98,16 @@ │ │ │ │ │ In [6]: delayed_obj = ds.to_netcdf("manipulated-example-data.nc", │ │ │ │ │ compute=False) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [7]: with ProgressBar(): │ │ │ │ │ ...: results = delayed_obj.compute() │ │ │ │ │ ...: │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ -[ ] | 0% Completed | 9.97 ms │ │ │ │ │ -[########################################] | 100% Completed | 114.03 ms │ │ │ │ │ +[ ] | 0% Completed | 10.73 ms │ │ │ │ │ +[########################################] | 100% Completed | 111.72 ms │ │ │ │ │ Note │ │ │ │ │ When using Dask’s distributed scheduler to write NETCDF4 files, it may be │ │ │ │ │ necessary to set the environment variableHDF5_USE_FILE_LOCKING=FALSEto avoid │ │ │ │ │ competing locks within the HDF5 SWMR file locking scheme. Note that writing │ │ │ │ │ netCDF files with Dask’s distributed scheduler is only supported for │ │ │ │ │ thenetcdf4backend. │ │ │ │ │ A dataset can also be converted to a Dask DataFrame using to_dask_dataframe(). │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/user-guide/data-structures.html │ │ │ │ @@ -687,18 +687,18 @@ │ │ │ │ a method call with an external function (e.g., ds.pipe(func)) instead of │ │ │ │ simply calling it (e.g., func(ds)). This allows you to write pipelines for │ │ │ │ transforming your data (using “method chaining”) instead of writing hard to │ │ │ │ follow nested function calls:

    │ │ │ │
    # these lines are equivalent, but with pipe we can make the logic flow
    │ │ │ │  # entirely from left to right
    │ │ │ │  In [60]: plt.plot((2 * ds.temperature.sel(x=0)).mean("y"))
    │ │ │ │ -Out[60]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff35426dd0>]
    │ │ │ │ +Out[60]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff5c9f11d0>]
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [61]: (ds.temperature.sel(x=0).pipe(lambda x: 2 * x).mean("y").pipe(plt.plot))
    │ │ │ │ -Out[61]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff35336650>]
    │ │ │ │ +Out[61]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff5c93c9d0>]
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │

    Both pipe and assign replicate the pandas methods of the same names │ │ │ │ (DataFrame.pipe and │ │ │ │ DataFrame.assign).

    │ │ │ │

    With xarray, there is no performance penalty for creating new datasets, even if │ │ │ │ variables are lazily loaded from a file on disk. Creating new objects instead │ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -574,19 +574,19 @@ │ │ │ │ │ There is also the pipe() method that allows you to use a method call with an │ │ │ │ │ external function (e.g., ds.pipe(func)) instead of simply calling it (e.g., │ │ │ │ │ func(ds)). This allows you to write pipelines for transforming your data (using │ │ │ │ │ “method chaining”) instead of writing hard to follow nested function calls: │ │ │ │ │ # these lines are equivalent, but with pipe we can make the logic flow │ │ │ │ │ # entirely from left to right │ │ │ │ │ In [60]: plt.plot((2 * ds.temperature.sel(x=0)).mean("y")) │ │ │ │ │ -Out[60]: [] │ │ │ │ │ +Out[60]: [] │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [61]: (ds.temperature.sel(x=0).pipe(lambda x: 2 * x).mean("y").pipe │ │ │ │ │ (plt.plot)) │ │ │ │ │ -Out[61]: [] │ │ │ │ │ +Out[61]: [] │ │ │ │ │ Both pipe and assign replicate the pandas methods of the same names │ │ │ │ │ (DataFrame.pipe and DataFrame.assign). │ │ │ │ │ With xarray, there is no performance penalty for creating new datasets, even if │ │ │ │ │ variables are lazily loaded from a file on disk. Creating new objects instead │ │ │ │ │ of mutating existing objects often results in easier to understand code, so we │ │ │ │ │ encourage using this approach. │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/user-guide/interpolation.html │ │ │ │ @@ -222,24 +222,24 @@ │ │ │ │ ....: np.sin(np.linspace(0, 2 * np.pi, 10)), │ │ │ │ ....: dims="x", │ │ │ │ ....: coords={"x": np.linspace(0, 1, 10)}, │ │ │ │ ....: ) │ │ │ │ ....: │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: da.plot.line("o", label="original") │ │ │ │ -Out[17]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff58108b90>] │ │ │ │ +Out[17]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff5e0911d0>] │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: da.interp(x=np.linspace(0, 1, 100)).plot.line(label="linear (default)") │ │ │ │ -Out[18]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff6087ac90>] │ │ │ │ +Out[18]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff87f0e890>] │ │ │ │ │ │ │ │ In [19]: da.interp(x=np.linspace(0, 1, 100), method="cubic").plot.line(label="cubic") │ │ │ │ -Out[19]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff60956bd0>] │ │ │ │ +Out[19]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff8761c050>] │ │ │ │ │ │ │ │ In [20]: plt.legend() │ │ │ │ -Out[20]: <matplotlib.legend.Legend at 0xffff6088a690> │ │ │ │ +Out[20]: <matplotlib.legend.Legend at 0xffff5b539a50> │ │ │ │

    │ │ │ │ │ │ │ │ ../_images/interpolation_sample1.png │ │ │ │

    Additional keyword arguments can be passed to scipy’s functions.

