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Module dependency graph
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The graph below shows the dependencies between the source code modules, computed from include statements in the code. For documented modules (those that do not have a gray background), clicking on the module takes you to the module documentation. Legend for the graph can be found below the graph.

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The graph below annotates the colors and line styles used in the module dependency graph above. More detailed textual annotation is below the graph.

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Node colors:

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│ │ │ ├── ./usr/share/doc/gromacs/html/manual-2025.2-Debian_2025.2_1.pdf │ │ │ │ ├── pdftotext {} - │ │ │ │ │ @@ -17659,15 +17659,15 @@ │ │ │ │ │ Lindahl, Erik Marklund, Pieter Meulenhoff, Teemu Murtola, Sander Pronk, Alfons Sijbers, Balint Soproni, David │ │ │ │ │ van der Spoel, Peter Tieleman, Carsten Uphoff, Jon Vincent, Teemu Virolainen, Christian Wennberg, Maarten │ │ │ │ │ Wolf, Artem Zhmurov │ │ │ │ │ Project leaders: Berk Hess, Erik Lindahl │ │ │ │ │ © 1991 – 2000: │ │ │ │ │ Department of Biophysical Chemistry, University of Groningen. Nijenborgh 4, 9747 AG Groningen, │ │ │ │ │ The Netherlands. │ │ │ │ │ -© 2001 – 2025: │ │ │ │ │ +© 2001 – 2026: │ │ │ │ │ The GROMACS development teams at the Royal Institute of Technology and Uppsala University, │ │ │ │ │ Sweden. │ │ │ │ │ This manual is not complete and has no pretension to be so, due to lack of time of the contributors – our first │ │ │ │ │ priority is to improve the software. It is worked on continuously, which in some cases might mean the information │ │ │ │ │ is not entirely correct. │ │ │ │ │ Comments on form and content are welcome, please send them to the user discussion forum or the developer │ │ │ │ │ discussion forum (see our webpage or this section on how to contribute (page 596)), or open an issue on our issue │ │ │ ├── ./usr/share/doc/gromacs/html/reference-manual/preface.html │ │ │ │ @@ -4466,15 +4466,15 @@ │ │ │ │ 00011710: 7273 6974 7920 6f66 2047 726f 6e69 6e67 rsity of Groning │ │ │ │ 00011720: 656e 2e0a 4e69 6a65 6e62 6f72 6768 2034 en..Nijenborgh 4 │ │ │ │ 00011730: 2c20 3937 3437 2041 4720 4772 6f6e 696e , 9747 AG Gronin │ │ │ │ 00011740: 6765 6e2c 2054 6865 204e 6574 6865 726c gen, The Netherl │ │ │ │ 00011750: 616e 6473 2e3c 2f70 3e0a 3c2f 6469 763e ands.

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.. 2001 ... 202 │ │ │ │ -00011780: 353a 3c2f 703e 0a3c 626c 6f63 6b71 756f 5:

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The │ │ │ │ 000117a0: 4752 4f4d 4143 5320 6465 7665 6c6f 706d GROMACS developm │ │ │ │ 000117b0: 656e 7420 7465 616d 7320 6174 2074 6865 ent teams at the │ │ │ │ 000117c0: 2052 6f79 616c 2049 6e73 7469 7475 7465 Royal Institute │ │ │ │ 000117d0: 206f 6620 5465 6368 6e6f 6c6f 6779 2061 of Technology a │ │ │ │ 000117e0: 6e64 0a55 7070 7361 6c61 2055 6e69 7665 nd.Uppsala Unive │ │ │ │ 000117f0: 7273 6974 792c 2053 7765 6465 6e2e 3c2f rsity, Sweden.