--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.lYyvG8dy/b1/python-gsd_4.0.0-1_amd64.changes
+++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.lYyvG8dy/b2/python-gsd_4.0.0-1_amd64.changes
├── Files
│ @@ -1,4 +1,4 @@
│
│ - 6616013932e9151835cceb14f9e36500 122480 doc optional python-gsd-doc_4.0.0-1_all.deb
│ + 652f1f4e84b222e1c4c4cbb852a36009 122456 doc optional python-gsd-doc_4.0.0-1_all.deb
│ d87cd6831dde921ada279435f407c06d 362300 debug optional python3-gsd-dbgsym_4.0.0-1_amd64.deb
│ 7f9647f73192c62530ad5b20c3c04475 208964 python optional python3-gsd_4.0.0-1_amd64.deb
├── python-gsd-doc_4.0.0-1_all.deb
│ ├── file list
│ │ @@ -1,3 +1,3 @@
│ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2025-08-11 08:32:38.000000 debian-binary
│ │ -rw-r--r-- 0 0 0 2708 2025-08-11 08:32:38.000000 control.tar.xz
│ │ --rw-r--r-- 0 0 0 119580 2025-08-11 08:32:38.000000 data.tar.xz
│ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 119556 2025-08-11 08:32:38.000000 data.tar.xz
│ ├── control.tar.xz
│ │ ├── control.tar
│ │ │ ├── ./md5sums
│ │ │ │ ├── ./md5sums
│ │ │ │ │┄ Files differ
│ ├── data.tar.xz
│ │ ├── data.tar
│ │ │ ├── file list
│ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23272 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 88696 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95626 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49510 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18753 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107552 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16657 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html
│ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 73229 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js
│ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 73241 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32663 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20809 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24982 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html
│ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc-base/
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd
│ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js
│ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2025-08-11 08:32:38.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js
│ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html
│ │ │ │ @@ -354,23 +354,23 @@
│ │ │ │ Out[16]: np.uint64(5)
│ │ │ │
│ │ │ │ In [17]: frame.particles.N
│ │ │ │ Out[17]: np.uint32(9)
│ │ │ │
│ │ │ │ In [18]: frame.particles.position
│ │ │ │ Out[18]:
│ │ │ │ -array([[0.2448324 , 0.4248788 , 0.03036282],
│ │ │ │ - [0.09682854, 0.5456384 , 0.03632759],
│ │ │ │ - [0.05022744, 0.04346096, 0.7365458 ],
│ │ │ │ - [0.18079156, 0.7473205 , 0.51275426],
│ │ │ │ - [0.7295292 , 0.37780795, 0.9342821 ],
│ │ │ │ - [0.805061 , 0.6408879 , 0.67015564],
│ │ │ │ - [0.6312153 , 0.35059008, 0.8324852 ],
│ │ │ │ - [0.78022105, 0.32808965, 0.18684301],
│ │ │ │ - [0.65824497, 0.21917616, 0.61023533]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.8300317 , 0.6433904 , 0.88677955],
│ │ │ │ + [0.9174645 , 0.28754658, 0.7540563 ],
│ │ │ │ + [0.7841679 , 0.73606324, 0.03237678],
│ │ │ │ + [0.07652885, 0.78441316, 0.26030752],
│ │ │ │ + [0.6771271 , 0.24711876, 0.89931047],
│ │ │ │ + [0.28426662, 0.08380098, 0.07250234],
│ │ │ │ + [0.06633534, 0.76704437, 0.22600213],
│ │ │ │ + [0.8664561 , 0.89306444, 0.8969469 ],
│ │ │ │ + [0.5709988 , 0.11224406, 0.94705933]], dtype=float32)
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
gsd.hoomd.HOOMDTrajectory
supports random indexing of frames in the file.
│ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame
.
