--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.hQiaXtfU/b1/python-gsd_3.4.2-2_armhf.changes +++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.hQiaXtfU/b2/python-gsd_3.4.2-2_armhf.changes ├── Files │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ - 00cb487bf8df28abb501d157c5713d65 130544 doc optional python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ + c01314ba1020b047cb03be6601a8f4a2 130536 doc optional python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ 59252931f497901ad85b6e278961f4cc 355860 debug optional python3-gsd-dbgsym_3.4.2-2_armhf.deb │ 9f0fa1a2cbc62411ecd01025c21383ad 200616 python optional python3-gsd_3.4.2-2_armhf.deb ├── python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ ├── file list │ │ @@ -1,3 +1,3 @@ │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2025-02-13 09:32:12.000000 debian-binary │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 2700 2025-02-13 09:32:12.000000 control.tar.xz │ │ --rw-r--r-- 0 0 0 127652 2025-02-13 09:32:12.000000 data.tar.xz │ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 127644 2025-02-13 09:32:12.000000 data.tar.xz │ ├── control.tar.xz │ │ ├── control.tar │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ │┄ Files differ │ ├── data.tar.xz │ │ ├── data.tar │ │ │ ├── file list │ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23394 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 87525 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95444 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49306 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18756 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107555 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16660 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html │ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82990 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82983 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32666 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20931 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24988 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html │ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc-base/ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html │ │ │ │ @@ -355,23 +355,23 @@ │ │ │ │ Out[16]: np.uint64(5) │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ Out[17]: np.uint32(9) │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ -array([[0.28861293, 0.24445729, 0.11143561], │ │ │ │ - [0.23964292, 0.38614786, 0.3484118 ], │ │ │ │ - [0.7673602 , 0.04699338, 0.82391745], │ │ │ │ - [0.27330285, 0.7306411 , 0.69458675], │ │ │ │ - [0.16253987, 0.60288006, 0.5364511 ], │ │ │ │ - [0.89827794, 0.57969224, 0.31890783], │ │ │ │ - [0.45861682, 0.71743286, 0.8853235 ], │ │ │ │ - [0.04801974, 0.05253262, 0.64556485], │ │ │ │ - [0.24520579, 0.8756623 , 0.6555564 ]], dtype=float32) │ │ │ │ +array([[0.18955067, 0.28821677, 0.5523639 ], │ │ │ │ + [0.42437023, 0.7364824 , 0.856894 ], │ │ │ │ + [0.7921511 , 0.60222566, 0.16554561], │ │ │ │ + [0.30838338, 0.84254134, 0.9572028 ], │ │ │ │ + [0.42005482, 0.04260594, 0.6794065 ], │ │ │ │ + [0.57150155, 0.9974386 , 0.5316491 ], │ │ │ │ + [0.58772916, 0.98219293, 0.4239369 ], │ │ │ │ + [0.8248618 , 0.7005194 , 0.4818421 ], │ │ │ │ + [0.36100778, 0.12169699, 0.07008794]], dtype=float32) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │

gsd.hoomd.HOOMDTrajectory supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame.

│ │ │ │ │ │ │ │
│ │ │ │

Slicing and selection

│ │ │ │ @@ -398,21 +398,21 @@ │ │ │ │

Pure python reader

│ │ │ │
In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │  Out[25]: 
│ │ │ │ -array([[0.6357189 , 0.80133295, 0.36584696],
│ │ │ │ -       [0.61411136, 0.24396345, 0.71334565],
│ │ │ │ -       [0.7034281 , 0.92311543, 0.66486835],
│ │ │ │ -       [0.47336686, 0.27450004, 0.4091616 ],
│ │ │ │ -       [0.76607084, 0.46327472, 0.5944516 ],
│ │ │ │ -       [0.56081045, 0.18628697, 0.43827784],
│ │ │ │ -       [0.2605502 , 0.07490265, 0.01147028]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.90156764, 0.8365069 , 0.68152654],
│ │ │ │ +       [0.38676324, 0.9341422 , 0.6059404 ],
│ │ │ │ +       [0.8776121 , 0.52937365, 0.83611006],
│ │ │ │ +       [0.47555158, 0.3039558 , 0.28582063],
│ │ │ │ +       [0.8606525 , 0.34816742, 0.35211864],
│ │ │ │ +       [0.47869802, 0.03292407, 0.09256083],
│ │ │ │ +       [0.84471273, 0.94907176, 0.21252356]], dtype=float32)
│ │ │ │  
│ │ │ │
│ │ │ │

You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files │ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory. It │ │ │ │ only supports the rb mode and does not read files as fast as the C │ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with │ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.

│ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@ │ │ │ │ │ Out[16]: np.uint64(5) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ │ Out[17]: np.uint32(9) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ │ -array([[0.28861293, 0.24445729, 0.11143561], │ │ │ │ │ - [0.23964292, 0.38614786, 0.3484118 ], │ │ │ │ │ - [0.7673602 , 0.04699338, 0.82391745], │ │ │ │ │ - [0.27330285, 0.7306411 , 0.69458675], │ │ │ │ │ - [0.16253987, 0.60288006, 0.5364511 ], │ │ │ │ │ - [0.89827794, 0.57969224, 0.31890783], │ │ │ │ │ - [0.45861682, 0.71743286, 0.8853235 ], │ │ │ │ │ - [0.04801974, 0.05253262, 0.64556485], │ │ │ │ │ - [0.24520579, 0.8756623 , 0.6555564 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.18955067, 0.28821677, 0.5523639 ], │ │ │ │ │ + [0.42437023, 0.7364824 , 0.856894 ], │ │ │ │ │ + [0.7921511 , 0.60222566, 0.16554561], │ │ │ │ │ + [0.30838338, 0.84254134, 0.9572028 ], │ │ │ │ │ + [0.42005482, 0.04260594, 0.6794065 ], │ │ │ │ │ + [0.57150155, 0.9974386 , 0.5316491 ], │ │ │ │ │ + [0.58772916, 0.98219293, 0.4239369 ], │ │ │ │ │ + [0.8248618 , 0.7005194 , 0.4818421 ], │ │ │ │ │ + [0.36100778, 0.12169699, 0.07008794]], dtype=float32) │ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e. │ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ ********** │ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a │ │ │ │ │ trajectory. │ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r') │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@ │ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ ********** │ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb')) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f); │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position │ │ │ │ │ Out[25]: │ │ │ │ │ -array([[0.6357189 , 0.80133295, 0.36584696], │ │ │ │ │ - [0.61411136, 0.24396345, 0.71334565], │ │ │ │ │ - [0.7034281 , 0.92311543, 0.66486835], │ │ │ │ │ - [0.47336686, 0.27450004, 0.4091616 ], │ │ │ │ │ - [0.76607084, 0.46327472, 0.5944516 ], │ │ │ │ │ - [0.56081045, 0.18628697, 0.43827784], │ │ │ │ │ - [0.2605502 , 0.07490265, 0.01147028]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.90156764, 0.8365069 , 0.68152654], │ │ │ │ │ + [0.38676324, 0.9341422 , 0.6059404 ], │ │ │ │ │ + [0.8776121 , 0.52937365, 0.83611006], │ │ │ │ │ + [0.47555158, 0.3039558 , 0.28582063], │ │ │ │ │ + [0.8606525 , 0.34816742, 0.35211864], │ │ │ │ │ + [0.47869802, 0.03292407, 0.09256083], │ │ │ │ │ + [0.84471273, 0.94907176, 0.21252356]], dtype=float32) │ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only │ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation. │ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO │ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet. │ │ │ │ │ Warning │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible. │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ ├── js-beautify {} │ │ │ │ │ @@ -1893,177 +1893,177 @@ │ │ │ │ │ "12": "py:property", │ │ │ │ │ "13": "std:chunk", │ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption" │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ "terms": { │ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 8, 11, 13, 14, 18, 21], │ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ - "01147028": 8, │ │ │ │ │ - "04699338": 8, │ │ │ │ │ - "04801974": 8, │ │ │ │ │ - "05253262": 8, │ │ │ │ │ - "07490265": 8, │ │ │ │ │ + "03292407": 8, │ │ │ │ │ + "04260594": 8, │ │ │ │ │ + "07008794": 8, │ │ │ │ │ + "09256083": 8, │ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6, │ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6, │ │ │ │ │ "1": [0, 7, 8, 12, 14, 15, 16, 18, 19, 20], │ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21], │ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14, 21], │ │ │ │ │ - "11143561": 8, │ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ + "12169699": 8, │ │ │ │ │ "127": 1, │ │ │ │ │ "13": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "13_gsd": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "14": [7, 8, 11, 14], │ │ │ │ │ "15": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "16": [0, 6, 7, 8, 14], │ │ │ │ │ - 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"92311543": 8, │ │ │ │ │ + "90156764": 8, │ │ │ │ │ + "9341422": 8, │ │ │ │ │ + "94907176": 8, │ │ │ │ │ + "9572028": 8, │ │ │ │ │ + "98219293": 8, │ │ │ │ │ + "9974386": 8, │ │ │ │ │ "A": [0, 5, 6, 8, 9, 12, 18, 19], │ │ │ │ │ "AND": 12, │ │ │ │ │ "AS": 12, │ │ │ │ │ "As": 15, │ │ │ │ │ "BE": 12, │ │ │ │ │ "BUT": 12, │ │ │ │ │ "BY": 12,