    │ │ │ │
    # fill 0 for the outside of the original coordinates.
    │ │ │ │  In [21]: da.interp(x=np.linspace(-0.5, 1.5, 10), kwargs={"fill_value": 0.0})
    │ │ │ │  Out[21]: 
    │ │ │ │ @@ -615,15 +615,15 @@
    │ │ │ │      858             f"Dimensions {invalid} do not exist. Expected one or more of {dims}"
    │ │ │ │      859         )
    │ │ │ │      861     return indexers
    │ │ │ │      863 elif missing_dims == "warn":
    │ │ │ │      864 
    │ │ │ │      865     # don't modify input
    │ │ │ │  
    │ │ │ │ -ValueError: Dimensions {'lon', 'lat'} do not exist. Expected one or more of Frozen({'x': 3, 'y': 4})
    │ │ │ │ +ValueError: Dimensions {'lat', 'lon'} do not exist. Expected one or more of Frozen({'x': 3, 'y': 4})
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [63]: dsi.air.plot(ax=axes[1])
    │ │ │ │  ---------------------------------------------------------------------------
    │ │ │ │  NameError                                 Traceback (most recent call last)
    │ │ │ │  Cell In [63], line 1
    │ │ │ │  ----> 1 dsi.air.plot(ax=axes[1])
    │ │ │ │ ├── html2text {}
    │ │ │ │ │ @@ -165,26 +165,26 @@
    │ │ │ │ │     ....:     np.sin(np.linspace(0, 2 * np.pi, 10)),
    │ │ │ │ │     ....:     dims="x",
    │ │ │ │ │     ....:     coords={"x": np.linspace(0, 1, 10)},
    │ │ │ │ │     ....: )
    │ │ │ │ │     ....:
    │ │ │ │ │  
    │ │ │ │ │  In [17]: da.plot.line("o", label="original")
    │ │ │ │ │ -Out[17]: []
    │ │ │ │ │ +Out[17]: []
    │ │ │ │ │  
    │ │ │ │ │  In [18]: da.interp(x=np.linspace(0, 1, 100)).plot.line(label="linear
    │ │ │ │ │  (default)")
    │ │ │ │ │ -Out[18]: []
    │ │ │ │ │ +Out[18]: []
    │ │ │ │ │  
    │ │ │ │ │  In [19]: da.interp(x=np.linspace(0, 1, 100), method="cubic").plot.line
    │ │ │ │ │  (label="cubic")
    │ │ │ │ │ -Out[19]: []
    │ │ │ │ │ +Out[19]: []
    │ │ │ │ │  
    │ │ │ │ │  In [20]: plt.legend()
    │ │ │ │ │ -Out[20]: 
    │ │ │ │ │ +Out[20]: 
    │ │ │ │ │  [../_images/interpolation_sample1.png]
    │ │ │ │ │  Additional keyword arguments can be passed to scipy’s functions.
    │ │ │ │ │  # fill 0 for the outside of the original coordinates.
    │ │ │ │ │  In [21]: da.interp(x=np.linspace(-0.5, 1.5, 10), kwargs={"fill_value": 0.0})
    │ │ │ │ │  Out[21]:
    │ │ │ │ │  
    │ │ │ │ │  array([ 0.   ,  0.   ,  0.   ,  0.814,  0.604, -0.604, -0.814,  0.   ,  0.   ,
    │ │ │ │ │ @@ -558,15 +558,15 @@
    │ │ │ │ │  of {dims}"
    │ │ │ │ │      859         )
    │ │ │ │ │      861     return indexers
    │ │ │ │ │      863 elif missing_dims == "warn":
    │ │ │ │ │      864
    │ │ │ │ │      865     # don't modify input
    │ │ │ │ │  
    │ │ │ │ │ -ValueError: Dimensions {'lon', 'lat'} do not exist. Expected one or more of
    │ │ │ │ │ +ValueError: Dimensions {'lat', 'lon'} do not exist. Expected one or more of
    │ │ │ │ │  Frozen({'x': 3, 'y': 4})
    │ │ │ │ │  
    │ │ │ │ │  In [63]: dsi.air.plot(ax=axes[1])
    │ │ │ │ │  ---------------------------------------------------------------------------
    │ │ │ │ │  NameError                                 Traceback (most recent call last)
    │ │ │ │ │  Cell In [63], line 1
    │ │ │ │ │  ----> 1 dsi.air.plot(ax=axes[1])
    │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/user-guide/plotting.html
    │ │ │ │ @@ -643,15 +643,15 @@
    │ │ │ │  --> 186     raise KeyError(key)
    │ │ │ │      188 ref_name, var_name = split_key
    │ │ │ │      189 ref_var = variables[ref_name]
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  KeyError: 'lat'
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [51]: b.plot()
    │ │ │ │ -Out[51]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff83223890>]
    │ │ │ │ +Out[51]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffffaa97b2d0>]
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/plotting_nonuniform_coords.png │ │ │ │
    │ │ │ │
    │ │ │ │

    Other types of plot

    │ │ │ │

    There are several other options for plotting 2D data.