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ Slicing and selection
│ │ │ │ @@ -397,21 +397,21 @@
│ │ │ │ Pure python reader
│ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │
│ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │
│ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │ Out[25]:
│ │ │ │ -array([[0.57121 , 0.731209 , 0.35579365],
│ │ │ │ - [0.41756624, 0.9366235 , 0.6583382 ],
│ │ │ │ - [0.641247 , 0.1326517 , 0.628977 ],
│ │ │ │ - [0.29231876, 0.8117944 , 0.8759391 ],
│ │ │ │ - [0.20119959, 0.5564307 , 0.46785906],
│ │ │ │ - [0.6268789 , 0.2843572 , 0.11323138],
│ │ │ │ - [0.75064737, 0.11587842, 0.03046744]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.5927836 , 0.32609093, 0.04699515],
│ │ │ │ + [0.32690832, 0.98091334, 0.7284996 ],
│ │ │ │ + [0.08499312, 0.50255823, 0.02372489],
│ │ │ │ + [0.6917006 , 0.16607437, 0.18782897],
│ │ │ │ + [0.93474716, 0.3432794 , 0.9952016 ],
│ │ │ │ + [0.5984785 , 0.4091289 , 0.55379504],
│ │ │ │ + [0.7263609 , 0.05809404, 0.97646195]], dtype=float32)
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files
│ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile
in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory
. It
│ │ │ │ only supports the rb
mode and does not read files as fast as the C
│ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with
│ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.
│ │ │ │ ├── html2text {}
│ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@
│ │ │ │ │ Out[16]: np.uint64(5)
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N
│ │ │ │ │ Out[17]: np.uint32(9)
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position
│ │ │ │ │ Out[18]:
│ │ │ │ │ -array([[0.2448324 , 0.4248788 , 0.03036282],
│ │ │ │ │ - [0.09682854, 0.5456384 , 0.03632759],
│ │ │ │ │ - [0.05022744, 0.04346096, 0.7365458 ],
│ │ │ │ │ - [0.18079156, 0.7473205 , 0.51275426],
│ │ │ │ │ - [0.7295292 , 0.37780795, 0.9342821 ],
│ │ │ │ │ - [0.805061 , 0.6408879 , 0.67015564],
│ │ │ │ │ - [0.6312153 , 0.35059008, 0.8324852 ],
│ │ │ │ │ - [0.78022105, 0.32808965, 0.18684301],
│ │ │ │ │ - [0.65824497, 0.21917616, 0.61023533]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ +array([[0.8300317 , 0.6433904 , 0.88677955],
│ │ │ │ │ + [0.9174645 , 0.28754658, 0.7540563 ],
│ │ │ │ │ + [0.7841679 , 0.73606324, 0.03237678],
│ │ │ │ │ + [0.07652885, 0.78441316, 0.26030752],
│ │ │ │ │ + [0.6771271 , 0.24711876, 0.89931047],
│ │ │ │ │ + [0.28426662, 0.08380098, 0.07250234],
│ │ │ │ │ + [0.06633534, 0.76704437, 0.22600213],
│ │ │ │ │ + [0.8664561 , 0.89306444, 0.8969469 ],
│ │ │ │ │ + [0.5709988 , 0.11224406, 0.94705933]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file.
│ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e.
│ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ **********
│ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a
│ │ │ │ │ trajectory.
│ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r')
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@
│ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ **********
│ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │ │ Out[25]:
│ │ │ │ │ -array([[0.57121 , 0.731209 , 0.35579365],
│ │ │ │ │ - [0.41756624, 0.9366235 , 0.6583382 ],
│ │ │ │ │ - [0.641247 , 0.1326517 , 0.628977 ],
│ │ │ │ │ - [0.29231876, 0.8117944 , 0.8759391 ],
│ │ │ │ │ - [0.20119959, 0.5564307 , 0.46785906],
│ │ │ │ │ - [0.6268789 , 0.2843572 , 0.11323138],
│ │ │ │ │ - [0.75064737, 0.11587842, 0.03046744]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ +array([[0.5927836 , 0.32609093, 0.04699515],
│ │ │ │ │ + [0.32690832, 0.98091334, 0.7284996 ],
│ │ │ │ │ + [0.08499312, 0.50255823, 0.02372489],
│ │ │ │ │ + [0.6917006 , 0.16607437, 0.18782897],
│ │ │ │ │ + [0.93474716, 0.3432794 , 0.9952016 ],
│ │ │ │ │ + [0.5984785 , 0.4091289 , 0.55379504],
│ │ │ │ │ + [0.7263609 , 0.05809404, 0.97646195]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using
│ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only
│ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation.
│ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO
│ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet.
│ │ │ │ │ Warning
│ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible.
│ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js
│ │ │ │ ├── js-beautify {}
│ │ │ │ │ @@ -1876,183 +1876,183 @@
│ │ │ │ │ "12": "py:property",
│ │ │ │ │ "13": "std:chunk",
│ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption"
│ │ │ │ │ },
│ │ │ │ │ "terms": {
│ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 8, 11, 13, 14, 18, 21],
│ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ - "03036282": 8,
│ │ │ │ │ - "03046744": 8,
│ │ │ │ │ - "03632759": 8,
│ │ │ │ │ - "04346096": 8,
│ │ │ │ │ - "05022744": 8,
│ │ │ │ │ - "09682854": 8,
│ │ │ │ │ + "02372489": 8,
│ │ │ │ │ + "03237678": 8,
│ │ │ │ │ + "04699515": 8,
│ │ │ │ │ + "05809404": 8,
│ │ │ │ │ + "06633534": 8,
│ │ │ │ │ + "07250234": 8,
│ │ │ │ │ + "07652885": 8,
│ │ │ │ │ + "08380098": 8,
│ │ │ │ │ + "08499312": 8,
│ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6,
│ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6,
│ │ │ │ │ "1": [0, 7, 8, 12, 14, 15, 16, 18, 19, 20],
│ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15],
│ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21],
│ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ - "11323138": 8,
│ │ │ │ │ - "11587842": 8,
│ │ │ │ │ + "11224406": 8,
│ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ "127": 1,
│ │ │ │ │ "13": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ - "1326517": 8,
│ │ │ │ │ "13_gsd": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ "14": [7, 8, 11, 14],
│ │ │ │ │ "15": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ "16": [0, 6, 7, 8, 14],
│ │ │ │ │ + "16607437": 8,
│ │ │ │ │ "17": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ "18": [7, 8, 11],
│ │ │ │ │ - "18079156": 8,
│ │ │ │ │ - "18684301": 8,
│ │ │ │ │ + "18782897": 8,
│ │ │ │ │ "19": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ "1d": [14, 16],
│ │ │ │ │ "1x1": [18, 19],
│ │ │ │ │ "2": [0, 7, 8, 11, 12, 14, 15, 16, 18, 19, 20],
│ │ │ │ │ "20": [7, 8],
│ │ │ │ │ "200": [8, 15],
│ │ │ │ │ - "20119959": 8,
│ │ │ │ │ "2016": 12,
│ │ │ │ │ "2019": 11,
│ │ │ │ │ "2022": 11,
│ │ │ │ │ "2025": 12,
│ │ │ │ │ "21": [7, 8],
│ │ │ │ │ - "21917616": 8,
│ │ │ │ │ "22": [7, 8, 11],
│ │ │ │ │ + "22600213": 8,
│ │ │ │ │ "23": [7, 8],
│ │ │ │ │ "235": 1,
│ │ │ │ │ "237": 1,
│ │ │ │ │ "238": 1,
│ │ │ │ │ "24": [7, 8],
│ │ │ │ │ - "2448324": 8,
│ │ │ │ │ + "24711876": 8,
│ │ │ │ │ "249": 1,
│ │ │ │ │ "25": [7, 8],
│ │ │ │ │ "255": 1,
│ │ │ │ │ "256": [0, 6],
│ │ │ │ │ "257": 1,
│ │ │ │ │ "26": [7, 8],
│ │ │ │ │ + "26030752": 8,
│ │ │ │ │ "266": 1,
│ │ │ │ │ "267": 1,
│ │ │ │ │ "27": [7, 8],
│ │ │ │ │ "270": 1,
│ │ │ │ │ "28": [7, 8],
│ │ │ │ │ "283": 1,
│ │ │ │ │ - "2843572": 8,
│ │ │ │ │ + "28426662": 8,
│ │ │ │ │ + "28754658": 8,
│ │ │ │ │ "29": [7, 8],
│ │ │ │ │ - "29231876": 8,
│ │ │ │ │ "2d": [14, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "2gib": 1,
│ │ │ │ │ "3": [7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "30": [7, 8],
│ │ │ │ │ "300": [8, 15],
│ │ │ │ │ "308": 1,
│ │ │ │ │ "31": [7, 8],
│ │ │ │ │ "317": 1,
│ │ │ │ │ "319": 1,
│ │ │ │ │ "32": [0, 6, 7, 18],
│ │ │ │ │ "322": 1,
│ │ │ │ │ "323": 1,
│ │ │ │ │ "324": 1,
│ │ │ │ │ "325": 1,
│ │ │ │ │ - "32808965": 8,
│ │ │ │ │ + "32609093": 8,
│ │ │ │ │ + "32690832": 8,
│ │ │ │ │ "33": 7,
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