--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.CT5l5Fu8/b1/python-gsd_3.3.0-1_arm64.changes
+++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.CT5l5Fu8/b2/python-gsd_3.3.0-1_arm64.changes
├── Files
│ @@ -1,4 +1,4 @@
│
│ - aff93649e4fc9a49999e3f629c1d6b3e 130408 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb
│ + e6cf71b7781c2ff048804100b18084b0 130360 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb
│ 7571b6bb7442bb2ca239cd8cff55ea69 342492 debug optional python3-gsd-dbgsym_3.3.0-1_arm64.deb
│ a3bec3a8103389bdc9439a43004e3c64 192160 python optional python3-gsd_3.3.0-1_arm64.deb
├── python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb
│ ├── file list
│ │ @@ -1,3 +1,3 @@
│ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2024-07-05 16:19:20.000000 debian-binary
│ │ -rw-r--r-- 0 0 0 2692 2024-07-05 16:19:20.000000 control.tar.xz
│ │ --rw-r--r-- 0 0 0 127524 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz
│ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 127476 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz
│ ├── control.tar.xz
│ │ ├── control.tar
│ │ │ ├── ./md5sums
│ │ │ │ ├── ./md5sums
│ │ │ │ │┄ Files differ
│ ├── data.tar.xz
│ │ ├── data.tar
│ │ │ ├── file list
│ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23394 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 87526 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95472 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49307 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18756 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107555 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16660 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html
│ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82725 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js
│ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82717 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32666 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20804 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24988 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html
│ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/
│ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd
│ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js
│ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js
│ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html
│ │ │ │ @@ -355,23 +355,23 @@
│ │ │ │ Out[16]: 5
│ │ │ │
│ │ │ │ In [17]: frame.particles.N
│ │ │ │ Out[17]: 9
│ │ │ │
│ │ │ │ In [18]: frame.particles.position
│ │ │ │ Out[18]:
│ │ │ │ -array([[0.12316967, 0.64587235, 0.9128363 ],
│ │ │ │ - [0.8626367 , 0.2235148 , 0.08939774],
│ │ │ │ - [0.22335601, 0.00662065, 0.96929795],
│ │ │ │ - [0.5478874 , 0.35634676, 0.23784144],
│ │ │ │ - [0.49214777, 0.72894174, 0.10864176],
│ │ │ │ - [0.13767935, 0.1610636 , 0.41583046],
│ │ │ │ - [0.07269603, 0.5317239 , 0.26015922],
│ │ │ │ - [0.05673851, 0.57478654, 0.64424783],
│ │ │ │ - [0.34277025, 0.10005342, 0.77304333]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.13345751, 0.42071077, 0.006371 ],
│ │ │ │ + [0.4110003 , 0.01742984, 0.75754243],
│ │ │ │ + [0.7021575 , 0.09851846, 0.7980698 ],
│ │ │ │ + [0.27972424, 0.654219 , 0.9891269 ],
│ │ │ │ + [0.32159486, 0.25689048, 0.8494307 ],
│ │ │ │ + [0.75898737, 0.7241362 , 0.91943383],
│ │ │ │ + [0.67187834, 0.67267716, 0.7775401 ],
│ │ │ │ + [0.726317 , 0.34296808, 0.50930166],
│ │ │ │ + [0.94266546, 0.04818796, 0.6499634 ]], dtype=float32)
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │
gsd.hoomd.HOOMDTrajectory
supports random indexing of frames in the file.
│ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame
.
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ Slicing and selection
│ │ │ │ @@ -398,21 +398,21 @@
│ │ │ │ Pure python reader
│ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │
│ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │
│ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │ Out[25]:
│ │ │ │ -array([[0.44322318, 0.86965847, 0.37274516],
│ │ │ │ - [0.5122337 , 0.17507413, 0.9335558 ],
│ │ │ │ - [0.00896939, 0.3802555 , 0.64956003],
│ │ │ │ - [0.8785142 , 0.83208025, 0.07606622],
│ │ │ │ - [0.73675835, 0.8106642 , 0.2726507 ],
│ │ │ │ - [0.31639966, 0.28040567, 0.9848428 ],
│ │ │ │ - [0.76432866, 0.9874605 , 0.16236402]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.8652545 , 0.16971286, 0.77948165],
│ │ │ │ + [0.24350227, 0.77709574, 0.5015676 ],
│ │ │ │ + [0.7370627 , 0.57237625, 0.6844412 ],
│ │ │ │ + [0.26209536, 0.6595676 , 0.34225166],
│ │ │ │ + [0.26166886, 0.18773468, 0.09318452],
│ │ │ │ + [0.6793225 , 0.19424634, 0.12599196],
│ │ │ │ + [0.9711284 , 0.3186024 , 0.67604005]], dtype=float32)
│ │ │ │
│ │ │ │
│ │ │ │ You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files
│ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile
in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory
. It
│ │ │ │ only supports the rb
mode and does not read files as fast as the C
│ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with
│ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.
