--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.Tk2fiD7W/b1/python-gsd_3.4.2-2_i386.changes +++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.Tk2fiD7W/b2/python-gsd_3.4.2-2_i386.changes ├── Files │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ - f1d94368f2b0809de1ed901d1b89d025 130524 doc optional python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ + 9f9e75002949dc166d10de4296482bea 130556 doc optional python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ 91ed88a969bb09d6fe123a3fa33a9901 687428 debug optional python3-gsd-dbgsym_3.4.2-2_i386.deb │ 65b0310c828496488bf51013f01d308a 240920 python optional python3-gsd_3.4.2-2_i386.deb ├── python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ ├── file list │ │ @@ -1,3 +1,3 @@ │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2025-02-13 09:32:12.000000 debian-binary │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 2700 2025-02-13 09:32:12.000000 control.tar.xz │ │ --rw-r--r-- 0 0 0 127632 2025-02-13 09:32:12.000000 data.tar.xz │ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 127664 2025-02-13 09:32:12.000000 data.tar.xz │ ├── control.tar.xz │ │ ├── control.tar │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ │┄ Files differ │ ├── data.tar.xz │ │ ├── data.tar │ │ │ ├── file list │ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23394 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 87525 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95444 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49306 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18756 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107555 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16660 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html │ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82979 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82986 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32666 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20931 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24988 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html │ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc-base/ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html │ │ │ │ @@ -355,23 +355,23 @@ │ │ │ │ Out[16]: np.uint64(5) │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ Out[17]: np.uint32(9) │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ -array([[0.87231 , 0.72310317, 0.54790103], │ │ │ │ - [0.8545118 , 0.7364721 , 0.16672318], │ │ │ │ - [0.9876071 , 0.23616505, 0.45114356], │ │ │ │ - [0.30442265, 0.14542492, 0.93165445], │ │ │ │ - [0.361704 , 0.49487624, 0.645563 ], │ │ │ │ - [0.65410763, 0.90310967, 0.9968178 ], │ │ │ │ - [0.33137575, 0.28441352, 0.22736734], │ │ │ │ - [0.5574603 , 0.16157703, 0.6035545 ], │ │ │ │ - [0.09605698, 0.17810859, 0.5396191 ]], dtype=float32) │ │ │ │ +array([[0.04004173, 0.6852082 , 0.4645165 ], │ │ │ │ + [0.35417596, 0.28106087, 0.8575941 ], │ │ │ │ + [0.10062465, 0.3943242 , 0.9555284 ], │ │ │ │ + [0.87036914, 0.37900513, 0.73263526], │ │ │ │ + [0.48710957, 0.54866165, 0.10004098], │ │ │ │ + [0.77787924, 0.5465128 , 0.9337087 ], │ │ │ │ + [0.42388943, 0.78668076, 0.83996975], │ │ │ │ + [0.86929494, 0.21025875, 0.07424699], │ │ │ │ + [0.6271071 , 0.97841203, 0.5575535 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │

gsd.hoomd.HOOMDTrajectory supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame.

│ │ │ │ │ │ │ │
│ │ │ │

Slicing and selection

│ │ │ │ @@ -398,21 +398,21 @@ │ │ │ │

Pure python reader

│ │ │ │
In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │  Out[25]: 
│ │ │ │ -array([[0.43101472, 0.01768122, 0.6152548 ],
│ │ │ │ -       [0.35970965, 0.61762303, 0.35206166],
│ │ │ │ -       [0.55421823, 0.97202975, 0.81779563],
│ │ │ │ -       [0.714984  , 0.7646258 , 0.4755939 ],
│ │ │ │ -       [0.29615712, 0.4360736 , 0.01195396],
│ │ │ │ -       [0.01378267, 0.4877474 , 0.81022733],
│ │ │ │ -       [0.19020946, 0.514359  , 0.40238523]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.49076432, 0.85442984, 0.7782259 ],
│ │ │ │ +       [0.21614397, 0.5161107 , 0.12312242],
│ │ │ │ +       [0.34702963, 0.17594916, 0.5366333 ],
│ │ │ │ +       [0.97524375, 0.17601402, 0.2514957 ],
│ │ │ │ +       [0.48414803, 0.37251237, 0.6270297 ],
│ │ │ │ +       [0.6186352 , 0.22973995, 0.22756504],
│ │ │ │ +       [0.84015846, 0.34329876, 0.3896865 ]], dtype=float32)
│ │ │ │  
│ │ │ │
│ │ │ │

You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files │ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory. It │ │ │ │ only supports the rb mode and does not read files as fast as the C │ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with │ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.

│ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@ │ │ │ │ │ Out[16]: np.uint64(5) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ │ Out[17]: np.uint32(9) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ │ -array([[0.87231 , 0.72310317, 0.54790103], │ │ │ │ │ - [0.8545118 , 0.7364721 , 0.16672318], │ │ │ │ │ - [0.9876071 , 0.23616505, 0.45114356], │ │ │ │ │ - [0.30442265, 0.14542492, 0.93165445], │ │ │ │ │ - [0.361704 , 0.49487624, 0.645563 ], │ │ │ │ │ - [0.65410763, 0.90310967, 0.9968178 ], │ │ │ │ │ - [0.33137575, 0.28441352, 0.22736734], │ │ │ │ │ - [0.5574603 , 0.16157703, 0.6035545 ], │ │ │ │ │ - [0.09605698, 0.17810859, 0.5396191 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.04004173, 0.6852082 , 0.4645165 ], │ │ │ │ │ + [0.35417596, 0.28106087, 0.8575941 ], │ │ │ │ │ + [0.10062465, 0.3943242 , 0.9555284 ], │ │ │ │ │ + [0.87036914, 0.37900513, 0.73263526], │ │ │ │ │ + [0.48710957, 0.54866165, 0.10004098], │ │ │ │ │ + [0.77787924, 0.5465128 , 0.9337087 ], │ │ │ │ │ + [0.42388943, 0.78668076, 0.83996975], │ │ │ │ │ + [0.86929494, 0.21025875, 0.07424699], │ │ │ │ │ + [0.6271071 , 0.97841203, 0.5575535 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e. │ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ ********** │ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a │ │ │ │ │ trajectory. │ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r') │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@ │ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ ********** │ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb')) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f); │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position │ │ │ │ │ Out[25]: │ │ │ │ │ -array([[0.43101472, 0.01768122, 0.6152548 ], │ │ │ │ │ - [0.35970965, 0.61762303, 0.35206166], │ │ │ │ │ - [0.55421823, 0.97202975, 0.81779563], │ │ │ │ │ - [0.714984 , 0.7646258 , 0.4755939 ], │ │ │ │ │ - [0.29615712, 0.4360736 , 0.01195396], │ │ │ │ │ - [0.01378267, 0.4877474 , 0.81022733], │ │ │ │ │ - [0.19020946, 0.514359 , 0.40238523]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.49076432, 0.85442984, 0.7782259 ], │ │ │ │ │ + [0.21614397, 0.5161107 , 0.12312242], │ │ │ │ │ + [0.34702963, 0.17594916, 0.5366333 ], │ │ │ │ │ + [0.97524375, 0.17601402, 0.2514957 ], │ │ │ │ │ + [0.48414803, 0.37251237, 0.6270297 ], │ │ │ │ │ + [0.6186352 , 0.22973995, 0.22756504], │ │ │ │ │ + [0.84015846, 0.34329876, 0.3896865 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only │ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation. │ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO │ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet. │ │ │ │ │ Warning │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible. │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ ├── js-beautify {} │ │ │ │ │ @@ -1893,177 +1893,177 @@ │ │ │ │ │ "12": "py:property", │ │ │ │ │ "13": "std:chunk", │ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption" │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ "terms": { │ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 8, 11, 13, 14, 18, 21], │ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ - "01195396": 8, │ │ │ │ │ - "01378267": 8, │ │ │ │ │ - "01768122": 8, │ │ │ │ │ - "09605698": 8, │ │ │ │ │ + "04004173": 8, │ │ │ │ │ + "07424699": 8, │ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6, │ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6, │ │ │ │ │ "1": [0, 7, 8, 12, 14, 15, 16, 18, 19, 20], │ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21], │ │ │ │ │ + "10004098": 8, │ │ │ │ │ + "10062465": 8, │ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14, 21], │ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ + "12312242": 8, │ │ │ │ │ "127": 1, │ │ │ │ │ "13": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "13_gsd": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "14": [7, 8, 11, 14], │ │ │ │ │ - "14542492": 8, │ │ │ │ │ "15": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "16": [0, 6, 7, 8, 14], │ │ │ │ │ - "16157703": 8, │ │ │ │ │ - "16672318": 8, │ │ │ │ │ "17": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ - "17810859": 8, │ │ │ │ │ + "17594916": 8, │ │ │ │ │ + "17601402": 8, │ │ │ │ │ "18": [7, 8, 11], │ │ │ │ │ "19": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ - "19020946": 8, │ │ │ │ │ "1d": [14, 16], │ │ │ │ │ "1x1": [18, 19], │ │ │ │ │ "2": [0, 7, 8, 11, 12, 14, 15, 16, 18, 19, 20], │ │ │ │ │ "20": [7, 8], │ │ │ │ │ "200": [8, 15], │ │ │ │ │ "2016": 12, │ │ │ │ │ "2019": 11, │ │ │ │ │ "2022": 11, │ │ │ │ │ "2024": 12, │ │ │ │ │ "21": [7, 8], │ │ │ │ │ + "21025875": 8, │ │ │ │ │ + "21614397": 8, │ │ │ │ │ "22": [7, 8, 11], │ │ │ │ │ - "22736734": 8, │ │ │ │ │ + "22756504": 8, │ │ │ │ │ + "22973995": 8, │ │ │ │ │ "23": [7, 8], │ │ │ │ │ "235": 1, │ │ │ │ │ - "23616505": 8, │ │ │ │ │ "237": 1, │ │ │ │ │ "238": 1, │ │ │ │ │ "24": [7, 8], │ │ │ │ │ "249": 1, │ │ │ │ │ "25": [7, 8], │ │ │ │ │ + "2514957": 8, │ │ │ │ │ "255": 1, │ │ │ │ │ "256": [0, 6], │ │ │ │ │ "257": 1, │ │ │ │ │ "26": [7, 8], │ │ │ │ │ "266": 1, │ │ │ │ │ "267": 1, │ │ │ │ │ "27": [7, 8], │ │ │ │ │ "270": 1, │ │ │ │ │ "28": [7, 8], │ │ │ │ │ + "28106087": 8, │ │ │ │ │ "283": 1, │ │ │ │ │ - "28441352": 8, │ │ │ │ │ "29": [7, 8], │ │ │ │ │ - "29615712": 8, │ │ │ │ │ "2d": [14, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ "2gib": 1, │ │ │ │ │ "3": [7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ "30": [7, 8], │ │ │ │ │ "300": [8, 15], │ │ │ │ │ - "30442265": 8, │ │ │ │ │ "308": 1, │ │ │ │ │ "31": [7, 8], │ │ │ │ │ "317": 1, │ │ │ │ │ "319": 1, │ │ │ │ │ "32": [0, 6, 7, 18], │ │ │ │ │ "322": 1, │ │ │ │ │ "323": 1, │ │ │ │ │ "324": 1, │ │ │ │ │ "325": 1, │ │ │ │ │ "33": 7, │ │ │ │ │ - "33137575": 8, │ │ │ │ │ "34": 7, │ │ │ │ │ + "34329876": 8, │ │ │ │ │ + "34702963": 8, │ │ │ │ │ "35": 7, │ │ │ │ │ - "35206166": 8, │ │ │ │ │ - "35970965": 8, │ │ │ │ │ + "35417596": 8, │ │ │ │ │ "36": 7, │ │ │ │ │ - "361704": 8, │ │ │ │ │ "365": 1, │ │ │ │ │ "367": 1, │ │ │ │ │ "37": 7, │ │ │ │ │ + "37251237": 8, │ │ │ │ │ "376": 1, │ │ │ │ │ + "37900513": 8, │ │ │ │ │ "38": 7, │ │ │ │ │ "388": 1, │ │ │ │ │ + "3896865": 8, │ │ │ │ │ "39": 7, │ │ │ │ │ "391": 1, │ │ │ │ │ + "3943242": 8, │ │ │ │ │ "3d": 20, │ │ │ │ │ "4": [7, 8, 14, 15, 18, 21], │ │ │ │ │ "40": 7, │ │ │ │ │ "400": [8, 15], │ │ │ │ │ - "40238523": 8, │ │ │ │ │ "405": 1, │ │ │ │ │ "41": 7, │ │ │ │ │ + "42388943": 8, │ │ │ │ │ "43": 7, │ │ │ │ │ - "43101472": 8, │ │ │ │ │ - "4360736": 8, │ │ │ │ │ "44": 7, │ │ │ │ │ "45": 7, │ │ │ │ │ - "45114356": 8, │ │ │ │ │ "46": 7, │ │ │ │ │ + "4645165": 8, │ │ │ │ │ "47": 7, │ │ │ │ │ - "4755939": 8, │ │ │ │ │ "48": 7, │ │ │ │ │ - "4877474": 8, │ │ │ │ │ + "48414803": 8, │ │ │ │ │ + "48710957": 8, │ │ │ │ │ "49": 7, │ │ │ │ │ - "49487624": 8, │ │ │ │ │ + "49076432": 8, │ │ │ │ │ "5": [7, 8, 14, 15, 19], │ │ │ │ │ "50": 7, │ │ │ │ │ "500": [8, 15], │ │ │ │ │ "51": 7, │ │ │ │ │ - "514359": 8, │ │ │ │ │ + "5161107": 8, │ │ │ │ │ "52": 7, │ │ │ │ │ "53": [0, 7], │ │ │ │ │ - "5396191": 8, │ │ │ │ │ + "5366333": 8, │ │ │ │ │ "54": 7, │ │ │ │ │ - "54790103": 8, │ │ │ │ │ + "5465128": 8, │ │ │ │ │ + "54866165": 8, │ │ │ │ │ "55": 7, │ │ │ │ │ - "55421823": 8, │ │ │ │ │ - "5574603": 8, │ │ │ │ │ + "5575535": 8, │ │ │ │ │ "6": [7, 8, 14, 15], │ │ │ │ │ "600": [8, 15], │ │ │ │ │ - "6035545": 8, │ │ │ │ │ - "6152548": 8, │ │ │ │ │ - "61762303": 8, │ │ │ │ │ + "6186352": 8, │ │ │ │ │ "627": 8, │ │ │ │ │ + "6270297": 8, │ │ │ │ │ + "6271071": 8, │ │ │ │ │ "63": [0, 6], │ │ │ │ │ "64": [0, 6, 11], │ │ │ │ │ "645": 7, │ │ │ │ │ - "645563": 8, │ │ │ │ │ - "65410763": 8, │ │ │ │ │ "65535": 6, │ │ │ │ │ + "6852082": 8, │ │ │ │ │ "6x1": 18, │ │ │ │ │ "7": [7, 8, 14, 15, 19], │ │ │ │ │ "70": 14, │ │ │ │ │ "700": [8, 15], │ │ │ │ │ - "714984": 8, │ │ │ │ │ - "72310317": 8, │ │ │ │ │ - "7364721": 8, │ │ │ │ │ + "73263526": 8, │ │ │ │ │ "758": 14, │ │ │ │ │ - "7646258": 8, │ │ │ │ │ "771": 14, │ │ │ │ │ + "77787924": 8, │ │ │ │ │ + "7782259": 8, │ │ │ │ │ "785": 8, │ │ │ │ │ "786": 8, │ │ │ │ │ + "78668076": 8, │ │ │ │ │ "787": 8, │ │ │ │ │ "789": 8, │ │ │ │ │ "8": [0, 6, 7, 8, 14, 15, 18, 19], │ │ │ │ │ "80": [6, 14, 21], │ │ │ │ │ "800": [8, 15], │ │ │ │ │ - "81022733": 8, │ │ │ │ │ - "81779563": 8, │ │ │ │ │ - "8545118": 8, │ │ │ │ │ - "87231": 8, │ │ │ │ │ + "83996975": 8, │ │ │ │ │ + "84015846": 8, │ │ │ │ │ + "85442984": 8, │ │ │ │ │ + "8575941": 8, │ │ │ │ │ + "86929494": 8, │ │ │ │ │ + "87036914": 8, │ │ │ │ │ "9": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "90": 14, │ │ │ │ │ "900": [8, 15], │ │ │ │ │ - "90310967": 8, │ │ │ │ │ - "93165445": 8, │ │ │ │ │ - "97202975": 8, │ │ │ │ │ - "9876071": 8, │ │ │ │ │ - "9968178": 8, │ │ │ │ │ + "9337087": 8, │ │ │ │ │ + "9555284": 8, │ │ │ │ │ + "97524375": 8, │ │ │ │ │ + "97841203": 8, │ │ │ │ │ "A": [0, 5, 6, 8, 9, 12, 18, 19], │ │ │ │ │ "AND": 12, │ │ │ │ │ "AS": 12, │ │ │ │ │ "As": 15, │ │ │ │ │ "BE": 12, │ │ │ │ │ "BUT": 12, │ │ │ │ │ "BY": 12,