--- /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.HA2hgo5s/b1/python-gsd_3.4.2-2_i386.changes +++ /srv/reproducible-results/rbuild-debian/r-b-build.HA2hgo5s/b2/python-gsd_3.4.2-2_i386.changes ├── Files │ @@ -1,4 +1,4 @@ │ │ - a15cd11c31e369329e361c192ef781f7 130596 doc optional python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ + b3584c90b94809588094997d58effbee 130568 doc optional python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ b03411724db65d3570fe496dadd9c96f 687436 debug optional python3-gsd-dbgsym_3.4.2-2_i386.deb │ 729c80094d28c1558da5f6debb1125aa 237704 python optional python3-gsd_3.4.2-2_i386.deb ├── python-gsd-doc_3.4.2-2_all.deb │ ├── file list │ │ @@ -1,3 +1,3 @@ │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 4 2025-02-13 09:32:12.000000 debian-binary │ │ -rw-r--r-- 0 0 0 2700 2025-02-13 09:32:12.000000 control.tar.xz │ │ --rw-r--r-- 0 0 0 127704 2025-02-13 09:32:12.000000 data.tar.xz │ │ +-rw-r--r-- 0 0 0 127676 2025-02-13 09:32:12.000000 data.tar.xz │ ├── control.tar.xz │ │ ├── control.tar │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ ├── ./md5sums │ │ │ │ │┄ Files differ │ ├── data.tar.xz │ │ ├── data.tar │ │ │ ├── file list │ │ │ │ @@ -71,15 +71,15 @@ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 23394 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-api.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 87525 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.fl.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 95444 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 49306 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.pygsd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 18756 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/python-module-gsd.version.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 107555 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/schema-hoomd.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 16660 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/search.html │ │ │ │ --rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82979 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ +-rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 82980 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 32666 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/shapes.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 20931 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/specification.html │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 24988 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/style.html │ │ │ │ drwxr-xr-x 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc-base/ │ │ │ │ -rw-r--r-- 0 root (0) root (0) 331 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc-base/python-gsd-doc.python-gsd │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/doctools.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/doctools.js │ │ │ │ lrwxrwxrwx 0 root (0) root (0) 0 2025-02-13 09:32:12.000000 ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/_static/language_data.js -> ../../../../javascript/sphinxdoc/1.0/language_data.js │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/hoomd-examples.html │ │ │ │ @@ -355,23 +355,23 @@ │ │ │ │ Out[16]: np.uint64(5) │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ Out[17]: np.uint32(9) │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ -array([[0.4123692 , 0.69574815, 0.7767962 ], │ │ │ │ - [0.26737106, 0.25902492, 0.42512208], │ │ │ │ - [0.7943765 , 0.49429697, 0.61867416], │ │ │ │ - [0.84307003, 0.6791098 , 0.3594299 ], │ │ │ │ - [0.52521664, 0.80897075, 0.16132158], │ │ │ │ - [0.37815017, 0.51720166, 0.9843401 ], │ │ │ │ - [0.37681502, 0.14976847, 0.6149963 ], │ │ │ │ - [0.3455346 , 0.11830968, 0.72472495], │ │ │ │ - [0.7562354 , 0.09042371, 0.9617478 ]], dtype=float32) │ │ │ │ +array([[0.60919744, 0.94693375, 0.42471802], │ │ │ │ + [0.41097042, 0.23355684, 0.94994766], │ │ │ │ + [0.78269154, 0.01335376, 0.61965394], │ │ │ │ + [0.12661535, 0.8312703 , 0.8301611 ], │ │ │ │ + [0.24158382, 0.9433453 , 0.81000894], │ │ │ │ + [0.72714716, 0.00394834, 0.3986141 ], │ │ │ │ + [0.9851779 , 0.8445048 , 0.62762123], │ │ │ │ + [0.73786247, 0.24997196, 0.9519371 ], │ │ │ │ + [0.3411991 , 0.9568856 , 0.20801212]], dtype=float32) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │

gsd.hoomd.HOOMDTrajectory supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a gsd.hoomd.Frame.

