--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.CT5l5Fu8/b1/python-gsd_3.3.0-1_arm64.changes +++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.CT5l5Fu8/b2/python-gsd_3.3.0-1_arm64.changes ├── Files │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ - aff93649e4fc9a49999e3f629c1d6b3e 130408 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ + e6cf71b7781c2ff048804100b18084b0 130360 doc optional python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ 7571b6bb7442bb2ca239cd8cff55ea69 342492 debug optional python3-gsd-dbgsym_3.3.0-1_arm64.deb │ a3bec3a8103389bdc9439a43004e3c64 192160 python optional python3-gsd_3.3.0-1_arm64.deb ├── python-gsd-doc_3.3.0-1_all.deb │ ├── file list │ │ @@ -1,3 +1,3 @@ │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2024-07-05 16:19:20.000000 debian-binary │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 2692 2024-07-05 16:19:20.000000 control.tar.xz │ │ --rw-r--r-- 0 0 0 127524 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz │ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 127476 2024-07-05 16:19:20.000000 data.tar.xz │ ├── control.tar.xz │ │ ├── control.tar │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ │┄ Files differ │ ├── data.tar.xz │ │ ├── data.tar │ │ │ ├── file list │ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23394 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 87526 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95472 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49307 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18756 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107555 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16660 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html │ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82725 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82717 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32666 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20804 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24988 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html │ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2024-07-05 16:19:20.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html │ │ │ │ @@ -355,23 +355,23 @@ │ │ │ │ Out[16]: 5 │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ Out[17]: 9 │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ -array([[0.12316967, 0.64587235, 0.9128363 ], │ │ │ │ - [0.8626367 , 0.2235148 , 0.08939774], │ │ │ │ - [0.22335601, 0.00662065, 0.96929795], │ │ │ │ - [0.5478874 , 0.35634676, 0.23784144], │ │ │ │ - [0.49214777, 0.72894174, 0.10864176], │ │ │ │ - [0.13767935, 0.1610636 , 0.41583046], │ │ │ │ - [0.07269603, 0.5317239 , 0.26015922], │ │ │ │ - [0.05673851, 0.57478654, 0.64424783], │ │ │ │ - [0.34277025, 0.10005342, 0.77304333]], dtype=float32) │ │ │ │ +array([[0.13345751, 0.42071077, 0.006371 ], │ │ │ │ + [0.4110003 , 0.01742984, 0.75754243], │ │ │ │ + [0.7021575 , 0.09851846, 0.7980698 ], │ │ │ │ + [0.27972424, 0.654219 , 0.9891269 ], │ │ │ │ + [0.32159486, 0.25689048, 0.8494307 ], │ │ │ │ + [0.75898737, 0.7241362 , 0.91943383], │ │ │ │ + [0.67187834, 0.67267716, 0.7775401 ], │ │ │ │ + [0.726317 , 0.34296808, 0.50930166], │ │ │ │ + [0.94266546, 0.04818796, 0.6499634 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │

gsd.hoomd.HOOMDTrajectory supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame.

│ │ │ │ │ │ │ │
│ │ │ │

Slicing and selection

│ │ │ │ @@ -398,21 +398,21 @@ │ │ │ │

Pure python reader

│ │ │ │
In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │  Out[25]: 
│ │ │ │ -array([[0.44322318, 0.86965847, 0.37274516],
│ │ │ │ -       [0.5122337 , 0.17507413, 0.9335558 ],
│ │ │ │ -       [0.00896939, 0.3802555 , 0.64956003],
│ │ │ │ -       [0.8785142 , 0.83208025, 0.07606622],
│ │ │ │ -       [0.73675835, 0.8106642 , 0.2726507 ],
│ │ │ │ -       [0.31639966, 0.28040567, 0.9848428 ],
│ │ │ │ -       [0.76432866, 0.9874605 , 0.16236402]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.8652545 , 0.16971286, 0.77948165],
│ │ │ │ +       [0.24350227, 0.77709574, 0.5015676 ],
│ │ │ │ +       [0.7370627 , 0.57237625, 0.6844412 ],
│ │ │ │ +       [0.26209536, 0.6595676 , 0.34225166],
│ │ │ │ +       [0.26166886, 0.18773468, 0.09318452],
│ │ │ │ +       [0.6793225 , 0.19424634, 0.12599196],
│ │ │ │ +       [0.9711284 , 0.3186024 , 0.67604005]], dtype=float32)
│ │ │ │  
│ │ │ │
│ │ │ │

You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files │ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory. It │ │ │ │ only supports the rb mode and does not read files as fast as the C │ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with │ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.

│ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@ │ │ │ │ │ Out[16]: 5 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ │ Out[17]: 9 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ │ -array([[0.12316967, 0.64587235, 0.9128363 ], │ │ │ │ │ - [0.8626367 , 0.2235148 , 0.08939774], │ │ │ │ │ - [0.22335601, 0.00662065, 0.96929795], │ │ │ │ │ - [0.5478874 , 0.35634676, 0.23784144], │ │ │ │ │ - [0.49214777, 0.72894174, 0.10864176], │ │ │ │ │ - [0.13767935, 0.1610636 , 0.41583046], │ │ │ │ │ - [0.07269603, 0.5317239 , 0.26015922], │ │ │ │ │ - [0.05673851, 0.57478654, 0.64424783], │ │ │ │ │ - [0.34277025, 0.10005342, 0.77304333]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.13345751, 0.42071077, 0.006371 ], │ │ │ │ │ + [0.4110003 , 0.01742984, 0.75754243], │ │ │ │ │ + [0.7021575 , 0.09851846, 0.7980698 ], │ │ │ │ │ + [0.27972424, 0.654219 , 0.9891269 ], │ │ │ │ │ + [0.32159486, 0.25689048, 0.8494307 ], │ │ │ │ │ + [0.75898737, 0.7241362 , 0.91943383], │ │ │ │ │ + [0.67187834, 0.67267716, 0.7775401 ], │ │ │ │ │ + [0.726317 , 0.34296808, 0.50930166], │ │ │ │ │ + [0.94266546, 0.04818796, 0.6499634 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e. │ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ ********** │ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a │ │ │ │ │ trajectory. │ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r') │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@ │ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ ********** │ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb')) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f); │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position │ │ │ │ │ Out[25]: │ │ │ │ │ -array([[0.44322318, 0.86965847, 0.37274516], │ │ │ │ │ - [0.5122337 , 0.17507413, 0.9335558 ], │ │ │ │ │ - [0.00896939, 0.3802555 , 0.64956003], │ │ │ │ │ - [0.8785142 , 0.83208025, 0.07606622], │ │ │ │ │ - [0.73675835, 0.8106642 , 0.2726507 ], │ │ │ │ │ - [0.31639966, 0.28040567, 0.9848428 ], │ │ │ │ │ - [0.76432866, 0.9874605 , 0.16236402]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.8652545 , 0.16971286, 0.77948165], │ │ │ │ │ + [0.24350227, 0.77709574, 0.5015676 ], │ │ │ │ │ + [0.7370627 , 0.57237625, 0.6844412 ], │ │ │ │ │ + [0.26209536, 0.6595676 , 0.34225166], │ │ │ │ │ + [0.26166886, 0.18773468, 0.09318452], │ │ │ │ │ + [0.6793225 , 0.19424634, 0.12599196], │ │ │ │ │ + [0.9711284 , 0.3186024 , 0.67604005]], dtype=float32) │ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only │ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation. │ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO │ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet. │ │ │ │ │ Warning │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible. │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ ├── js-beautify {} │ │ │ │ │ @@ -1870,189 +1870,189 @@ │ │ │ │ │ "12": "py:property", │ │ │ │ │ "13": "std:chunk", │ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption" │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ "terms": { │ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 7, 8, 11, 13, 14, 18, 21], │ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ - "00662065": 8, │ │ │ │ │ - "00896939": 8, │ │ │ │ │ - "05673851": 8, │ │ │ │ │ - "07269603": 8, │ │ │ │ │ - "07606622": 8, │ │ │ │ │ - "08939774": 8, │ │ │ │ │ + "006371": 8, │ │ │ │ │ + "01742984": 8, │ │ │ │ │ + "04818796": 8, │ │ │ │ │ + "09318452": 8, │ │ │ │ │ + "09851846": 8, │ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6, │ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6, │ │ │ │ │ "1": [0, 6, 7, 8, 11, 12, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21], │ │ │ │ │ - "10005342": 8, │ │ │ │ │ "103": 7, │ │ │ │ │ "104": 7, │ │ │ │ │ "105": 7, │ │ │ │ │ - "10864176": 8, │ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14, 21], │ │ │ │ │ "110": 7, │ │ │ │ │ "114": 7, │ │ │ │ │ "115": 7, │ │ │ │ │ "116": 7, │ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ - 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