--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.zwPtSP9v/b1/python-gsd_3.4.2-2_arm64.changes +++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.zwPtSP9v/b2/python-gsd_3.4.2-2_arm64.changes ├── Files │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ - f4303c8a90c220a9cbf4cb0f747f4a42 130584 doc optional python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ + 9f14226f74179614c4862e380ef09f03 130604 doc optional python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ 4789ff7b39ba8ab1e85564d3730a354c 699396 debug optional python3-gsd-dbgsym_3.4.2-2_arm64.deb │ e33608c6f4c5e539c1afb2b893995699 218124 python optional python3-gsd_3.4.2-2_arm64.deb ├── python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ ├── file list │ │ @@ -1,3 +1,3 @@ │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2025-02-13 09:32:12.000000 debian-binary │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 2700 2025-02-13 09:32:12.000000 control.tar.xz │ │ --rw-r--r-- 0 0 0 127692 2025-02-13 09:32:12.000000 data.tar.xz │ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 127712 2025-02-13 09:32:12.000000 data.tar.xz │ ├── control.tar.xz │ │ ├── control.tar │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ │┄ Files differ │ ├── data.tar.xz │ │ ├── data.tar │ │ │ ├── file list │ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23394 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 87525 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95444 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49306 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18756 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107555 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16660 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html │ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82980 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82978 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32666 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20931 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24988 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html │ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc-base/ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html │ │ │ │ @@ -355,23 +355,23 @@ │ │ │ │ Out[16]: np.uint64(5) │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ Out[17]: np.uint32(9) │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ -array([[0.97494966, 0.10634176, 0.6203457 ], │ │ │ │ - [0.29539776, 0.00234806, 0.22667538], │ │ │ │ - [0.6641158 , 0.73922634, 0.74267626], │ │ │ │ - [0.16643669, 0.02652868, 0.6227974 ], │ │ │ │ - [0.68521273, 0.93172663, 0.54958594], │ │ │ │ - [0.7856771 , 0.56165576, 0.0756341 ], │ │ │ │ - [0.06370533, 0.53698397, 0.8206833 ], │ │ │ │ - [0.4116612 , 0.4531208 , 0.8746698 ], │ │ │ │ - [0.70722413, 0.9525089 , 0.41565344]], dtype=float32) │ │ │ │ +array([[0.12146881, 0.33087596, 0.753274 ], │ │ │ │ + [0.61719453, 0.14221686, 0.46614018], │ │ │ │ + [0.915985 , 0.78698945, 0.02110361], │ │ │ │ + [0.12735628, 0.08073799, 0.9106681 ], │ │ │ │ + [0.5150076 , 0.934789 , 0.04066788], │ │ │ │ + [0.7527447 , 0.45875233, 0.01952287], │ │ │ │ + [0.98126715, 0.37712803, 0.42625242], │ │ │ │ + [0.2020261 , 0.8329942 , 0.5559982 ], │ │ │ │ + [0.64297414, 0.5791645 , 0.08674953]], dtype=float32) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │

gsd.hoomd.HOOMDTrajectory supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame.

│ │ │ │ │ │ │ │
│ │ │ │

Slicing and selection

│ │ │ │ @@ -398,21 +398,21 @@ │ │ │ │

Pure python reader

│ │ │ │
In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │  Out[25]: 
│ │ │ │ -array([[0.4982311 , 0.58905643, 0.9760688 ],
│ │ │ │ -       [0.01140458, 0.56144255, 0.15848383],
│ │ │ │ -       [0.5244424 , 0.02714723, 0.11656969],
│ │ │ │ -       [0.67409205, 0.9794036 , 0.20671278],
│ │ │ │ -       [0.31232786, 0.948629  , 0.88299125],
│ │ │ │ -       [0.572064  , 0.2893595 , 0.6806537 ],
│ │ │ │ -       [0.24364088, 0.411466  , 0.08212907]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.9694297 , 0.9121211 , 0.01882476],
│ │ │ │ +       [0.360386  , 0.7577988 , 0.6796943 ],
│ │ │ │ +       [0.5044618 , 0.11502374, 0.3296028 ],
│ │ │ │ +       [0.17759773, 0.9953068 , 0.14918868],
│ │ │ │ +       [0.12499166, 0.4159848 , 0.35105523],
│ │ │ │ +       [0.28119904, 0.38572064, 0.19810611],
│ │ │ │ +       [0.24113949, 0.5761633 , 0.49548864]], dtype=float32)
│ │ │ │  
│ │ │ │
│ │ │ │

You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files │ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory. It │ │ │ │ only supports the rb mode and does not read files as fast as the C │ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with │ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.

│ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@ │ │ │ │ │ Out[16]: np.uint64(5) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ │ Out[17]: np.uint32(9) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ │ -array([[0.97494966, 0.10634176, 0.6203457 ], │ │ │ │ │ - [0.29539776, 0.00234806, 0.22667538], │ │ │ │ │ - [0.6641158 , 0.73922634, 0.74267626], │ │ │ │ │ - [0.16643669, 0.02652868, 0.6227974 ], │ │ │ │ │ - [0.68521273, 0.93172663, 0.54958594], │ │ │ │ │ - [0.7856771 , 0.56165576, 0.0756341 ], │ │ │ │ │ - [0.06370533, 0.53698397, 0.8206833 ], │ │ │ │ │ - [0.4116612 , 0.4531208 , 0.8746698 ], │ │ │ │ │ - [0.70722413, 0.9525089 , 0.41565344]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.12146881, 0.33087596, 0.753274 ], │ │ │ │ │ + [0.61719453, 0.14221686, 0.46614018], │ │ │ │ │ + [0.915985 , 0.78698945, 0.02110361], │ │ │ │ │ + [0.12735628, 0.08073799, 0.9106681 ], │ │ │ │ │ + [0.5150076 , 0.934789 , 0.04066788], │ │ │ │ │ + [0.7527447 , 0.45875233, 0.01952287], │ │ │ │ │ + [0.98126715, 0.37712803, 0.42625242], │ │ │ │ │ + [0.2020261 , 0.8329942 , 0.5559982 ], │ │ │ │ │ + [0.64297414, 0.5791645 , 0.08674953]], dtype=float32) │ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e. │ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ ********** │ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a │ │ │ │ │ trajectory. │ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r') │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@ │ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ ********** │ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb')) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f); │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position │ │ │ │ │ Out[25]: │ │ │ │ │ -array([[0.4982311 , 0.58905643, 0.9760688 ], │ │ │ │ │ - [0.01140458, 0.56144255, 0.15848383], │ │ │ │ │ - [0.5244424 , 0.02714723, 0.11656969], │ │ │ │ │ - [0.67409205, 0.9794036 , 0.20671278], │ │ │ │ │ - [0.31232786, 0.948629 , 0.88299125], │ │ │ │ │ - [0.572064 , 0.2893595 , 0.6806537 ], │ │ │ │ │ - [0.24364088, 0.411466 , 0.08212907]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.9694297 , 0.9121211 , 0.01882476], │ │ │ │ │ + [0.360386 , 0.7577988 , 0.6796943 ], │ │ │ │ │ + [0.5044618 , 0.11502374, 0.3296028 ], │ │ │ │ │ + [0.17759773, 0.9953068 , 0.14918868], │ │ │ │ │ + [0.12499166, 0.4159848 , 0.35105523], │ │ │ │ │ + [0.28119904, 0.38572064, 0.19810611], │ │ │ │ │ + [0.24113949, 0.5761633 , 0.49548864]], dtype=float32) │ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only │ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation. │ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO │ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet. │ │ │ │ │ Warning │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible. │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ ├── js-beautify {} │ │ │ │ │ @@ -1893,177 +1893,177 @@ │ │ │ │ │ "12": "py:property", │ │ │ │ │ "13": "std:chunk", │ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption" │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ "terms": { │ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 8, 11, 13, 14, 18, 21], │ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ - "00234806": 8, │ │ │ │ │ - "01140458": 8, │ │ │ │ │ - "02652868": 8, │ │ │ │ │ - "02714723": 8, │ │ │ │ │ - "06370533": 8, │ │ │ │ │ - "0756341": 8, │ │ │ │ │ - "08212907": 8, │ │ │ │ │ + "01882476": 8, │ │ │ │ │ + "01952287": 8, │ │ │ │ │ + "02110361": 8, │ │ │ │ │ + "04066788": 8, │ │ │ │ │ + "08073799": 8, │ │ │ │ │ + "08674953": 8, │ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6, │ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6, │ │ │ │ │ "1": [0, 7, 8, 12, 14, 15, 16, 18, 19, 20], │ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21], │ │ │ │ │ - "10634176": 8, │ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14, 21], │ │ │ │ │ - "11656969": 8, │ │ │ │ │ + "11502374": 8, │ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ + "12146881": 8, │ │ │ │ │ + "12499166": 8, │ │ │ │ │ "127": 1, │ │ │ │ │ + "12735628": 8, │ │ │ │ │ "13": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "13_gsd": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "14": [7, 8, 11, 14], │ │ │ │ │ + "14221686": 8, │ │ │ │ │ + "14918868": 8, │ │ │ │ │ "15": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ - "15848383": 8, │ │ │ │ │ "16": [0, 6, 7, 8, 14], │ │ │ │ │ - "16643669": 8, │ │ │ │ │ "17": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ + "17759773": 8, │ │ │ │ │ "18": [7, 8, 11], │ │ │ │ │ "19": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ + "19810611": 8, │ │ │ │ │ "1d": [14, 16], │ │ │ │ │ "1x1": [18, 19], │ │ │ │ │ "2": [0, 7, 8, 11, 12, 14, 15, 16, 18, 19, 20], │ │ │ │ │ "20": [7, 8], │ │ │ │ │ "200": [8, 15], │ │ │ │ │ "2016": 12, │ │ │ │ │ "2019": 11, │ │ │ │ │ + "2020261": 8, │ │ │ │ │ "2022": 11, │ │ │ │ │ "2024": 12, │ │ │ │ │ - "20671278": 8, │ │ │ │ │ "21": [7, 8], │ │ │ │ │ "22": [7, 8, 11], │ │ │ │ │ - "22667538": 8, │ │ │ │ │ "23": [7, 8], │ │ │ │ │ "235": 1, │ │ │ │ │ "237": 1, │ │ │ │ │ "238": 1, │ │ │ │ │ "24": [7, 8], │ │ │ │ │ - "24364088": 8, │ │ │ │ │ + "24113949": 8, │ │ │ │ │ "249": 1, │ │ │ │ │ "25": [7, 8], │ │ │ │ │ "255": 1, │ │ │ │ │ "256": [0, 6], │ │ │ │ │ "257": 1, │ │ │ │ │ "26": [7, 8], │ │ │ │ │ "266": 1, │ │ │ │ │ "267": 1, │ │ │ │ │ "27": [7, 8], │ │ │ │ │ "270": 1, │ │ │ │ │ "28": [7, 8], │ │ │ │ │ + "28119904": 8, │ │ │ │ │ "283": 1, │ │ │ │ │ - "2893595": 8, │ │ │ │ │ "29": [7, 8], │ │ │ │ │ - "29539776": 8, │ │ │ │ │ "2d": [14, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ "2gib": 1, │ │ │ │ │ "3": [7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ "30": [7, 8], │ │ │ │ │ "300": [8, 15], │ │ │ │ │ "308": 1, │ │ │ │ │ "31": [7, 8], │ │ │ │ │ - "31232786": 8, │ │ │ │ │ "317": 1, │ │ │ │ │ "319": 1, │ │ │ │ │ "32": [0, 6, 7, 18], │ │ │ │ │ "322": 1, │ │ │ │ │ "323": 1, │ │ │ │ │ "324": 1, │ │ │ │ │ "325": 1, │ │ │ │ │ + "3296028": 8, │ │ │ │ │ "33": 7, │ │ │ │ │ + "33087596": 