    │ │ │ │ @@ -1205,104 +1205,104 @@ │ │ │ │ * y (y) float64 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 1.0 │ │ │ │ * z (z) int64 0 1 2 3 │ │ │ │ * w (w) <U5 'one' 'two' 'three' 'five' │ │ │ │ Attributes: │ │ │ │ units: Aunits │ │ │ │ │ │ │ │ In [99]: ds.A.plot.scatter(x="y") │ │ │ │ -Out[99]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffff8310ae90> │ │ │ │ +Out[99]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffffaa7f0190> │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ../_images/da_A_y.png │ │ │ │

    Same plot can be displayed using the dataset:

    │ │ │ │
    In [100]: ds.plot.scatter(x="y", y="A")
    │ │ │ │ -Out[100]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffff8324c6d0>
    │ │ │ │ +Out[100]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffffaa766d10>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/ds_A_y.png │ │ │ │

    Now suppose we want to scatter the A DataArray against the B DataArray

    │ │ │ │
    In [101]: ds.plot.scatter(x="A", y="B")
    │ │ │ │ -Out[101]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffff830380d0>
    │ │ │ │ +Out[101]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffff5e32f010>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/ds_simple_scatter.png │ │ │ │

    The hue kwarg lets you vary the color by variable value

    │ │ │ │
    In [102]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", hue="w")
    │ │ │ │ -Out[102]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffff83093810>
    │ │ │ │ +Out[102]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffffaa5eb190>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/ds_hue_scatter.png │ │ │ │

    You can force a legend instead of a colorbar by setting add_legend=True, add_colorbar=False.

    │ │ │ │
    In [103]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", hue="w", add_legend=True, add_colorbar=False)
    │ │ │ │ -Out[103]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffff82faa410>
    │ │ │ │ +Out[103]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffffaa76ed50>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/ds_discrete_legend_hue_scatter.png │ │ │ │
    In [104]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", hue="w", add_legend=False, add_colorbar=True)
    │ │ │ │ -Out[104]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffff83093790>
    │ │ │ │ +Out[104]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffffaa685090>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/ds_discrete_colorbar_hue_scatter.png │ │ │ │

    The markersize kwarg lets you vary the point’s size by variable value. │ │ │ │ You can additionally pass size_norm to control how the variable’s values are mapped to point sizes.

    │ │ │ │
    In [105]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", hue="y", markersize="z")
    │ │ │ │ -Out[105]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffff32fdf810>
    │ │ │ │ +Out[105]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffff5a4f0b50>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/ds_hue_size_scatter.png │ │ │ │

    The z kwarg lets you plot the data along the z-axis as well.

    │ │ │ │
    In [106]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", z="z", hue="y", markersize="x")
    │ │ │ │ -Out[106]: <mpl_toolkits.mplot3d.art3d.Path3DCollection at 0xffff32e61950>
    │ │ │ │ +Out[106]: <mpl_toolkits.mplot3d.art3d.Path3DCollection at 0xffff5a3f1250>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/ds_hue_size_scatter_z.png │ │ │ │

    Faceting is also possible

    │ │ │ │
    In [107]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", hue="y", markersize="x", row="x", col="w")
    │ │ │ │ -Out[107]: <xarray.plot.facetgrid.FacetGrid at 0xffff32e6be50>
    │ │ │ │ +Out[107]: <xarray.plot.facetgrid.FacetGrid at 0xffffaa493350>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/ds_facet_scatter.png │ │ │ │

    And adding the z-axis

    │ │ │ │
    In [108]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", z="z", hue="y", markersize="x", row="x", col="w")
    │ │ │ │ -Out[108]: <xarray.plot.facetgrid.FacetGrid at 0xffff8655b350>
    │ │ │ │ +Out[108]: <xarray.plot.facetgrid.FacetGrid at 0xffff5a28b350>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/ds_facet_scatter_z.png │ │ │ │

    For more advanced scatter plots, we recommend converting the relevant data variables │ │ │ │ to a pandas DataFrame and using the extensive plotting capabilities of seaborn.