│ │ │ │ │ │ │ │
│ │ │ │

Slicing and selection

│ │ │ │ @@ -398,21 +398,21 @@ │ │ │ │

Pure python reader

│ │ │ │
In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb'))
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f);
│ │ │ │  
│ │ │ │  In [25]: trajectory[3].particles.position
│ │ │ │  Out[25]: 
│ │ │ │ -array([[0.2433684 , 0.1995935 , 0.10321329],
│ │ │ │ -       [0.5455287 , 0.2947632 , 0.61673594],
│ │ │ │ -       [0.47003114, 0.1067265 , 0.65945655],
│ │ │ │ -       [0.8713121 , 0.7293742 , 0.45098072],
│ │ │ │ -       [0.43565452, 0.7408555 , 0.34020287],
│ │ │ │ -       [0.60877997, 0.970383  , 0.3259656 ],
│ │ │ │ -       [0.3763888 , 0.7431791 , 0.27808467]], dtype=float32)
│ │ │ │ +array([[0.37933293, 0.6108526 , 0.62475497],
│ │ │ │ +       [0.55347687, 0.26317596, 0.12352356],
│ │ │ │ +       [0.09232485, 0.5584721 , 0.6136809 ],
│ │ │ │ +       [0.28462407, 0.34485   , 0.9677967 ],
│ │ │ │ +       [0.4284878 , 0.283918  , 0.8482275 ],
│ │ │ │ +       [0.04234144, 0.99790263, 0.6589163 ],
│ │ │ │ +       [0.3028175 , 0.07036121, 0.78807384]], dtype=float32)
│ │ │ │  
│ │ │ │
│ │ │ │

You can use GSD without needing to compile C code to read GSD files │ │ │ │ using gsd.pygsd.GSDFile in combination with gsd.hoomd.HOOMDTrajectory. It │ │ │ │ only supports the rb mode and does not read files as fast as the C │ │ │ │ implementation. It takes in a python file-like object, so it can be used with │ │ │ │ in-memory IO classes, and grid file classes that access data over the internet.

│ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -95,23 +95,23 @@ │ │ │ │ │ Out[16]: np.uint64(5) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [17]: frame.particles.N │ │ │ │ │ Out[17]: np.uint32(9) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [18]: frame.particles.position │ │ │ │ │ Out[18]: │ │ │ │ │ -array([[0.4123692 , 0.69574815, 0.7767962 ], │ │ │ │ │ - [0.26737106, 0.25902492, 0.42512208], │ │ │ │ │ - [0.7943765 , 0.49429697, 0.61867416], │ │ │ │ │ - [0.84307003, 0.6791098 , 0.3594299 ], │ │ │ │ │ - [0.52521664, 0.80897075, 0.16132158], │ │ │ │ │ - [0.37815017, 0.51720166, 0.9843401 ], │ │ │ │ │ - [0.37681502, 0.14976847, 0.6149963 ], │ │ │ │ │ - [0.3455346 , 0.11830968, 0.72472495], │ │ │ │ │ - [0.7562354 , 0.09042371, 0.9617478 ]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.60919744, 0.94693375, 0.42471802], │ │ │ │ │ + [0.41097042, 0.23355684, 0.94994766], │ │ │ │ │ + [0.78269154, 0.01335376, 0.61965394], │ │ │ │ │ + [0.12661535, 0.8312703 , 0.8301611 ], │ │ │ │ │ + [0.24158382, 0.9433453 , 0.81000894], │ │ │ │ │ + [0.72714716, 0.00394834, 0.3986141 ], │ │ │ │ │ + [0.9851779 , 0.8445048 , 0.62762123], │ │ │ │ │ + [0.73786247, 0.24997196, 0.9519371 ], │ │ │ │ │ + [0.3411991 , 0.9568856 , 0.20801212]], dtype=float32) │ │ │ │ │ _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y supports random indexing of frames in the file. │ │ │ │ │ Indexing into a trajectory returns a _g_s_d_._h_o_o_m_d_._F_r_a_m_e. │ │ │ │ │ ********** SSlliicciinngg aanndd sseelleeccttiioonn_?