--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.uDxdEZgy/b1/python-gsd_3.4.2-2_amd64.changes +++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.uDxdEZgy/b2/python-gsd_3.4.2-2_amd64.changes ├── Files │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ - cb4df8329089c0d2bbfea57004a68e20 130548 doc optional python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ + 05fa2eb1b3cbbcba83b3d582d681eda7 130548 doc optional python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ d292387463d1c70be06cc32c96fe4147 729184 debug optional python3-gsd-dbgsym_3.4.2-2_amd64.deb │ 9aec2f15f8765558b8909d3b43a84345 240108 python optional python3-gsd_3.4.2-2_amd64.deb ├── python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ ├── control.tar.xz │ │ ├── control.tar │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ │┄ Files differ │ ├── data.tar.xz │ │ ├── data.tar │ │ │ ├── file list │ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23394 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 87525 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95444 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49306 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18756 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107555 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16660 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html │ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82983 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82975 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32666 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20931 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24988 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html │ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc-base/ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html │ │ │ │ @@ -355,23 +355,23 @@ │ │ │ │ Out[16]: np.uint64(5) │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ Out[17]: np.uint32(9) │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ -array([[0.6587104 , 0.44926068, 0.46102312], │ │ │ │ - [0.8177546 , 0.46207958, 0.31157792], │ │ │ │ - [0.7522318 , 0.00211997, 0.7365646 ], │ │ │ │ - [0.88860285, 0.21080942, 0.8253647 ], │ │ │ │ - [0.4947241 , 0.30927917, 0.8236138 ], │ │ │ │ - [0.86614054, 0.9529372 , 0.9758942 ], │ │ │ │ - [0.32370213, 0.6785074 , 0.32905838], │ │ │ │ - [0.07945602, 0.18482412, 0.77004075], │ │ │ │ - [0.4892382 , 0.63620627, 0.51282984]], dtype=float32) │ │ │ │ +array([[0.6445927 , 0.30257463, 0.93560404], │ │ │ │ + [0.7062959 , 0.24981451, 0.6450038 ], │ │ │ │ + [0.8071547 , 0.41861117, 0.19327118], │ │ │ │ + [0.5433319 , 0.85968965, 0.7729769 ], │ │ │ │ + [0.5569798 , 0.7018624 , 0.59116125], │ │ │ │ + [0.074754 , 0.7336609 , 0.76148283], │ │ │ │ + [0.26959607, 0.67829627, 0.25041246], │ │ │ │ + [0.4319761 , 0.01813121, 0.97822076], │ │ │ │ + [0.57069033, 0.68825364, 0.6119224 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │

gsd.hoomd.HOOMDTrajectory supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame.

│ │ │ │ │ │ │ │
│ │ │ │

Slicing and selection

│ │ │ │ @@ -398,21 +398,21 @@ │ │ │ │

Pure python reader

│ │ │ │
In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │  Out[25]: 
│ │ │ │ -array([[0.93597484, 0.00770861, 0.6878745 ],
│ │ │ │ -       [0.22518705, 0.29139107, 0.58219445],
│ │ │ │ -       [0.74045455, 0.9554393 , 0.9802988 ],
│ │ │ │ -       [0.22188787, 0.3922974 , 0.94384706],
│ │ │ │ -       [0.6613466 , 0.04142582, 0.5851629 ],
│ │ │ │ -       [0.8189621 , 0.16608794, 0.31175938],
│ │ │ │ -       [0.98262626, 0.4474086 , 0.02330586]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.6952934 , 0.7317643 , 0.85860634],
│ │ │ │ +       [0.3048382 , 0.93411565, 0.48257253],
│ │ │ │ +       [0.8222841 , 0.6026572 , 0.53318787],
│ │ │ │ +       [0.14096124, 0.06524213, 0.22731933],
│ │ │ │ +       [0.4567123 , 0.3795585 , 0.7970916 ],
│ │ │ │ +       [0.30712485, 0.6602531 , 0.27757013],
│ │ │ │ +       [0.00774679, 0.58231   , 0.571126  ]], dtype=float32)
│ │ │ │  
│ │ │ │
│ │ │ │

You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files │ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory. It │ │ │ │ only supports the rb mode and does not read files as fast as the C │ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with │ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.

│ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@ │ │ │ │ │ Out[16]: np.uint64(5) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ │ Out[17]: np.uint32(9) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ │ -array([[0.6587104 , 0.44926068, 0.46102312], │ │ │ │ │ - [0.8177546 , 0.46207958, 0.31157792], │ │ │ │ │ - [0.7522318 , 0.00211997, 0.7365646 ], │ │ │ │ │ - [0.88860285, 0.21080942, 0.8253647 ], │ │ │ │ │ - [0.4947241 , 0.30927917, 0.8236138 ], │ │ │ │ │ - [0.86614054, 0.9529372 , 0.9758942 ], │ │ │ │ │ - [0.32370213, 0.6785074 , 0.32905838], │ │ │ │ │ - [0.07945602, 0.18482412, 0.77004075], │ │ │ │ │ - [0.4892382 , 0.63620627, 0.51282984]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.6445927 , 0.30257463, 0.93560404], │ │ │ │ │ + [0.7062959 , 0.24981451, 0.6450038 ], │ │ │ │ │ + [0.8071547 , 0.41861117, 0.19327118], │ │ │ │ │ + [0.5433319 , 0.85968965, 0.7729769 ], │ │ │ │ │ + [0.5569798 , 0.7018624 , 0.59116125], │ │ │ │ │ + [0.074754 , 0.7336609 , 0.76148283], │ │ │ │ │ + [0.26959607, 0.67829627, 0.25041246], │ │ │ │ │ + [0.4319761 , 0.01813121, 0.97822076], │ │ │ │ │ + [0.57069033, 0.68825364, 0.6119224 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e. │ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ ********** │ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a │ │ │ │ │ trajectory. │ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r') │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@ │ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ ********** │ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb')) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f); │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position │ │ │ │ │ Out[25]: │ │ │ │ │ -array([[0.93597484, 0.00770861, 0.6878745 ], │ │ │ │ │ - [0.22518705, 0.29139107, 0.58219445], │ │ │ │ │ - [0.74045455, 0.9554393 , 0.9802988 ], │ │ │ │ │ - [0.22188787, 0.3922974 , 0.94384706], │ │ │ │ │ - [0.6613466 , 0.04142582, 0.5851629 ], │ │ │ │ │ - [0.8189621 , 0.16608794, 0.31175938], │ │ │ │ │ - [0.98262626, 0.4474086 , 0.02330586]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.6952934 , 0.7317643 , 0.85860634], │ │ │ │ │ + [0.3048382 , 0.93411565, 0.48257253], │ │ │ │ │ + [0.8222841 , 0.6026572 , 0.53318787], │ │ │ │ │ + [0.14096124, 0.06524213, 0.22731933], │ │ │ │ │ + [0.4567123 , 0.3795585 , 0.7970916 ], │ │ │ │ │ + [0.30712485, 0.6602531 , 0.27757013], │ │ │ │ │ + [0.00774679, 0.58231 , 0.571126 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only │ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation. │ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO │ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet. │ │ │ │ │ Warning │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible. │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ ├── js-beautify {} │ │ │ │ │ @@ -1893,177 +1893,177 @@ │ │ │ │ │ "12": "py:property", │ │ │ │ │ "13": "std:chunk", │ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption" │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ "terms": { │ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 8, 11, 13, 14, 18, 21], │ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ - "00211997": 8, │ │ │ │ │ - "00770861": 8, │ │ │ │ │ - "02330586": 8, │ │ │ │ │ - "04142582": 8, │ │ │ │ │ - "07945602": 8, │ │ │ │ │ + "00774679": 8, │ │ │ │ │ + "01813121": 8, │ │ │ │ │ + "06524213": 8, │ │ │ │ │ + "074754": 8, │ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6, │ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6, │ │ │ │ │ "1": [0, 7, 8, 12, 14, 15, 16, 18, 19, 20], │ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21], │ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14, 21], │ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "127": 1, │ │ │ │ │ "13": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "13_gsd": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "14": [7, 8, 11, 14], │ │ │ │ │ + "14096124": 8, │ │ │ │ │ "15": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "16": [0, 6, 7, 8, 14], │ │ │ │ │ - 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"29139107": 8, │ │ │ │ │ "2d": [14, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ "2gib": 1, │ │ │ │ │ "3": [7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ "30": [7, 8], │ │ │ │ │ "300": [8, 15], │ │ │ │ │ + "30257463": 8, │ │ │ │ │ + "3048382": 8, │ │ │ │ │ + "30712485": 8, │ │ │ │ │ "308": 1, │ │ │ │ │ - "30927917": 8, │ │ │ │ │ "31": [7, 8], │ │ │ │ │ - "31157792": 8, │ │ │ │ │ - "31175938": 8, │ │ │ │ │ "317": 1, │ │ │ │ │ "319": 1, │ │ │ │ │ "32": [0, 6, 7, 18], │ │ │ │ │ "322": 1, │ │ │ │ │ "323": 1, │ │ │ │ │ - "32370213": 8, │ │ │ │ │ "324": 1, │ │ │ │ │ "325": 1, │ │ │ │ │ - "32905838": 8, │ │ │ │ │ "33": 7, │ │ │ │ │ "34": 7, │ │ │ │ │ "35": 7, │ │ │ │ │ "36": 7, │ │ │ │ │ "365": 1, │ │ │ │ │ "367": 1, │ │ │ │ │ "37": 7, │ │ │ │ │ "376": 1, │ │ │ │ │ + "3795585": 8, │ │ │ │ │ "38": 7, │ │ │ │ │ "388": 1, │ │ │ │ │ "39": 7, │ │ │ │ │ "391": 1, │ │ │ │ │ - "3922974": 8, │ │ │ │ │ "3d": 20, │ │ │ │ │ "4": [7, 8, 14, 15, 18, 21], │ │ │ │ │ "40": 7, │ │ │ │ │ "400": [8, 15], │ │ │ │ │ "405": 1, │ │ │ │ │ "41": 7, │ │ │ │ │ + "41861117": 8, │ │ │ │ │ "43": 7, │ │ │ │ │ + "4319761": 8, │ │ │ │ │ "44": 7, │ │ │ │ │ - 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