    │ │ │ │
    │ │ │ │
    │ │ │ │

    Quiver

    │ │ │ │

    Visualizing vector fields is supported with quiver plots:

    │ │ │ │
    In [109]: ds.isel(w=1, z=1).plot.quiver(x="x", y="y", u="A", v="B")
    │ │ │ │ -Out[109]: <matplotlib.quiver.Quiver at 0xffff32906b50>
    │ │ │ │ +Out[109]: <matplotlib.quiver.Quiver at 0xffff59d96010>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/ds_simple_quiver.png │ │ │ │

    where u and v denote the x and y direction components of the arrow vectors. Again, faceting is also possible:

    │ │ │ │
    In [110]: ds.plot.quiver(x="x", y="y", u="A", v="B", col="w", row="z", scale=4)
    │ │ │ │ -Out[110]: <xarray.plot.facetgrid.FacetGrid at 0xffff32bab290>
    │ │ │ │ +Out[110]: <xarray.plot.facetgrid.FacetGrid at 0xffff59db1cd0>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/ds_facet_quiver.png │ │ │ │

    scale is required for faceted quiver plots. │ │ │ │ The scale determines the number of data units per arrow length unit, i.e. a smaller scale parameter makes the arrow longer.

    │ │ │ │
    │ │ │ │
    │ │ │ │

    Streamplot

    │ │ │ │

    Visualizing vector fields is also supported with streamline plots:

    │ │ │ │
    In [111]: ds.isel(w=1, z=1).plot.streamplot(x="x", y="y", u="A", v="B")
    │ │ │ │ -Out[111]: <matplotlib.collections.LineCollection at 0xffff32ae6e90>
    │ │ │ │ +Out[111]: <matplotlib.collections.LineCollection at 0xffff59ec8890>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/ds_simple_streamplot.png │ │ │ │

    where u and v denote the x and y direction components of the vectors tangent to the streamlines. │ │ │ │ Again, faceting is also possible:

    │ │ │ │
    In [112]: ds.plot.streamplot(x="x", y="y", u="A", v="B", col="w", row="z")
    │ │ │ │ -Out[112]: <xarray.plot.facetgrid.FacetGrid at 0xffff32d74dd0>
    │ │ │ │ +Out[112]: <xarray.plot.facetgrid.FacetGrid at 0xffff59c03e50>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/ds_facet_streamplot.png │ │ │ │
    │ │ │ │ │ │ │ │
    │ │ │ │

    Maps

    │ │ │ │ @@ -1424,24 +1424,24 @@ │ │ │ │
    In [121]: import xarray.plot as xplt
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [122]: da = xr.DataArray(range(5))
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [123]: fig, axs = plt.subplots(ncols=2, nrows=2)
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [124]: da.plot(ax=axs[0, 0])
    │ │ │ │ -Out[124]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff3172af90>]
    │ │ │ │ +Out[124]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff58b532d0>]
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [125]: da.plot.line(ax=axs[0, 1])
    │ │ │ │ -Out[125]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff320aa250>]
    │ │ │ │ +Out[125]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff58a67bd0>]
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [126]: xplt.plot(da, ax=axs[1, 0])
    │ │ │ │ -Out[126]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff3223ad90>]
    │ │ │ │ +Out[126]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff58c8e250>]
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [127]: xplt.line(da, ax=axs[1, 1])
    │ │ │ │ -Out[127]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff31532a50>]
    │ │ │ │ +Out[127]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff58c8d390>]
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [128]: plt.tight_layout()
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [129]: plt.draw()
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/plotting_ways_to_use.png │ │ │ │ @@ -1490,15 +1490,15 @@ │ │ │ │ │ │ │ │

    The plot will produce an image corresponding to the values of the array. │ │ │ │ Hence the top left pixel will be a different color than the others. │ │ │ │ Before reading on, you may want to look at the coordinates and │ │ │ │ think carefully about what the limits, labels, and orientation for │ │ │ │ each of the axes should be.

    │ │ │ │
    In [134]: a.plot()
    │ │ │ │ -Out[134]: <matplotlib.collections.QuadMesh at 0xffff31cc5ed0>
    │ │ │ │ +Out[134]: <matplotlib.collections.QuadMesh at 0xffff58a58210>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/plotting_example_2d_simple.png │ │ │ │

    It may seem strange that │ │ │ │ the values on the y axis are decreasing with -0.5 on the top. This is because │ │ │ │ the pixels are centered over their coordinates, and the │ │ │ │ axis labels and ranges correspond to the values of the │ │ │ │ @@ -1520,81 +1520,81 @@ │ │ │ │ .....: np.arange(20).reshape(4, 5), │ │ │ │ .....: dims=["y", "x"], │ │ │ │ .....: coords={"lat": (("y", "x"), lat), "lon": (("y", "x"), lon)}, │ │ │ │ .....: ) │ │ │ │ .....: │ │ │ │ │ │ │ │ In [139]: da.plot.pcolormesh(x="lon", y="lat") │ │ │ │ -Out[139]: <matplotlib.collections.QuadMesh at 0xffff31596b50> │ │ │ │ +Out[139]: <matplotlib.collections.QuadMesh at 0xffff58a94290> │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ../_images/plotting_example_2d_irreg.png │ │ │ │

    Note that in this case, xarray still follows the pixel centered convention. │ │ │ │ This might be undesirable in some cases, for example when your data is defined │ │ │ │ on a polar projection (GH781). This is why the default is to not follow │ │ │ │ this convention when plotting on a map:

    │ │ │ │
    In [140]: import cartopy.crs as ccrs
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [141]: ax = plt.subplot(projection=ccrs.PlateCarree())
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [142]: da.plot.pcolormesh(x="lon", y="lat", ax=ax)
    │ │ │ │ -Out[142]: <cartopy.mpl.geocollection.GeoQuadMesh at 0xffff31575190>
    │ │ │ │ +Out[142]: <cartopy.mpl.geocollection.GeoQuadMesh at 0xffff59c1d850>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [143]: ax.scatter(lon, lat, transform=ccrs.PlateCarree())
    │ │ │ │ -Out[143]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffff31497810>
    │ │ │ │ +Out[143]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffff59b80910>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [144]: ax.coastlines()
    │ │ │ │ -Out[144]: <cartopy.mpl.feature_artist.FeatureArtist at 0xffff315eadd0>
    │ │ │ │ +Out[144]: <cartopy.mpl.feature_artist.FeatureArtist at 0xffff595f3490>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [145]: ax.gridlines(draw_labels=True)
    │ │ │ │ -Out[145]: <cartopy.mpl.gridliner.Gridliner at 0xffff3145a950>
    │ │ │ │ +Out[145]: <cartopy.mpl.gridliner.Gridliner at 0xffff59be4910>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ _build/html/_static/plotting_example_2d_irreg_map.png │ │ │ │

    You can however decide to infer the cell boundaries and use the │ │ │ │ infer_intervals keyword:

    │ │ │ │
    In [146]: ax = plt.subplot(projection=ccrs.PlateCarree())
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [147]: da.plot.pcolormesh(x="lon", y="lat", ax=ax, infer_intervals=True)
    │ │ │ │ -Out[147]: <cartopy.mpl.geocollection.GeoQuadMesh at 0xffff2f7dab50>
    │ │ │ │ +Out[147]: <cartopy.mpl.geocollection.GeoQuadMesh at 0xffff58b98250>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [148]: ax.scatter(lon, lat, transform=ccrs.PlateCarree())
    │ │ │ │ -Out[148]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffff2fe03690>
    │ │ │ │ +Out[148]: <matplotlib.collections.PathCollection at 0xffff5a441290>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [149]: ax.coastlines()
    │ │ │ │ -Out[149]: <cartopy.mpl.feature_artist.FeatureArtist at 0xffff31432950>
    │ │ │ │ +Out[149]: <cartopy.mpl.feature_artist.FeatureArtist at 0xffff56dc6350>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [150]: ax.gridlines(draw_labels=True)
    │ │ │ │ -Out[150]: <cartopy.mpl.gridliner.Gridliner at 0xffff2fe04890>
    │ │ │ │ +Out[150]: <cartopy.mpl.gridliner.Gridliner at 0xffff59a13450>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ _build/html/_static/plotting_example_2d_irreg_map_infer.png │ │ │ │
    │ │ │ │

    Note

    │ │ │ │

    The data model of xarray does not support datasets with cell boundaries │ │ │ │ yet. If you want to use these coordinates, you’ll have to make the plots │ │ │ │ outside the xarray framework.

    │ │ │ │
    │ │ │ │

    One can also make line plots with multidimensional coordinates. In this case, hue must be a dimension name, not a coordinate name.