│ │ │ │ ├── html2text {}
│ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@
│ │ │ │ │ Out[16]: 5
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N
│ │ │ │ │ Out[17]: 9
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position
│ │ │ │ │ Out[18]:
│ │ │ │ │ -array([[0.12316967, 0.64587235, 0.9128363 ],
│ │ │ │ │ - [0.8626367 , 0.2235148 , 0.08939774],
│ │ │ │ │ - [0.22335601, 0.00662065, 0.96929795],
│ │ │ │ │ - [0.5478874 , 0.35634676, 0.23784144],
│ │ │ │ │ - [0.49214777, 0.72894174, 0.10864176],
│ │ │ │ │ - [0.13767935, 0.1610636 , 0.41583046],
│ │ │ │ │ - [0.07269603, 0.5317239 , 0.26015922],
│ │ │ │ │ - [0.05673851, 0.57478654, 0.64424783],
│ │ │ │ │ - [0.34277025, 0.10005342, 0.77304333]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ +array([[0.13345751, 0.42071077, 0.006371 ],
│ │ │ │ │ + [0.4110003 , 0.01742984, 0.75754243],
│ │ │ │ │ + [0.7021575 , 0.09851846, 0.7980698 ],
│ │ │ │ │ + [0.27972424, 0.654219 , 0.9891269 ],
│ │ │ │ │ + [0.32159486, 0.25689048, 0.8494307 ],
│ │ │ │ │ + [0.75898737, 0.7241362 , 0.91943383],
│ │ │ │ │ + [0.67187834, 0.67267716, 0.7775401 ],
│ │ │ │ │ + [0.726317 , 0.34296808, 0.50930166],
│ │ │ │ │ + [0.94266546, 0.04818796, 0.6499634 ]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file.
│ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e.
│ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ **********
│ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a
│ │ │ │ │ trajectory.
│ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r')
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@
│ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ **********
│ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │ │
│ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │ │ Out[25]:
│ │ │ │ │ -array([[0.44322318, 0.86965847, 0.37274516],
│ │ │ │ │ - [0.5122337 , 0.17507413, 0.9335558 ],
│ │ │ │ │ - [0.00896939, 0.3802555 , 0.64956003],
│ │ │ │ │ - [0.8785142 , 0.83208025, 0.07606622],
│ │ │ │ │ - [0.73675835, 0.8106642 , 0.2726507 ],
│ │ │ │ │ - [0.31639966, 0.28040567, 0.9848428 ],
│ │ │ │ │ - [0.76432866, 0.9874605 , 0.16236402]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ +array([[0.8652545 , 0.16971286, 0.77948165],
│ │ │ │ │ + [0.24350227, 0.77709574, 0.5015676 ],
│ │ │ │ │ + [0.7370627 , 0.57237625, 0.6844412 ],
│ │ │ │ │ + [0.26209536, 0.6595676 , 0.34225166],
│ │ │ │ │ + [0.26166886, 0.18773468, 0.09318452],
│ │ │ │ │ + [0.6793225 , 0.19424634, 0.12599196],
│ │ │ │ │ + [0.9711284 , 0.3186024 , 0.67604005]], dtype=float32)
│ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using
│ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only
│ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation.
│ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO
│ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet.
│ │ │ │ │ Warning
│ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible.
│ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js
│ │ │ │ ├── js-beautify {}
│ │ │ │ │ @@ -1870,189 +1870,189 @@
│ │ │ │ │ "12": "py:property",
│ │ │ │ │ "13": "std:chunk",
│ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption"
│ │ │ │ │ },
│ │ │ │ │ "terms": {
│ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 7, 8, 11, 13, 14, 18, 21],
│ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ - "00662065": 8,
│ │ │ │ │ - "00896939": 8,
│ │ │ │ │ - "05673851": 8,
│ │ │ │ │ - "07269603": 8,
│ │ │ │ │ - "07606622": 8,
│ │ │ │ │ - "08939774": 8,
│ │ │ │ │ + "006371": 8,
│ │ │ │ │ + "01742984": 8,
│ │ │ │ │ + "04818796": 8,
│ │ │ │ │ + "09318452": 8,
│ │ │ │ │ + "09851846": 8,
│ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6,
│ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6,
│ │ │ │ │ "1": [0, 6, 7, 8, 11, 12, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15],
│ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21],
│ │ │ │ │ - "10005342": 8,
│ │ │ │ │ "103": 7,
│ │ │ │ │ "104": 7,
│ │ │ │ │ "105": 7,
│ │ │ │ │ - "10864176": 8,
│ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14, 21],
│ │ │ │ │ "110": 7,
│ │ │ │ │ "114": 7,
│ │ │ │ │ "115": 7,
│ │ │ │ │ "116": 7,
│ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ - "12316967": 8,
│ │ │ │ │ + "12599196": 8,
│ │ │ │ │ "127": 1,
│ │ │ │ │ "12_gsd": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ "13": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ - "13767935": 8,
│ │ │ │ │ + "13345751": 8,
│ │ │ │ │ "14": [7, 8, 11, 14],
│ │ │ │ │ "15": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ "16": [0, 6, 7, 8, 14],
│ │ │ │ │ - "1610636": 8,
│ │ │ │ │ - "16236402": 8,
│ │ │ │ │ + "16971286": 8,
│ │ │ │ │ "17": [7, 8, 14],
│ │ │ │ │ - "17507413": 8,
│ │ │ │ │ "18": [7, 8, 11],
│ │ │ │ │ + "18773468": 8,
│ │ │ │ │ "19": [7, 8, 11, 14],
│ │ │ │ │ + "19424634": 8,
│ │ │ │ │ "1d": [14, 16],
│ │ │ │ │ "1x1": [18, 19],
│ │ │ │ │ "2": [0, 6, 7, 8, 12, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "20": [7, 8],
│ │ │ │ │ "200": [8, 15],
│ │ │ │ │ "2016": 12,
│ │ │ │ │ "2019": 11,
│ │ │ │ │ "2022": 11,
│ │ │ │ │ "2024": 12,
│ │ │ │ │ "21": [7, 8],
│ │ │ │ │ "22": [7, 8, 11],
│ │ │ │ │ - "22335601": 8,
│ │ │ │ │ - "2235148": 8,
│ │ │ │ │ "23": [7, 8],
│ │ │ │ │ "235": 1,
│ │ │ │ │ "237": 1,
│ │ │ │ │ - "23784144": 8,
│ │ │ │ │ "238": 1,
│ │ │ │ │ "24": [7, 8],
│ │ │ │ │ + "24350227": 8,
│ │ │ │ │ "249": 1,
│ │ │ │ │ "25": [7, 8],
│ │ │ │ │ "255": 1,
│ │ │ │ │ "256": [0, 6],
│ │ │ │ │ + "25689048": 8,
│ │ │ │ │ "257": 1,
│ │ │ │ │ "26": [7, 8],
│ │ │ │ │ - "26015922": 8,
│ │ │ │ │ + "26166886": 8,
│ │ │ │ │ + "26209536": 8,
│ │ │ │ │ "266": 1,
│ │ │ │ │ "267": 1,
│ │ │ │ │ "27": [7, 8],
│ │ │ │ │ "270": 1,
│ │ │ │ │ - "2726507": 8,
│ │ │ │ │ + "27972424": 8,
│ │ │ │ │ "28": [7, 8],
│ │ │ │ │ - "28040567": 8,
│ │ │ │ │ "283": 1,
│ │ │ │ │ "29": [7, 8],
│ │ │ │ │ "2d": [14, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "2gib": 1,
│ │ │ │ │ "3": [7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19],
│ │ │ │ │ "30": [7, 8],
│ │ │ │ │ "300": [8, 15],
│ │ │ │ │ "308": 1,
│ │ │ │ │ "31": [7, 8],
│ │ │ │ │ - "31639966": 8,
│ │ │ │ │ "317": 1,
│ │ │ │ │ + "3186024": 8,
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