¶ ********** │ │ │ │ │ Use the slicing operator to select individual frames or a subset of a │ │ │ │ │ trajectory. │ │ │ │ │ In [19]: f = gsd.hoomd.open(name='example.gsd', mode='r') │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ @@ -130,21 +130,21 @@ │ │ │ │ │ ********** PPuurree ppyytthhoonn rreeaaddeerr_?¶ ********** │ │ │ │ │ In [23]: f = gsd.pygsd.GSDFile(open('example.gsd', 'rb')) │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [24]: trajectory = gsd.hoomd.HOOMDTrajectory(f); │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ In [25]: trajectory[3].particles.position │ │ │ │ │ Out[25]: │ │ │ │ │ -array([[0.2433684 , 0.1995935 , 0.10321329], │ │ │ │ │ - [0.5455287 , 0.2947632 , 0.61673594], │ │ │ │ │ - [0.47003114, 0.1067265 , 0.65945655], │ │ │ │ │ - [0.8713121 , 0.7293742 , 0.45098072], │ │ │ │ │ - [0.43565452, 0.7408555 , 0.34020287], │ │ │ │ │ - [0.60877997, 0.970383 , 0.3259656 ], │ │ │ │ │ - [0.3763888 , 0.7431791 , 0.27808467]], dtype=float32) │ │ │ │ │ +array([[0.37933293, 0.6108526 , 0.62475497], │ │ │ │ │ + [0.55347687, 0.26317596, 0.12352356], │ │ │ │ │ + [0.09232485, 0.5584721 , 0.6136809 ], │ │ │ │ │ + [0.28462407, 0.34485 , 0.9677967 ], │ │ │ │ │ + [0.4284878 , 0.283918 , 0.8482275 ], │ │ │ │ │ + [0.04234144, 0.99790263, 0.6589163 ], │ │ │ │ │ + [0.3028175 , 0.07036121, 0.78807384]], dtype=float32) │ │ │ │ │ You can use GGSSDD without needing to compile C code to read GGSSDD files using │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d_._G_S_D_F_i_l_e in combination with _g_s_d_._h_o_o_m_d_._H_O_O_M_D_T_r_a_j_e_c_t_o_r_y. It only │ │ │ │ │ supports the rb mode and does not read files as fast as the C implementation. │ │ │ │ │ It takes in a python file-like object, so it can be used with in-memory IO │ │ │ │ │ classes, and grid file classes that access data over the internet. │ │ │ │ │ Warning │ │ │ │ │ _g_s_d_._p_y_g_s_d is ssllooww. Use _g_s_d_._h_o_o_m_d_._o_p_e_n whenever possible. │ │ │ ├── ./usr/share/doc/python-gsd-doc/html/searchindex.js │ │ │ │ ├── js-beautify {} │ │ │ │ │ @@ -1893,177 +1893,177 @@ │ │ │ │ │ "12": "py:property", │ │ │ │ │ "13": "std:chunk", │ │ │ │ │ "14": "std:cmdoption" │ │ │ │ │ }, │ │ │ │ │ "terms": { │ │ │ │ │ "": [1, 2, 3, 8, 11, 13, 14, 18, 21], │ │ │ │ │ "0": [0, 6, 7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ - "09042371": 8, │ │ │ │ │ + "00394834": 8, │ │ │ │ │ + "01335376": 8, │ │ │ │ │ + "04234144": 8, │ │ │ │ │ + "07036121": 8, │ │ │ │ │ + "09232485": 8, │ │ │ │ │ "0x65df65df65df65df": 6, │ │ │ │ │ "0xaaaabbbb": 6, │ │ │ │ │ "1": [0, 7, 8, 12, 14, 15, 16, 18, 19, 20], │ │ │ │ │ "10": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "100": [8, 15, 21], │ │ │ │ │ - "10321329": 8, │ │ │ │ │ - "1067265": 8, │ │ │ │ │ "11": [7, 8, 14, 21], │ │ │ │ │ - "11830968": 8, │ │ │ │ │ "12": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ + "12352356": 8, │ │ │ │ │ + "12661535": 8, │ │ │ │ │ "127": 1, │ │ │ │ │ "13": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "13_gsd": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "14": [7, 8, 11, 14], │ │ │ │ │ - "14976847": 8, │ │ │ │ │ "15": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "16": [0, 6, 7, 8, 14], │ │ │ │ │ - "16132158": 8, │ │ │ │ │ "17": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ "18": [7, 8, 11], │ │ │ │ │ "19": [7, 8, 14], │ │ │ │ │ - "1995935": 8, │ │ │ │ │ "1d": [14, 16], │ │ │ │ │ "1x1": [18, 19], │ │ │ │ │ "2": [0, 7, 8, 11, 12, 14, 15, 16, 18, 19, 20], │ │ │ │ │ "20": [7, 8], │ │ │ │ │ "200": [8, 15], │ │ │ │ │ "2016": 12, │ │ │ │ │ "2019": 11, │ │ │ │ │ "2022": 11, │ │ │ │ │ "2024": 12, │ │ │ │ │ + "20801212": 8, │ │ │ │ │ "21": [7, 8], │ │ │ │ │ "22": [7, 8, 11], │ │ │ │ │ "23": [7, 8], │ │ │ │ │ + "23355684": 8, │ │ │ │ │ "235": 1, │ │ │ │ │ "237": 1, │ │ │ │ │ "238": 1, │ │ │ │ │ "24": [7, 8], │ │ │ │ │ - "2433684": 8, │ │ │ │ │ + "24158382": 8, │ │ │ │ │ "249": 1, │ │ │ │ │ + "24997196": 8, │ │ │ │ │ "25": [7, 8], │ │ │ │ │ "255": 1, │ │ │ │ │ "256": [0, 6], │ │ │ │ │ "257": 1, │ │ │ │ │ - "25902492": 8, │ │ │ │ │ "26": [7, 8], │ │ │ │ │ + "26317596": 8, │ │ │ │ │ "266": 1, │ │ │ │ │ "267": 1, │ │ │ │ │ - "26737106": 8, │ │ │ │ │ "27": [7, 8], │ │ │ │ │ "270": 1, │ │ │ │ │ - "27808467": 8, │ │ │ │ │ "28": [7, 8], │ │ │ │ │ "283": 1, │ │ │ │ │ + "283918": 8, │ │ │ │ │ + "28462407": 8, │ │ │ │ │ "29": [7, 8], │ │ │ │ │ - "2947632": 8, │ │ │ │ │ "2d": [14, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ "2gib": 1, │ │ │ │ │ "3": [7, 8, 11, 14, 15, 16, 18, 19], │ │ │ │ │ "30": [7, 8], │ │ │ │ │ "300": [8, 15], │ │ │ │ │ + "3028175": 8, │ │ │ │ │ "308": 1, │ │ │ │ │ "31": [7, 8], │ │ │ │ │ "317": 1, │ │ │ │ │ "319": 1, │ │ │ │ │ "32": [0, 6, 7, 18], │ │ │ │ │ "322": 1, │ │ │ │ │ "323": 1, │ │ │ │ │ "324": 1, │ │ │ │ │ "325": 1, │ │ │ │ │ - "3259656": 8, │ │ │ │ │ "33": 7, │ │ │ │ │ "34": 7, │ │ │ │ │ - "34020287": 8, │ │ │ │ │ - "3455346": 8, │ │ │ │ │ + "3411991": 8, │ │ │ │ │ + "34485": 8, │ │ │ │ │ "35": 7, │ │ │ │ │ - "3594299": 8, │ │ │ │ │ "36": 7, │ │ │ │ │ "365": 1, │ │ │ │ │ "367": 1, │ │ │ │ │ "37": 7, │ │ │ │ │ "376": 1, │ │ │ │ │ - "3763888": 8, │ │ │ │ │ - "37681502": 8, │ │ │ │ │ - "37815017": 8, │ │ │ │ │ + "37933293": 8, │ │ │ │ │ "38": 7, │ │ │ │ │ "388": 1, │ │ │ │ │ "39": 7, │ │ │ │ │ "391": 1, │ │ │ │ │ + "3986141": 8, │ │ │ │ │ "3d": 20, │ │ │ │ │ "4": [7, 8, 14, 15, 18, 21], │ │ │ │ │ "40": 7, │ │ │ │ │ "400": [8, 15], │ │ │ │ │ "405": 1, │ │ │ │ │ "41": 7, │ │ │ │ │ - "4123692": 8, │ │ │ │ │ - "42512208": 8, │ │ │ │ │ + "41097042": 8, │ │ │ │ │ + "42471802": 8, │ │ │ │ │ + "4284878": 8, │ │ │ │ │ "43": 7, │ │ │ │ │ - "43565452": 8, │ │ │ │ │ "44": 7, │ │ │ │ │ "45": 7, │ │ │ │ │ - "45098072": 8, │ │ │ │ │ "46": 7, │ │ │ │ │ "47": 7, │ │ │ │ │ - "47003114": 8, │ │ │ │ │ "48": 7, │ │ │ │ │ "49": 7, │ │ │ │ │ - "49429697": 8, │ │ │ │ │ "5": [7, 8, 14, 15, 19], │ │ │ │ │ "50": 7, │ │ │ │ │ "500": [8, 15], │ │ │ │ │ "51": 7, │ │ │ │ │ - "51720166": 8, │ │ │ │ │ "52": 7, │ │ │ │ │ - "52521664": 8, │ │ │ │ │ "53": [0, 7], │ │ │ │ │ "54": 7, │ │ │ │ │ - "5455287": 8, │ │ │ │ │ "55": 7, │ │ │ │ │ + "55347687": 8, │ │ │ │ │ + "5584721": 8, │ │ │ │ │ "6": [7, 8, 14, 15], │ │ │ │ │ "600": [8, 15], │ │ │ │ │ - "60877997": 8, │ │ │ │ │ - "6149963": 8, │ │ │ │ │ - "61673594": 8, │ │ │ │ │ - "61867416": 8, │ │ │ │ │ + "60919744": 8, │ │ │ │ │ + "6108526": 8, │ │ │ │ │ + "6136809": 8, │ │ │ │ │ + "61965394": 8, │ │ │ │ │ + "62475497": 8, │ │ │ │ │ "627": 8, │ │ │ │ │ + "62762123": 8, │ │ │ │ │ "63": [0, 6], │ │ │ │ │ "64": [0, 6, 11], │ │ │ │ │ "645": 7, │ │ │ │ │ "65535": 6, │ │ │ │ │ - "65945655": 8, │ │ │ │ │ - "6791098": 8, │ │ │ │ │ - "69574815": 8, │ │ │ │ │ + "6589163": 8, │ │ │ │ │ "6x1": 18, │ │ │ │ │ "7": [7, 8, 14, 15, 19], │ │ │ │ │ "70": 14, │ │ │ │ │ "700": [8, 15], │ │ │ │ │ - "72472495": 8, │ │ │ │ │ - "7293742": 8, │ │ │ │ │ - "7408555": 8, │ │ │ │ │ - "7431791": 8, │ │ │ │ │ - "7562354": 8, │ │ │ │ │ + "72714716": 8, │ │ │ │ │ + "73786247": 8, │ │ │ │ │ "758": 14, │ │ │ │ │ "771": 14, │ │ │ │ │ - "7767962": 8, │ │ │ │ │ + "78269154": 8, │ │ │ │ │ "785": 8, │ │ │ │ │ "786": 8, │ │ │ │ │ "787": 8, │ │ │ │ │ + "78807384": 8, │ │ │ │ │ "789": 8, │ │ │ │ │ - "7943765": 8, │ │ │ │ │ "8": [0, 6, 7, 8, 14, 15, 18, 19], │ │ │ │ │ "80": [6, 14, 21], │ │ │ │ │ "800": [8, 15], │ │ │ │ │ - "80897075": 8, │ │ │ │ │ - "84307003": 8, │ │ │ │ │ - "8713121": 8, │ │ │ │ │ + "81000894": 8, │ │ │ │ │ + "8301611": 8, │ │ │ │ │ + "8312703": 8, │ │ │ │ │ + "8445048": 8, │ │ │ │ │ + "8482275": 8, │ │ │ │ │ "9": [7, 8, 11, 14, 15], │ │ │ │ │ "90": 14, │ │ │ │ │ "900": [8, 15], │ │ │ │ │ - "9617478": 8, │ │ │ │ │ - "970383": 8, │ │ │ │ │ - "9843401": 8, │ │ │ │ │ + "9433453": 8, │ │ │ │ │ + "94693375": 8, │ │ │ │ │ + "94994766": 8, │ │ │ │ │ + "9519371": 8, │ │ │ │ │ + "9568856": 8, │ │ │ │ │ + "9677967": 8, │ │ │ │ │ + "9851779": 8, │ │ │ │ │ + "99790263": 8, │ │ │ │ │ "A": [0, 5, 6, 8, 9, 12, 18, 19], │ │ │ │ │ "AND": 12, │ │ │ │ │ "AS": 12, │ │ │ │ │ "As": 15, │ │ │ │ │ "BE": 12, │ │ │ │ │ "BUT": 12, │ │ │ │ │ "BY": 12,