    │ │ │ │
    In [151]: f, ax = plt.subplots(2, 1)
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [152]: da.plot.line(x="lon", hue="y", ax=ax[0])
    │ │ │ │  Out[152]: 
    │ │ │ │ -[<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff2f7c6a50>,
    │ │ │ │ - <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff2f6a3f90>,
    │ │ │ │ - <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff2f6bd890>,
    │ │ │ │ - <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff2f6bdad0>]
    │ │ │ │ +[<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff56c626d0>,
    │ │ │ │ + <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff56c72e10>,
    │ │ │ │ + <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff56c73190>,
    │ │ │ │ + <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff56c73550>]
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [153]: da.plot.line(x="lon", hue="x", ax=ax[1])
    │ │ │ │  Out[153]: 
    │ │ │ │ -[<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff2f6d8f50>,
    │ │ │ │ - <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff2f6d93d0>,
    │ │ │ │ - <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff2f6d9650>,
    │ │ │ │ - <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff2f6d9a10>,
    │ │ │ │ - <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff2f6d9cd0>]
    │ │ │ │ +[<matplotlib.lines.Line2D at 0xffff56c60ed0>,
    │ │ │ │ + <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff56c929d0>,
    │ │ │ │ + <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff56c92d10>,
    │ │ │ │ + <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff56c92fd0>,
    │ │ │ │ + <matplotlib.lines.Line2D at 0xffff56c93290>]
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ ../_images/plotting_example_2d_hue_xy.png │ │ │ │
    │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -541,15 +541,15 @@ │ │ │ │ │ --> 186 raise KeyError(key) │ │ │ │ │ 188 ref_name, var_name = split_key │ │ │ │ │ 189 ref_var = variables[ref_name] │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ KeyError: 'lat' │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [51]: b.plot() │ │ │ │ │ -Out[51]: [] │ │ │ │ │ +Out[51]: [] │ │ │ │ │ [../_images/plotting_nonuniform_coords.png] │ │ │ │ │ *** Other types of plot¶ *** │ │ │ │ │ There are several other options for plotting 2D data. │ │ │ │ │ Contour plot using DataArray.plot.contour() │ │ │ │ │ In [52]: air2d.plot.contour() │ │ │ │ │ --------------------------------------------------------------------------- │ │ │ │ │ NameError Traceback (most recent call last) │ │ │ │ │ @@ -1030,85 +1030,85 @@ │ │ │ │ │ * y (y) float64 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 1.0 │ │ │ │ │ * z (z) int64 0 1 2 3 │ │ │ │ │ * w (w) │ │ │ │ │ +Out[99]: │ │ │ │ │ [../_images/da_A_y.png] │ │ │ │ │ Same plot can be displayed using the dataset: │ │ │ │ │ In [100]: ds.plot.scatter(x="y", y="A") │ │ │ │ │ -Out[100]: │ │ │ │ │ +Out[100]: │ │ │ │ │ [../_images/ds_A_y.png] │ │ │ │ │ Now suppose we want to scatter the A DataArray against the B DataArray │ │ │ │ │ In [101]: ds.plot.scatter(x="A", y="B") │ │ │ │ │ -Out[101]: │ │ │ │ │ +Out[101]: │ │ │ │ │ [../_images/ds_simple_scatter.png] │ │ │ │ │ The hue kwarg lets you vary the color by variable value │ │ │ │ │ In [102]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", hue="w") │ │ │ │ │ -Out[102]: │ │ │ │ │ +Out[102]: │ │ │ │ │ [../_images/ds_hue_scatter.png] │ │ │ │ │ You can force a legend instead of a colorbar by setting add_legend=True, │ │ │ │ │ add_colorbar=False. │ │ │ │ │ In [103]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", hue="w", add_legend=True, │ │ │ │ │ add_colorbar=False) │ │ │ │ │ -Out[103]: │ │ │ │ │ +Out[103]: │ │ │ │ │ [../_images/ds_discrete_legend_hue_scatter.png] │ │ │ │ │ In [104]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", hue="w", add_legend=False, │ │ │ │ │ add_colorbar=True) │ │ │ │ │ -Out[104]: │ │ │ │ │ +Out[104]: │ │ │ │ │ [../_images/ds_discrete_colorbar_hue_scatter.png] │ │ │ │ │ The markersize kwarg lets you vary the point’s size by variable value. You │ │ │ │ │ can additionally pass size_norm to control how the variable’s values are │ │ │ │ │ mapped to point sizes. │ │ │ │ │ In [105]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", hue="y", markersize="z") │ │ │ │ │ -Out[105]: │ │ │ │ │ +Out[105]: │ │ │ │ │ [../_images/ds_hue_size_scatter.png] │ │ │ │ │ The z kwarg lets you plot the data along the z-axis as well. │ │ │ │ │ In [106]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", z="z", hue="y", markersize="x") │ │ │ │ │ -Out[106]: │ │ │ │ │ +Out[106]: │ │ │ │ │ [../_images/ds_hue_size_scatter_z.png] │ │ │ │ │ Faceting is also possible │ │ │ │ │ In [107]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", hue="y", markersize="x", row="x", │ │ │ │ │ col="w") │ │ │ │ │ -Out[107]: │ │ │ │ │ +Out[107]: │ │ │ │ │ [../_images/ds_facet_scatter.png] │ │ │ │ │ And adding the z-axis │ │ │ │ │ In [108]: ds.plot.scatter(x="A", y="B", z="z", hue="y", markersize="x", │ │ │ │ │ row="x", col="w") │ │ │ │ │ -Out[108]: │ │ │ │ │ +Out[108]: │ │ │ │ │ [../_images/ds_facet_scatter_z.png] │ │ │ │ │ For more advanced scatter plots, we recommend converting the relevant data │ │ │ │ │ variables to a pandas DataFrame and using the extensive plotting capabilities │ │ │ │ │ of seaborn. │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ **** Quiver¶ **** │ │ │ │ │ Visualizing vector fields is supported with quiver plots: │ │ │ │ │ In [109]: ds.isel(w=1, z=1).plot.quiver(x="x", y="y", u="A", v="B") │ │ │ │ │ -Out[109]: │ │ │ │ │ +Out[109]: │ │ │ │ │ [../_images/ds_simple_quiver.png] │ │ │ │ │ where u and v denote the x and y direction components of the arrow vectors. │ │ │ │ │ Again, faceting is also possible: │ │ │ │ │ In [110]: ds.plot.quiver(x="x", y="y", u="A", v="B", col="w", row="z", scale=4) │ │ │ │ │ -Out[110]: │ │ │ │ │ +Out[110]: │ │ │ │ │ [../_images/ds_facet_quiver.png] │ │ │ │ │ scale is required for faceted quiver plots. The scale determines the number of │ │ │ │ │ data units per arrow length unit, i.e. a smaller scale parameter makes the │ │ │ │ │ arrow longer. │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ **** Streamplot¶ **** │ │ │ │ │ Visualizing vector fields is also supported with streamline plots: │ │ │ │ │ In [111]: ds.isel(w=1, z=1).plot.streamplot(x="x", y="y", u="A", v="B") │ │ │ │ │ -Out[111]: │ │ │ │ │ +Out[111]: │ │ │ │ │ [../_images/ds_simple_streamplot.png] │ │ │ │ │ where u and v denote the x and y direction components of the vectors tangent to │ │ │ │ │ the streamlines. Again, faceting is also possible: │ │ │ │ │ In [112]: ds.plot.streamplot(x="x", y="y", u="A", v="B", col="w", row="z") │ │ │ │ │ -Out[112]: │ │ │ │ │ +Out[112]: │ │ │ │ │ [../_images/ds_facet_streamplot.png] │ │ │ │ │ ***** Maps¶ ***** │ │ │ │ │ To follow this section you’ll need to have Cartopy installed and working. │ │ │ │ │ This script will plot the air temperature on a map. │ │ │ │ │ In [113]: import cartopy.crs as ccrs │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [114]: air = xr.tutorial.open_dataset("air_temperature").air │ │ │ │ │ @@ -1221,24 +1221,24 @@ │ │ │ │ │ In [121]: import xarray.plot as xplt │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [122]: da = xr.DataArray(range(5)) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [123]: fig, axs = plt.subplots(ncols=2, nrows=2) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [124]: da.plot(ax=axs[0, 0]) │ │ │ │ │ -Out[124]: [] │ │ │ │ │ +Out[124]: [] │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [125]: da.plot.line(ax=axs[0, 1]) │ │ │ │ │ -Out[125]: [] │ │ │ │ │ +Out[125]: [] │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [126]: xplt.plot(da, ax=axs[1, 0]) │ │ │ │ │ -Out[126]: [] │ │ │ │ │ +Out[126]: [] │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [127]: xplt.line(da, ax=axs[1, 1]) │ │ │ │ │ -Out[127]: [] │ │ │ │ │ +Out[127]: [] │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [128]: plt.tight_layout() │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [129]: plt.draw() │ │ │ │ │ [../_images/plotting_ways_to_use.png] │ │ │ │ │ Here the output is the same. Since the data is 1 dimensional the line plot was │ │ │ │ │ used. │ │ │ │ │ @@ -1270,15 +1270,15 @@ │ │ │ │ │ [0., 0., 0.]]) │ │ │ │ │ Dimensions without coordinates: y, x │ │ │ │ │ The plot will produce an image corresponding to the values of the array. Hence │ │ │ │ │ the top left pixel will be a different color than the others. Before reading │ │ │ │ │ on, you may want to look at the coordinates and think carefully about what the │ │ │ │ │ limits, labels, and orientation for each of the axes should be. │ │ │ │ │ In [134]: a.plot() │ │ │ │ │ -Out[134]: │ │ │ │ │ +Out[134]: │ │ │ │ │ [../_images/plotting_example_2d_simple.png] │ │ │ │ │ It may seem strange that the values on the y axis are decreasing with -0.5 on │ │ │ │ │ the top. This is because the pixels are centered over their coordinates, and │ │ │ │ │ the axis labels and ranges correspond to the values of the coordinates. │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ **** Multidimensional coordinates¶ **** │ │ │ │ │ See also: Working_with_Multidimensional_Coordinates. │ │ │ │ │ @@ -1296,74 +1296,74 @@ │ │ │ │ │ .....: np.arange(20).reshape(4, 5), │ │ │ │ │ .....: dims=["y", "x"], │ │ │ │ │ .....: coords={"lat": (("y", "x"), lat), "lon": (("y", "x"), lon)}, │ │ │ │ │ .....: ) │ │ │ │ │ .....: │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [139]: da.plot.pcolormesh(x="lon", y="lat") │ │ │ │ │ -Out[139]: │ │ │ │ │ +Out[139]: │ │ │ │ │ [../_images/plotting_example_2d_irreg.png] │ │ │ │ │ Note that in this case, xarray still follows the pixel centered convention. │ │ │ │ │ This might be undesirable in some cases, for example when your data is defined │ │ │ │ │ on a polar projection (GH781). This is why the default is to not follow this │ │ │ │ │ convention when plotting on a map: │ │ │ │ │ In [140]: import cartopy.crs as ccrs │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [141]: ax = plt.subplot(projection=ccrs.PlateCarree()) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [142]: da.plot.pcolormesh(x="lon", y="lat", ax=ax) │ │ │ │ │ -Out[142]: │ │ │ │ │ +Out[142]: │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [143]: ax.scatter(lon, lat, transform=ccrs.PlateCarree()) │ │ │ │ │ -Out[143]: │ │ │ │ │ +Out[143]: │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [144]: ax.coastlines() │ │ │ │ │ -Out[144]: │ │ │ │ │ +Out[144]: │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [145]: ax.gridlines(draw_labels=True) │ │ │ │ │ -Out[145]: │ │ │ │ │ +Out[145]: │ │ │ │ │ [_build/html/_static/plotting_example_2d_irreg_map.png] │ │ │ │ │ You can however decide to infer the cell boundaries and use the infer_intervals │ │ │ │ │ keyword: │ │ │ │ │ In [146]: ax = plt.subplot(projection=ccrs.PlateCarree()) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [147]: da.plot.pcolormesh(x="lon", y="lat", ax=ax, infer_intervals=True) │ │ │ │ │ -Out[147]: │ │ │ │ │ +Out[147]: │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [148]: ax.scatter(lon, lat, transform=ccrs.PlateCarree()) │ │ │ │ │ -Out[148]: │ │ │ │ │ +Out[148]: │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [149]: ax.coastlines() │ │ │ │ │ -Out[149]: │ │ │ │ │ +Out[149]: │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [150]: ax.gridlines(draw_labels=True) │ │ │ │ │ -Out[150]: │ │ │ │ │ +Out[150]: │ │ │ │ │ [_build/html/_static/plotting_example_2d_irreg_map_infer.png] │ │ │ │ │ Note │ │ │ │ │ The data model of xarray does not support datasets with cell_boundaries yet. If │ │ │ │ │ you want to use these coordinates, you’ll have to make the plots outside the │ │ │ │ │ xarray framework. │ │ │ │ │ One can also make line plots with multidimensional coordinates. In this case, │ │ │ │ │ hue must be a dimension name, not a coordinate name. │ │ │ │ │ In [151]: f, ax = plt.subplots(2, 1) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [152]: da.plot.line(x="lon", hue="y", ax=ax[0]) │ │ │ │ │ Out[152]: │ │ │ │ │ -[, │ │ │ │ │ - , │ │ │ │ │ - , │ │ │ │ │ - ] │ │ │ │ │ +[, │ │ │ │ │ + , │ │ │ │ │ + , │ │ │ │ │ + ] │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [153]: da.plot.line(x="lon", hue="x", ax=ax[1]) │ │ │ │ │ Out[153]: │ │ │ │ │ -[, │ │ │ │ │ - , │ │ │ │ │ - , │ │ │ │ │ - , │ │ │ │ │ - ] │ │ │ │ │ +[, │ │ │ │ │ + , │ │ │ │ │ + , │ │ │ │ │ + , │ │ │ │ │ + ] │ │ │ │ │ [../_images/plotting_example_2d_hue_xy.png] │ │ │ │ │ [Logo] │ │ │ │ │ ****** xarray ****** │ │ │ │ │ **** Navigation **** │ │ │ │ │ For users │ │ │ │ │ * Getting_Started │ │ │ │ │ * User_Guide │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-xarray-doc/html/whats-new.html │ │ │ │ @@ -5855,15 +5855,15 @@ │ │ │ │
  • New xray.Dataset.where method for masking xray objects according │ │ │ │ to some criteria. This works particularly well with multi-dimensional data:

    │ │ │ │
    In [44]: ds = xray.Dataset(coords={"x": range(100), "y": range(100)})
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [45]: ds["distance"] = np.sqrt(ds.x**2 + ds.y**2)
    │ │ │ │  
    │ │ │ │  In [46]: ds.distance.where(ds.distance < 100).plot()
    │ │ │ │ -Out[46]: <matplotlib.collections.QuadMesh at 0xffff2dfc6190>
    │ │ │ │ +Out[46]: <matplotlib.collections.QuadMesh at 0xffff56821ad0>
    │ │ │ │  
    │ │ │ │
    │ │ │ │ _images/where_example.png │ │ │ │
  • │ │ │ │
  • Added new methods xray.DataArray.diff and xray.Dataset.diff │ │ │ │ for finite difference calculations along a given axis.

  • │ │ │ │
  • New xray.DataArray.to_masked_array convenience method for │ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -4049,15 +4049,15 @@ │ │ │ │ │ * New xray.Dataset.where method for masking xray objects according to some │ │ │ │ │ criteria. This works particularly well with multi-dimensional data: │ │ │ │ │ In [44]: ds = xray.Dataset(coords={"x": range(100), "y": range(100)}) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [45]: ds["distance"] = np.sqrt(ds.x**2 + ds.y**2) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [46]: ds.distance.where(ds.distance < 100).plot() │ │ │ │ │ - Out[46]: │ │ │ │ │ + Out[46]: │ │ │ │ │ [_images/where_example.png] │ │ │ │ │ * Added new methods xray.DataArray.diff and xray.Dataset.diff for finite │ │ │ │ │ difference calculations along a given axis. │ │ │ │ │ * New xray.DataArray.to_masked_array convenience method for returning a │ │ │ │ │ numpy.ma.MaskedArray. │ │ │ │ │ In [47]: da = xray.DataArray(np.random.random_sample(size=(5, 4)))