8, │ │ │ │ │ "34": 7, │ │ │ │ │ "35": 7, │ │ │ │ │ + "35105523": 8, │ │ │ │ │ "36": 7, │ │ │ │ │ + "360386": 8, │ │ │ │ │ "365": 1, │ │ │ │ │ "367": 1, │ │ │ │ │ "37": 7, │ │ │ │ │ "376": 1, │ │ │ │ │ + "37712803": 8, │ │ │ │ │ "38": 7, │ │ │ │ │ + "38572064": 8, │ │ │ │ │ "388": 1, │ │ │ │ │ "39": 7, │ │ │ │ │ "391": 1, │ │ │ │ │ "3d": 20, │ │ │ │ │ "4": [7, 8, 14, 15, 18, 21], │ │ │ │ │ "40": 7, │ │ │ │ │ "400": [8, 15], │ │ │ │ │ "405": 1, │ │ │ │ │ "41": 7, │ │ │ │ │ - "411466": 8, │ │ │ │ │ - "4116612": 8, │ │ │ │ │ - "41565344": 8, │ │ │ │ │ + "4159848": 8, │ │ │ │ │ + "42625242": 8, │ │ │ │ │ "43": 7, │ │ │ │ │ "44": 7, │ │ │ │ │ "45": 7, │ │ │ │ │ - "4531208": 8, │ │ │ │ │ + "45875233": 8, │ │ │ │ │ "46": 7, │ │ │ │ │ + "46614018": 8, │ │ │ │ │ "47": 7, │ │ │ │ │ "48": 7, │ │ │ │ │ "49": 7, │ │ │ │ │ - "4982311": 8, │ │ │ │ │ + "49548864": 8, │ │ │ │ │ "5": [7, 8, 14, 15, 19], │ │ │ │ │ "50": 7, │ │ │ │ │ "500": [8, 15], │ │ │ │ │ + "5044618": 8, │ │ │ │ │ "51": 7, │ │ │ │ │ + "5150076": 8, │ │ │ │ │ "52": 7, │ │ │ │ │ - "5244424": 8, │ │ │ │ │ "53": [0, 7], │ │ │ │ │ - "53698397": 8, │ │ │ │ │ "54": 7, │ │ │ │ │ - "54958594": 8, │ │ │ │ │ "55": 7, │ │ │ │ │ - "56144255": 8, │ │ │ │ │ - "56165576": 8, │ │ │ │ │ - "572064": 8, │ │ │ │ │ - "58905643": 8, │ │ │ │ │ + "5559982": 8, │ │ │ │ │ + "5761633": 8, │ │ │ │ │ + "5791645": 8, │ │ │ │ │ "6": [7, 8, 14, 15], │ │ │ │ │ "600": [8, 15], │ │ │ │ │ - "6203457": 8, │ │ │ │ │ - "6227974": 8, │ │ │ │ │ + "61719453": 8, │ │ │ │ │ "627": 8, │ │ │ │ │ "63": [0, 6], │ │ │ │ │ "64": [0, 6, 11], │ │ │ │ │ + "64297414": 8, │ │ │ │ │ "645": 7, │ │ │ │ │ "65535": 6, │ │ │ │ │ - "6641158": 8, │ │ │ │ │ - "67409205": 8, │ │ │ │ │ - "6806537": 8, │ │ │ │ │ - "68521273": 8, │ │ │ │ │ + "6796943": 8, │ │ │ │ │ "6x1": 18, │ │ │ │ │ "7": [7, 8, 14, 15, 19], │ │ │ │ │ "70": 14, │ │ │ │ │ "700": [8, 15], │ │ │ │ │ - "70722413": 8, │ │ │ │ │ - "73922634": 8, │ │ │ │ │ - "74267626": 8, │ │ │ │ │ + "7527447": 8, │ │ │ │ │ + "753274": 8, │ │ │ │ │ + "7577988": 8, │ │ │ │ │ "758": 14, │ │ │ │ │ "771": 14, │ │ │ │ │ "785": 8, │ │ │ │ │ - "7856771": 8, │ │ │ │ │ "786": 8, │ │ │ │ │ + "78698945": 8, │ │ │ │ │ "787": 8, │ │ │ │ │ "789": 8, │ │ │ │ │ "8": [0, 6, 7, 8, 14, 15, 18, 19], │ │ │ │ │ "80": [6, 14, 21], │ │ │ │ │ "800": [8, 15], │ │ │ │ │ - "8206833": 8, │ │ │ │ │ - "8746698": 8, │ │ │ │ │ - "88299125": 8, │ │ │ │ │ + "8329942": 8, │ │ │ │ │ "9": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "90": 14, │ │ │ │ │ "900": [8, 15], │ │ │ │ │ - "93172663": 8, │ │ │ │ │ - "948629": 8, │ │ │ │ │ - "9525089": 8, │ │ │ │ │ - "97494966": 8, │ │ │ │ │ - "9760688": 8, │ │ │ │ │ - "9794036": 8, │ │ │ │ │ + "9106681": 8, │ │ │ │ │ + "9121211": 8, │ │ │ │ │ + "915985": 8, │ │ │ │ │ + "934789": 8, │ │ │ │ │ + "9694297": 8, │ │ │ │ │ + "98126715": 8, │ │ │ │ │ + "9953068": 8, │ │ │ │ │ "A": [0, 5, 6, 8, 9, 12, 18, 19], │ │ │ │ │ "AND": 12, │ │ │ │ │ "AS": 12, │ │ │ │ │ "As": 15, │ │ │ │ │ "BE": 12, │ │ │ │ │ "BUT": 12, │ │ │ │ │ "BY": 12,